RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619059.4

FAM13C-218, Transcript of family with sequence similarity 13 member C, humanhuman

TSL 4

Gene FAM13C, Length 596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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