RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613811.4

RAPGEFL1-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEFL1, Length 1,744 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.42■■■■■ 9.02
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RAPGEFL1-211ENST00000613811 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.89■■■■■ 7.18
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ABCC9O60706 1549 aa59.79■■■■■ 7.16
RAPGEFL1-211ENST00000613811 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.08■■■■■ 7.05
RAPGEFL1-211ENST00000613811 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.03■■■■■ 7.04
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.64■■■■■ 6.98
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NACADO15069 1562 aa58.5■■■■■ 6.96
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.17■■■■■ 6.9
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.67■■■■■ 6.82
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SCRIBQ14160 1630 aa57.52■■■■■ 6.8
RAPGEFL1-211ENST00000613811 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.13■■■■■ 6.74
RAPGEFL1-211ENST00000613811 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.47■■■■■ 6.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.17■■■■■ 6.58
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.53■■■■■ 6.48
RAPGEFL1-211ENST00000613811 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.22■■■■■ 6.43
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.16■■■■■ 6.42
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SMARCA4P51532 1647 aa55.11■■■■■ 6.41
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55.1■■■■■ 6.41
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP55.09■■■■■ 6.41
RAPGEFL1-211ENST00000613811 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.8■■■■■ 6.36
RAPGEFL1-211ENST00000613811 WIZO95785 1651 aa54.72■■■■■ 6.35
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.47■■■■■ 6.31
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.3■■■■■ 6.28
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SMARCA2P51531 1590 aa54.28■■■■■ 6.28
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.17■■■■■ 6.26
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.11■■■■■ 6.25
RAPGEFL1-211ENST00000613811 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.96■■■■■ 6.23
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NCAPD3P42695 1498 aa53.94■■■■■ 6.23
RAPGEFL1-211ENST00000613811 HMGXB3Q12766 1538 aa53.88■■■■■ 6.22
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.5■■■■■ 6.15
RAPGEFL1-211ENST00000613811 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.31■■■■■ 6.13
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CFTRP13569 1480 aa52.56■■■■■ 6.01
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.48■■■■■ 5.99
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PRDM2Q13029 1718 aa52.45■■■■■ 5.99
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CHIC1Q5VXU3 224 aa52.4■■■■■ 5.98
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NESP48681 1621 aa52.3■■■■■ 5.96
RAPGEFL1-211ENST00000613811 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.29■■■■■ 5.96
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ABCC8Q09428 1581 aa52.19■■■■■ 5.94
RAPGEFL1-211ENST00000613811 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.94■■■■■ 5.9
RAPGEFL1-211ENST00000613811 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.87■■■■■ 5.89
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TRIM41Q8WV44 630 aa51.85■■■■■ 5.89
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.82■■■■■ 5.89
RAPGEFL1-211ENST00000613811 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.79■■■■■ 5.88
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SYNJ1O43426 1573 aa51.78■■■■■ 5.88
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.69■■■■■ 5.87
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CUX1P39880 1505 aa51.63■■■■■ 5.86
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TOP2BQ02880 1626 aa51.62■■■■■ 5.85
RAPGEFL1-211ENST00000613811 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.62■■■■■ 5.85
RAPGEFL1-211ENST00000613811 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.4■■■■■ 5.82
RAPGEFL1-211ENST00000613811 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.37■■■■■ 5.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TOPBP1Q92547 1522 aa51.33■■■■■ 5.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ERCC6Q03468 1493 aa51.32■■■■■ 5.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.24■■■■■ 5.79
RAPGEFL1-211ENST00000613811 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.16■■■■■ 5.78
RAPGEFL1-211ENST00000613811 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.1■■■■■ 5.77
RAPGEFL1-211ENST00000613811 WDR62O43379 1518 aa51.04■■■■■ 5.76
RAPGEFL1-211ENST00000613811 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.02■■■■■ 5.76
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SOGA1O94964 1423 aa50.99■■■■■ 5.75
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.88■■■■■ 5.74
RAPGEFL1-211ENST00000613811 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.87■■■■■ 5.73
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.82■■■■■ 5.73
RAPGEFL1-211ENST00000613811 EEA1Q15075 1411 aa50.75■■■■■ 5.71
RAPGEFL1-211ENST00000613811 WDR97A6NE52 1622 aa50.72■■■■■ 5.71
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.69■■■■■ 5.7
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CUX2O14529 1486 aa50.68■■■■■ 5.7
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.67■■■■■ 5.7
RAPGEFL1-211ENST00000613811 KIF27Q86VH2 1401 aa50.61■■■■■ 5.69
RAPGEFL1-211ENST00000613811 IFT140Q96RY7 1462 aa50.49■■■■■ 5.67
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CSRNP3Q8WYN3 585 aa50.48■■■■■ 5.67
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.41■■■■■ 5.66
RAPGEFL1-211ENST00000613811 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa50.34■■■■■ 5.65
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.34■■■■■ 5.65
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.25■■■■■ 5.64
RAPGEFL1-211ENST00000613811 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.25■■■■■ 5.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 KIF21BO75037 1637 aa50.22■■■■■ 5.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 IGF1RP08069 1367 aa50.22■■■■■ 5.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 EHMT2Q96KQ7 1210 aa50.17■■■■■ 5.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.17■■■■■ 5.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PBRM1Q86U86 1689 aa50.16■■■■■ 5.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.15■■■■■ 5.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PRXQ9BXM0 1461 aa50.13■■■■■ 5.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.1■■■■■ 5.61
RAPGEFL1-211ENST00000613811 GOLGA3Q08378 1498 aa50.04■■■■■ 5.6
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CUL7Q14999 1698 aa50.03■■■■■ 5.6
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa50.01■■■■■ 5.6
RAPGEFL1-211ENST00000613811 GRIN2BQ13224 1484 aa49.96■■■■■ 5.59
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.96■■■■■ 5.59
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ADAMTS12P58397 1594 aa49.79■■■■■ 5.56
RAPGEFL1-211ENST00000613811 UBTFP17480 764 aaKnown RBP49.74■■■■■ 5.55
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.73■■■■■ 5.55
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.71■■■■■ 5.55
RAPGEFL1-211ENST00000613811 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.68■■■■■ 5.54
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.64■■■■■ 5.54
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SYNJ2O15056 1496 aa49.45■■■■■ 5.51
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa49.43■■■■■ 5.5
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CEP162Q5TB80 1403 aa49.42■■■■■ 5.5
RAPGEFL1-211ENST00000613811 GRIN2AQ12879 1464 aa49.37■■■■■ 5.49
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.26■■■■■ 5.48
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CHD1O14646 1710 aa49.24■■■■■ 5.47
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