RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613769.4

MRPS31P4-202, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S31 pseudogene 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene MRPS31P4, Length 583 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS31P4-202ENST00000613769 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.48■■■□□ 2.63
MRPS31P4-202ENST00000613769 ABCC9O60706 1549 aa28.68■■■□□ 2.18
MRPS31P4-202ENST00000613769 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.26■■■□□ 2.11
MRPS31P4-202ENST00000613769 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.3■■□□□ 1.96
MRPS31P4-202ENST00000613769 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPS31P4-202ENST00000613769 NACADO15069 1562 aa26.8■■□□□ 1.88
MRPS31P4-202ENST00000613769 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
MRPS31P4-202ENST00000613769 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.68■■□□□ 1.86
MRPS31P4-202ENST00000613769 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.53■■□□□ 1.84
MRPS31P4-202ENST00000613769 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.43■■□□□ 1.82
MRPS31P4-202ENST00000613769 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.34■■□□□ 1.81
MRPS31P4-202ENST00000613769 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
MRPS31P4-202ENST00000613769 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
MRPS31P4-202ENST00000613769 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.92■■□□□ 1.74
MRPS31P4-202ENST00000613769 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.85■■□□□ 1.73
MRPS31P4-202ENST00000613769 SCRIBQ14160 1630 aa25.85■■□□□ 1.73
MRPS31P4-202ENST00000613769 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.83■■□□□ 1.73
MRPS31P4-202ENST00000613769 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.82■■□□□ 1.72
MRPS31P4-202ENST00000613769 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
MRPS31P4-202ENST00000613769 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.11■■□□□ 1.61
MRPS31P4-202ENST00000613769 NCAPD3P42695 1498 aa24.82■■□□□ 1.56
MRPS31P4-202ENST00000613769 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.72■■□□□ 1.55
MRPS31P4-202ENST00000613769 CUX2O14529 1486 aa24.71■■□□□ 1.55
MRPS31P4-202ENST00000613769 ERCC6Q03468 1493 aa24.67■■□□□ 1.54
MRPS31P4-202ENST00000613769 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.64■■□□□ 1.54
MRPS31P4-202ENST00000613769 NESP48681 1621 aa24.61■■□□□ 1.53
MRPS31P4-202ENST00000613769 SMARCA4P51532 1647 aa24.6■■□□□ 1.53
MRPS31P4-202ENST00000613769 HMGXB3Q12766 1538 aa24.56■■□□□ 1.52
MRPS31P4-202ENST00000613769 SMARCA2P51531 1590 aa24.54■■□□□ 1.52
MRPS31P4-202ENST00000613769 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
MRPS31P4-202ENST00000613769 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
MRPS31P4-202ENST00000613769 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.35■■□□□ 1.49
MRPS31P4-202ENST00000613769 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
MRPS31P4-202ENST00000613769 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.32■■□□□ 1.48
MRPS31P4-202ENST00000613769 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.22■■□□□ 1.47
MRPS31P4-202ENST00000613769 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.2■■□□□ 1.46
MRPS31P4-202ENST00000613769 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.09■■□□□ 1.45
MRPS31P4-202ENST00000613769 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.03■■□□□ 1.44
MRPS31P4-202ENST00000613769 WIZO95785 1651 aa23.99■■□□□ 1.43
MRPS31P4-202ENST00000613769 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.94■■□□□ 1.42
MRPS31P4-202ENST00000613769 WDR62O43379 1518 aa23.92■■□□□ 1.42
MRPS31P4-202ENST00000613769 TRIM41Q8WV44 630 aa23.89■■□□□ 1.41
MRPS31P4-202ENST00000613769 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.77■■□□□ 1.4
MRPS31P4-202ENST00000613769 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.77■■□□□ 1.4
MRPS31P4-202ENST00000613769 CFTRP13569 1480 aa23.72■■□□□ 1.39
MRPS31P4-202ENST00000613769 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
MRPS31P4-202ENST00000613769 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
MRPS31P4-202ENST00000613769 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
MRPS31P4-202ENST00000613769 OSCARQ8IYS5 282 aa23.56■■□□□ 1.36
MRPS31P4-202ENST00000613769 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
MRPS31P4-202ENST00000613769 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.4■■□□□ 1.34
MRPS31P4-202ENST00000613769 PRDM2Q13029 1718 aa23.35■■□□□ 1.33
MRPS31P4-202ENST00000613769 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.34■■□□□ 1.33
MRPS31P4-202ENST00000613769 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.34■■□□□ 1.33
MRPS31P4-202ENST00000613769 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.34■■□□□ 1.33
MRPS31P4-202ENST00000613769 IFT140Q96RY7 1462 aa23.31■■□□□ 1.32
MRPS31P4-202ENST00000613769 TOPBP1Q92547 1522 aa23.31■■□□□ 1.32
MRPS31P4-202ENST00000613769 ARHGEF11O15085 1522 aa23.24■■□□□ 1.31
MRPS31P4-202ENST00000613769 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
MRPS31P4-202ENST00000613769 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
MRPS31P4-202ENST00000613769 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.14■■□□□ 1.3
MRPS31P4-202ENST00000613769 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
MRPS31P4-202ENST00000613769 ABCC8Q09428 1581 aa23.1■■□□□ 1.29
MRPS31P4-202ENST00000613769 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.09■■□□□ 1.29
MRPS31P4-202ENST00000613769 CHD1O14646 1710 aa23.07■■□□□ 1.28
MRPS31P4-202ENST00000613769 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
MRPS31P4-202ENST00000613769 ARAP1Q96P48 1450 aa23.04■■□□□ 1.28
MRPS31P4-202ENST00000613769 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.04■■□□□ 1.28
MRPS31P4-202ENST00000613769 FBLN2P98095 1184 aa22.99■■□□□ 1.27
MRPS31P4-202ENST00000613769 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
MRPS31P4-202ENST00000613769 SOGA1O94964 1423 aa22.91■■□□□ 1.26
MRPS31P4-202ENST00000613769 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.87■■□□□ 1.25
MRPS31P4-202ENST00000613769 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.87■■□□□ 1.25
MRPS31P4-202ENST00000613769 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MRPS31P4-202ENST00000613769 CUX1P39880 1505 aa22.85■■□□□ 1.25
MRPS31P4-202ENST00000613769 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.84■■□□□ 1.25
MRPS31P4-202ENST00000613769 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
MRPS31P4-202ENST00000613769 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
MRPS31P4-202ENST00000613769 WDR97A6NE52 1622 aa22.72■■□□□ 1.23
MRPS31P4-202ENST00000613769 GRIN2BQ13224 1484 aa22.72■■□□□ 1.23
MRPS31P4-202ENST00000613769 SYNJ1O43426 1573 aa22.69■■□□□ 1.22
MRPS31P4-202ENST00000613769 SYNJ2O15056 1496 aa22.69■■□□□ 1.22
MRPS31P4-202ENST00000613769 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.62■■□□□ 1.21
MRPS31P4-202ENST00000613769 PBRM1Q86U86 1689 aa22.61■■□□□ 1.21
MRPS31P4-202ENST00000613769 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.57■■□□□ 1.2
MRPS31P4-202ENST00000613769 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.57■■□□□ 1.2
MRPS31P4-202ENST00000613769 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.56■■□□□ 1.2
MRPS31P4-202ENST00000613769 GRIN2AQ12879 1464 aa22.46■■□□□ 1.19
MRPS31P4-202ENST00000613769 CEP170Q5SW79 1584 aa22.44■■□□□ 1.18
MRPS31P4-202ENST00000613769 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
MRPS31P4-202ENST00000613769 ADAMTS12P58397 1594 aa22.42■■□□□ 1.18
MRPS31P4-202ENST00000613769 NUP160Q12769 1436 aa22.41■■□□□ 1.18
MRPS31P4-202ENST00000613769 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
MRPS31P4-202ENST00000613769 TOP2BQ02880 1626 aa22.33■■□□□ 1.17
MRPS31P4-202ENST00000613769 SHROOM2Q13796 1616 aa22.33■■□□□ 1.17
MRPS31P4-202ENST00000613769 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.33■■□□□ 1.17
MRPS31P4-202ENST00000613769 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.31■■□□□ 1.16
MRPS31P4-202ENST00000613769 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
MRPS31P4-202ENST00000613769 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.24■■□□□ 1.15
MRPS31P4-202ENST00000613769 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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