RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.21■■■■■ 4.51
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STX4-217ENST00000613541 NACADO15069 1562 aa36.98■■■■□ 3.51
STX4-217ENST00000613541 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.7■■■■□ 3.47
STX4-217ENST00000613541 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.52■■■■□ 3.44
STX4-217ENST00000613541 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.37■■■■□ 3.41
STX4-217ENST00000613541 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.32■■■■□ 3.4
STX4-217ENST00000613541 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.1■■■■□ 3.37
STX4-217ENST00000613541 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.78■■■■□ 3.32
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STX4-217ENST00000613541 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.47■■■■□ 3.27
STX4-217ENST00000613541 SCRIBQ14160 1630 aa35.39■■■■□ 3.26
STX4-217ENST00000613541 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
STX4-217ENST00000613541 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.54■■■■□ 3.12
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STX4-217ENST00000613541 NCAPD3P42695 1498 aa34.13■■■■□ 3.05
STX4-217ENST00000613541 ERCC6Q03468 1493 aa34.04■■■■□ 3.04
STX4-217ENST00000613541 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.92■■■■□ 3.02
STX4-217ENST00000613541 SMARCA2P51531 1590 aa33.87■■■■□ 3.01
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STX4-217ENST00000613541 SMARCA4P51532 1647 aa33.76■■■■□ 3
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STX4-217ENST00000613541 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.47■■■□□ 2.95
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STX4-217ENST00000613541 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.22■■■□□ 2.91
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STX4-217ENST00000613541 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.96■■■□□ 2.87
STX4-217ENST00000613541 WDR62O43379 1518 aa32.86■■■□□ 2.85
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STX4-217ENST00000613541 WIZO95785 1651 aa32.8■■■□□ 2.84
STX4-217ENST00000613541 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.75■■■□□ 2.83
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STX4-217ENST00000613541 CFTRP13569 1480 aa32.59■■■□□ 2.81
STX4-217ENST00000613541 OSCARQ8IYS5 282 aa32.55■■■□□ 2.8
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STX4-217ENST00000613541 IFT140Q96RY7 1462 aa32.15■■■□□ 2.74
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STX4-217ENST00000613541 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.02■■■□□ 2.72
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STX4-217ENST00000613541 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.96■■■□□ 2.55
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STX4-217ENST00000613541 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.67■■■□□ 2.5
STX4-217ENST00000613541 SHROOM2Q13796 1616 aa30.66■■■□□ 2.5
STX4-217ENST00000613541 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.66■■■□□ 2.5
STX4-217ENST00000613541 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
STX4-217ENST00000613541 JPH4Q96JJ6 628 aa30.53■■■□□ 2.48
STX4-217ENST00000613541 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
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