RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606884.1

GMDS-AS1-215, humanhuman

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Gene GMDS-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 TOPBP1Q92547 1522 aa15□□□□□ -0.01
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.79□□□□□ -0.04
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 SYNJ2O15056 1496 aa14.72□□□□□ -0.05
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 SOGA1O94964 1423 aa14.69□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GRIN2BQ13224 1484 aa14.69□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.62□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.57□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PBRM1Q86U86 1689 aa14.56□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.55□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CUX1P39880 1505 aa14.53□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CEP170Q5SW79 1584 aa14.52□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SHROOM2Q13796 1616 aa14.52□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.52□□□□□ -0.09
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 GRIN2AQ12879 1464 aa14.5□□□□□ -0.09
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