RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607547.2

U3.45-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 219 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.45-201ENST00000607547 NISCHQ9Y2I1 1504 aa9.2□□□□□ -0.94
U3.45-201ENST00000607547 ABCC9O60706 1549 aa8.51□□□□□ -1.05
U3.45-201ENST00000607547 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.43□□□□□ -1.06
U3.45-201ENST00000607547 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.1□□□□□ -1.11
U3.45-201ENST00000607547 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8□□□□□ -1.13
U3.45-201ENST00000607547 NACADO15069 1562 aa7.97□□□□□ -1.13
U3.45-201ENST00000607547 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.92□□□□□ -1.14
U3.45-201ENST00000607547 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
U3.45-201ENST00000607547 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.82□□□□□ -1.16
U3.45-201ENST00000607547 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.78□□□□□ -1.16
U3.45-201ENST00000607547 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.78□□□□□ -1.16
U3.45-201ENST00000607547 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.75□□□□□ -1.17
U3.45-201ENST00000607547 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.7□□□□□ -1.18
U3.45-201ENST00000607547 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.69□□□□□ -1.18
U3.45-201ENST00000607547 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
U3.45-201ENST00000607547 SCRIBQ14160 1630 aa7.63□□□□□ -1.19
U3.45-201ENST00000607547 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.61□□□□□ -1.19
U3.45-201ENST00000607547 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
U3.45-201ENST00000607547 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.54□□□□□ -1.2
U3.45-201ENST00000607547 CUX2O14529 1486 aa7.45□□□□□ -1.22
U3.45-201ENST00000607547 ERCC6Q03468 1493 aa7.42□□□□□ -1.22
U3.45-201ENST00000607547 HMGXB3Q12766 1538 aa7.3□□□□□ -1.24
U3.45-201ENST00000607547 NCAPD3P42695 1498 aa7.3□□□□□ -1.24
U3.45-201ENST00000607547 SMARCA2P51531 1590 aa7.29□□□□□ -1.24
U3.45-201ENST00000607547 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
U3.45-201ENST00000607547 SMARCA4P51532 1647 aa7.26□□□□□ -1.25
U3.45-201ENST00000607547 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.25□□□□□ -1.25
U3.45-201ENST00000607547 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.24□□□□□ -1.25
U3.45-201ENST00000607547 NESP48681 1621 aa7.23□□□□□ -1.25
U3.45-201ENST00000607547 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
U3.45-201ENST00000607547 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.22□□□□□ -1.25
U3.45-201ENST00000607547 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
U3.45-201ENST00000607547 TRIM41Q8WV44 630 aa7.19□□□□□ -1.26
U3.45-201ENST00000607547 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.18□□□□□ -1.26
U3.45-201ENST00000607547 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.16□□□□□ -1.26
U3.45-201ENST00000607547 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.13□□□□□ -1.27
U3.45-201ENST00000607547 WDR62O43379 1518 aa7.11□□□□□ -1.27
U3.45-201ENST00000607547 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.08□□□□□ -1.28
U3.45-201ENST00000607547 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.07□□□□□ -1.28
U3.45-201ENST00000607547 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.07□□□□□ -1.28
U3.45-201ENST00000607547 PRDM2Q13029 1718 aa7.02□□□□□ -1.29
U3.45-201ENST00000607547 OSCARQ8IYS5 282 aa7.02□□□□□ -1.29
U3.45-201ENST00000607547 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.02□□□□□ -1.29
U3.45-201ENST00000607547 WIZO95785 1651 aa7.01□□□□□ -1.29
U3.45-201ENST00000607547 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.01□□□□□ -1.29
U3.45-201ENST00000607547 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.01□□□□□ -1.29
U3.45-201ENST00000607547 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.01□□□□□ -1.29
U3.45-201ENST00000607547 CFTRP13569 1480 aa6.96□□□□□ -1.3
U3.45-201ENST00000607547 ARHGEF11O15085 1522 aa6.95□□□□□ -1.3
U3.45-201ENST00000607547 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
U3.45-201ENST00000607547 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
U3.45-201ENST00000607547 IFT140Q96RY7 1462 aa6.92□□□□□ -1.3
U3.45-201ENST00000607547 CHD1O14646 1710 aa6.92□□□□□ -1.3
U3.45-201ENST00000607547 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
U3.45-201ENST00000607547 TRHP20396 242 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
U3.45-201ENST00000607547 ABCC8Q09428 1581 aa6.87□□□□□ -1.31
U3.45-201ENST00000607547 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
U3.45-201ENST00000607547 TOPBP1Q92547 1522 aa6.86□□□□□ -1.31
U3.45-201ENST00000607547 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.86□□□□□ -1.31
U3.45-201ENST00000607547 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.45-201ENST00000607547 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.45-201ENST00000607547 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.45-201ENST00000607547 ARAP1Q96P48 1450 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.45-201ENST00000607547 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
U3.45-201ENST00000607547 WDR97A6NE52 1622 aa6.82□□□□□ -1.32
U3.45-201ENST00000607547 SYNJ1O43426 1573 aa6.82□□□□□ -1.32
U3.45-201ENST00000607547 FBLN2P98095 1184 aa6.81□□□□□ -1.32
U3.45-201ENST00000607547 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.79□□□□□ -1.32
U3.45-201ENST00000607547 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
U3.45-201ENST00000607547 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.78□□□□□ -1.32
U3.45-201ENST00000607547 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
U3.45-201ENST00000607547 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.77□□□□□ -1.33
U3.45-201ENST00000607547 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
U3.45-201ENST00000607547 PBRM1Q86U86 1689 aa6.76□□□□□ -1.33
U3.45-201ENST00000607547 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
U3.45-201ENST00000607547 SOGA1O94964 1423 aa6.73□□□□□ -1.33
U3.45-201ENST00000607547 GRIN2BQ13224 1484 aa6.73□□□□□ -1.33
U3.45-201ENST00000607547 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.73□□□□□ -1.33
U3.45-201ENST00000607547 SYNJ2O15056 1496 aa6.72□□□□□ -1.33
U3.45-201ENST00000607547 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.72□□□□□ -1.33
U3.45-201ENST00000607547 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.71□□□□□ -1.34
U3.45-201ENST00000607547 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
U3.45-201ENST00000607547 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.67□□□□□ -1.34
U3.45-201ENST00000607547 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.66□□□□□ -1.34
U3.45-201ENST00000607547 CUX1P39880 1505 aa6.66□□□□□ -1.34
U3.45-201ENST00000607547 ADAMTS12P58397 1594 aa6.65□□□□□ -1.35
U3.45-201ENST00000607547 GRIN2AQ12879 1464 aa6.64□□□□□ -1.35
U3.45-201ENST00000607547 CEP170Q5SW79 1584 aa6.64□□□□□ -1.35
U3.45-201ENST00000607547 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.63□□□□□ -1.35
U3.45-201ENST00000607547 SHROOM2Q13796 1616 aa6.62□□□□□ -1.35
U3.45-201ENST00000607547 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.62□□□□□ -1.35
U3.45-201ENST00000607547 NUP160Q12769 1436 aa6.59□□□□□ -1.35
U3.45-201ENST00000607547 KDM6BO15054 1643 aa6.59□□□□□ -1.35
U3.45-201ENST00000607547 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.58□□□□□ -1.36
U3.45-201ENST00000607547 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
U3.45-201ENST00000607547 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.58□□□□□ -1.36
U3.45-201ENST00000607547 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.57□□□□□ -1.36
U3.45-201ENST00000607547 TSPOAP1O95153 1857 aa6.57□□□□□ -1.36
U3.45-201ENST00000607547 DIP2BQ9P265 1576 aa6.57□□□□□ -1.36
U3.45-201ENST00000607547 MAPKBP1O60336 1514 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1185.9 ms