RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614394.1

DDB2-207, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene DDB2, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-207ENST00000614394 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
DDB2-207ENST00000614394 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.78■■■□□ 2.68
DDB2-207ENST00000614394 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.53■■■□□ 2.64
DDB2-207ENST00000614394 ABCC9O60706 1549 aa29.36■■■□□ 2.29
DDB2-207ENST00000614394 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.83■■■□□ 2.21
DDB2-207ENST00000614394 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.07■■■□□ 2.08
DDB2-207ENST00000614394 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.74■■■□□ 2.03
DDB2-207ENST00000614394 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
DDB2-207ENST00000614394 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
DDB2-207ENST00000614394 NACADO15069 1562 aa27.4■■□□□ 1.98
DDB2-207ENST00000614394 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
DDB2-207ENST00000614394 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.05■■□□□ 1.92
DDB2-207ENST00000614394 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.03■■□□□ 1.92
DDB2-207ENST00000614394 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.92■■□□□ 1.9
DDB2-207ENST00000614394 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.85■■□□□ 1.89
DDB2-207ENST00000614394 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.61■■□□□ 1.85
DDB2-207ENST00000614394 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.55■■□□□ 1.84
DDB2-207ENST00000614394 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.51■■□□□ 1.83
DDB2-207ENST00000614394 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
DDB2-207ENST00000614394 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.31■■□□□ 1.8
DDB2-207ENST00000614394 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.27■■□□□ 1.8
DDB2-207ENST00000614394 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
DDB2-207ENST00000614394 SCRIBQ14160 1630 aa26.16■■□□□ 1.78
DDB2-207ENST00000614394 CUX2O14529 1486 aa25.65■■□□□ 1.7
DDB2-207ENST00000614394 FOXD1Q16676 465 aa25.55■■□□□ 1.68
DDB2-207ENST00000614394 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.54■■□□□ 1.68
DDB2-207ENST00000614394 ERCC6Q03468 1493 aa25.44■■□□□ 1.66
DDB2-207ENST00000614394 NCAPD3P42695 1498 aa25.3■■□□□ 1.64
DDB2-207ENST00000614394 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.1■■□□□ 1.61
DDB2-207ENST00000614394 HMGXB3Q12766 1538 aa25.07■■□□□ 1.6
DDB2-207ENST00000614394 SMARCA2P51531 1590 aa25.04■■□□□ 1.6
DDB2-207ENST00000614394 NESP48681 1621 aa25.04■■□□□ 1.6
DDB2-207ENST00000614394 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
DDB2-207ENST00000614394 SMARCA4P51532 1647 aa24.93■■□□□ 1.58
DDB2-207ENST00000614394 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.84■■□□□ 1.57
DDB2-207ENST00000614394 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
DDB2-207ENST00000614394 TRIM41Q8WV44 630 aa24.84■■□□□ 1.57
DDB2-207ENST00000614394 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
DDB2-207ENST00000614394 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.73■■□□□ 1.55
DDB2-207ENST00000614394 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.72■■□□□ 1.55
DDB2-207ENST00000614394 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.72■■□□□ 1.55
DDB2-207ENST00000614394 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.52■■□□□ 1.52
DDB2-207ENST00000614394 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.5■■□□□ 1.51
DDB2-207ENST00000614394 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.49■■□□□ 1.51
DDB2-207ENST00000614394 WDR62O43379 1518 aa24.49■■□□□ 1.51
DDB2-207ENST00000614394 ADRA2BP18089 450 aa24.46■■□□□ 1.51
DDB2-207ENST00000614394 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.45■■□□□ 1.5
DDB2-207ENST00000614394 OSCARQ8IYS5 282 aa24.33■■□□□ 1.49
DDB2-207ENST00000614394 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.3■■□□□ 1.48
DDB2-207ENST00000614394 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.2■■□□□ 1.47
DDB2-207ENST00000614394 WIZO95785 1651 aa24.11■■□□□ 1.45
DDB2-207ENST00000614394 CFTRP13569 1480 aa24.08■■□□□ 1.45
DDB2-207ENST00000614394 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.07■■□□□ 1.44
DDB2-207ENST00000614394 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.07■■□□□ 1.44
DDB2-207ENST00000614394 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.07■■□□□ 1.44
DDB2-207ENST00000614394 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
DDB2-207ENST00000614394 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
DDB2-207ENST00000614394 ARHGEF11O15085 1522 aa23.94■■□□□ 1.42
DDB2-207ENST00000614394 IFT140Q96RY7 1462 aa23.85■■□□□ 1.41
DDB2-207ENST00000614394 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
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DDB2-207ENST00000614394 PRDM2Q13029 1718 aa23.79■■□□□ 1.4
DDB2-207ENST00000614394 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.77■■□□□ 1.4
DDB2-207ENST00000614394 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
DDB2-207ENST00000614394 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
DDB2-207ENST00000614394 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
DDB2-207ENST00000614394 TOPBP1Q92547 1522 aa23.67■■□□□ 1.38
DDB2-207ENST00000614394 ARAP1Q96P48 1450 aa23.65■■□□□ 1.38
DDB2-207ENST00000614394 ABCC8Q09428 1581 aa23.63■■□□□ 1.37
DDB2-207ENST00000614394 MSH5O43196 834 aa23.61■■□□□ 1.37
DDB2-207ENST00000614394 CHD1O14646 1710 aa23.61■■□□□ 1.37
DDB2-207ENST00000614394 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.54■■□□□ 1.36
DDB2-207ENST00000614394 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.363e-9■■■■□ 25.5
DDB2-207ENST00000614394 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.52■■□□□ 1.36
DDB2-207ENST00000614394 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
DDB2-207ENST00000614394 FBLN2P98095 1184 aa23.49■■□□□ 1.35
DDB2-207ENST00000614394 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
DDB2-207ENST00000614394 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.35■■□□□ 1.33
DDB2-207ENST00000614394 SYNJ1O43426 1573 aa23.3■■□□□ 1.32
DDB2-207ENST00000614394 WDR97A6NE52 1622 aa23.3■■□□□ 1.32
DDB2-207ENST00000614394 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.29■■□□□ 1.32
DDB2-207ENST00000614394 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
DDB2-207ENST00000614394 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.28■■□□□ 1.32
DDB2-207ENST00000614394 SOGA1O94964 1423 aa23.26■■□□□ 1.31
DDB2-207ENST00000614394 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
DDB2-207ENST00000614394 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
DDB2-207ENST00000614394 SYNJ2O15056 1496 aa23.17■■□□□ 1.3
DDB2-207ENST00000614394 GRIN2BQ13224 1484 aa23.16■■□□□ 1.3
DDB2-207ENST00000614394 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.15■■□□□ 1.3
DDB2-207ENST00000614394 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.14■■□□□ 1.29
DDB2-207ENST00000614394 CUX1P39880 1505 aa23.01■■□□□ 1.27
DDB2-207ENST00000614394 PBRM1Q86U86 1689 aa23■■□□□ 1.27
DDB2-207ENST00000614394 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB2-207ENST00000614394 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB2-207ENST00000614394 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB2-207ENST00000614394 GRIN2AQ12879 1464 aa22.85■■□□□ 1.25
DDB2-207ENST00000614394 CEP170Q5SW79 1584 aa22.84■■□□□ 1.25
DDB2-207ENST00000614394 NUP160Q12769 1436 aa22.81■■□□□ 1.24
DDB2-207ENST00000614394 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.8■■□□□ 1.24
DDB2-207ENST00000614394 SHROOM2Q13796 1616 aa22.79■■□□□ 1.24
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