RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616894.1

ATRNL1-210, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATRNL1, Length 1,701 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-210ENST00000616894 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.16■■■■■ 6.58
ATRNL1-210ENST00000616894 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.92■■■■■ 5.58
ATRNL1-210ENST00000616894 ABCC9O60706 1549 aa48.91■■■■■ 5.42
ATRNL1-210ENST00000616894 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
ATRNL1-210ENST00000616894 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.98■■■■■ 5.11
ATRNL1-210ENST00000616894 NACADO15069 1562 aa46.91■■■■■ 5.1
ATRNL1-210ENST00000616894 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
ATRNL1-210ENST00000616894 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.58■■■■■ 5.05
ATRNL1-210ENST00000616894 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.4■■■■■ 5.02
ATRNL1-210ENST00000616894 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.04■■■■■ 4.96
ATRNL1-210ENST00000616894 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.72■■■■■ 4.91
ATRNL1-210ENST00000616894 SCRIBQ14160 1630 aa45.63■■■■■ 4.9
ATRNL1-210ENST00000616894 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.62■■■■■ 4.89
ATRNL1-210ENST00000616894 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45■■■■■ 4.79
ATRNL1-210ENST00000616894 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.9■■■■■ 4.78
ATRNL1-210ENST00000616894 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
ATRNL1-210ENST00000616894 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.24■■■■■ 4.67
ATRNL1-210ENST00000616894 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.91■■■■■ 4.62
ATRNL1-210ENST00000616894 SMARCA4P51532 1647 aa43.61■■■■■ 4.57
ATRNL1-210ENST00000616894 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
ATRNL1-210ENST00000616894 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.34■■■■■ 4.53
ATRNL1-210ENST00000616894 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.33■■■■■ 4.53
ATRNL1-210ENST00000616894 NCAPD3P42695 1498 aa43.28■■■■■ 4.52
ATRNL1-210ENST00000616894 SMARCA2P51531 1590 aa43.27■■■■■ 4.52
ATRNL1-210ENST00000616894 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.13■■■■■ 4.49
ATRNL1-210ENST00000616894 HMGXB3Q12766 1538 aa43.08■■■■■ 4.49
ATRNL1-210ENST00000616894 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
ATRNL1-210ENST00000616894 WIZO95785 1651 aa42.89■■■■■ 4.46
ATRNL1-210ENST00000616894 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
ATRNL1-210ENST00000616894 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
ATRNL1-210ENST00000616894 NESP48681 1621 aa42.35■■■■■ 4.37
ATRNL1-210ENST00000616894 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.16■■■■■ 4.34
ATRNL1-210ENST00000616894 ERCC6Q03468 1493 aa42.12■■■■■ 4.33
ATRNL1-210ENST00000616894 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.03■■■■■ 4.32
ATRNL1-210ENST00000616894 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.89■■■■■ 4.3
ATRNL1-210ENST00000616894 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.86■■■■■ 4.29
ATRNL1-210ENST00000616894 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.86■■■■■ 4.29
ATRNL1-210ENST00000616894 CFTRP13569 1480 aa41.79■■■■■ 4.28
ATRNL1-210ENST00000616894 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
ATRNL1-210ENST00000616894 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
ATRNL1-210ENST00000616894 CUX2O14529 1486 aa41.62■■■■■ 4.25
ATRNL1-210ENST00000616894 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.58■■■■■ 4.25
ATRNL1-210ENST00000616894 PRDM2Q13029 1718 aa41.54■■■■■ 4.24
ATRNL1-210ENST00000616894 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.52■■■■■ 4.24
ATRNL1-210ENST00000616894 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.45■■■■■ 4.23
ATRNL1-210ENST00000616894 WDR62O43379 1518 aa41.33■■■■■ 4.21
ATRNL1-210ENST00000616894 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
ATRNL1-210ENST00000616894 TOPBP1Q92547 1522 aa40.93■■■■■ 4.14
ATRNL1-210ENST00000616894 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.87■■■■■ 4.13
ATRNL1-210ENST00000616894 ABCC8Q09428 1581 aa40.84■■■■■ 4.13
ATRNL1-210ENST00000616894 CUX1P39880 1505 aa40.64■■■■■ 4.1
ATRNL1-210ENST00000616894 IFT140Q96RY7 1462 aa40.63■■■■■ 4.09
ATRNL1-210ENST00000616894 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
ATRNL1-210ENST00000616894 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
ATRNL1-210ENST00000616894 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
ATRNL1-210ENST00000616894 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.49■■■■■ 4.07
ATRNL1-210ENST00000616894 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.44■■■■■ 4.06
ATRNL1-210ENST00000616894 SOGA1O94964 1423 aa40.39■■■■■ 4.06
ATRNL1-210ENST00000616894 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.36■■■■■ 4.05
ATRNL1-210ENST00000616894 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
ATRNL1-210ENST00000616894 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
ATRNL1-210ENST00000616894 SYNJ1O43426 1573 aa40.3■■■■■ 4.04
ATRNL1-210ENST00000616894 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
ATRNL1-210ENST00000616894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.28■■■■■ 4.04
ATRNL1-210ENST00000616894 TOP2BQ02880 1626 aa40.27■■■■■ 4.04
ATRNL1-210ENST00000616894 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
ATRNL1-210ENST00000616894 WDR97A6NE52 1622 aa40.18■■■■■ 4.02
ATRNL1-210ENST00000616894 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.07■■■■■ 4
ATRNL1-210ENST00000616894 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.94■■■■□ 3.98
ATRNL1-210ENST00000616894 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.94■■■■□ 3.98
ATRNL1-210ENST00000616894 OSCARQ8IYS5 282 aa39.91■■■■□ 3.98
ATRNL1-210ENST00000616894 PBRM1Q86U86 1689 aa39.91■■■■□ 3.98
ATRNL1-210ENST00000616894 GRIN2BQ13224 1484 aa39.91■■■■□ 3.98
ATRNL1-210ENST00000616894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.9■■■■□ 3.98
ATRNL1-210ENST00000616894 CHD1O14646 1710 aa39.88■■■■□ 3.97
ATRNL1-210ENST00000616894 FBLN2P98095 1184 aa39.8■■■■□ 3.96
ATRNL1-210ENST00000616894 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
ATRNL1-210ENST00000616894 SYNJ2O15056 1496 aa39.66■■■■□ 3.94
ATRNL1-210ENST00000616894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
ATRNL1-210ENST00000616894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.58■■■■□ 3.93
ATRNL1-210ENST00000616894 ADAMTS12P58397 1594 aa39.56■■■■□ 3.92
ATRNL1-210ENST00000616894 KIF27Q86VH2 1401 aa39.48■■■■□ 3.91
ATRNL1-210ENST00000616894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.45■■■■□ 3.91
ATRNL1-210ENST00000616894 GRIN2AQ12879 1464 aa39.42■■■■□ 3.9
ATRNL1-210ENST00000616894 TRIM41Q8WV44 630 aa39.4■■■■□ 3.9
ATRNL1-210ENST00000616894 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.39■■■■□ 3.9
ATRNL1-210ENST00000616894 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.35■■■■□ 3.89
ATRNL1-210ENST00000616894 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.35■■■■□ 3.89
ATRNL1-210ENST00000616894 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.35■■■■□ 3.89
ATRNL1-210ENST00000616894 IGF1RP08069 1367 aa39.33■■■■□ 3.89
ATRNL1-210ENST00000616894 ARHGEF11O15085 1522 aa39.32■■■■□ 3.89
ATRNL1-210ENST00000616894 CEP170Q5SW79 1584 aa39.26■■■■□ 3.88
ATRNL1-210ENST00000616894 CUL7Q14999 1698 aa39.24■■■■□ 3.87
ATRNL1-210ENST00000616894 NUP160Q12769 1436 aa39.22■■■■□ 3.87
ATRNL1-210ENST00000616894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.22■■■■□ 3.87
ATRNL1-210ENST00000616894 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.1■■■■□ 3.85
ATRNL1-210ENST00000616894 ARAP1Q96P48 1450 aa39.01■■■■□ 3.84
ATRNL1-210ENST00000616894 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.96■■■■□ 3.83
ATRNL1-210ENST00000616894 SHROOM2Q13796 1616 aa38.95■■■■□ 3.83
ATRNL1-210ENST00000616894 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.94■■■■□ 3.82
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