RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602800.1

PPFIA3-210, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene PPFIA3, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-210ENST00000602800 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.23■■■■■ 5.31
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PPFIA3-210ENST00000602800 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.42■■■■■ 4.22
PPFIA3-210ENST00000602800 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.2■■■■■ 4.19
PPFIA3-210ENST00000602800 NACADO15069 1562 aa41.08■■■■■ 4.17
PPFIA3-210ENST00000602800 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.98■■■■■ 4.15
PPFIA3-210ENST00000602800 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.68■■■■■ 4.1
PPFIA3-210ENST00000602800 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.45■■■■■ 4.07
PPFIA3-210ENST00000602800 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.29■■■■■ 4.04
PPFIA3-210ENST00000602800 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.16■■■■■ 4.02
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PPFIA3-210ENST00000602800 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.38■■■■□ 3.9
PPFIA3-210ENST00000602800 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.37■■■■□ 3.89
PPFIA3-210ENST00000602800 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
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PPFIA3-210ENST00000602800 NCAPD3P42695 1498 aa37.97■■■■□ 3.67
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PPFIA3-210ENST00000602800 ERCC6Q03468 1493 aa37.77■■■■□ 3.64
PPFIA3-210ENST00000602800 CUX2O14529 1486 aa37.75■■■■□ 3.63
PPFIA3-210ENST00000602800 SMARCA2P51531 1590 aa37.68■■■■□ 3.62
PPFIA3-210ENST00000602800 SMARCA4P51532 1647 aa37.64■■■■□ 3.62
PPFIA3-210ENST00000602800 HMGXB3Q12766 1538 aa37.61■■■■□ 3.61
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PPFIA3-210ENST00000602800 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.28■■■■□ 3.56
PPFIA3-210ENST00000602800 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.15■■■■□ 3.54
PPFIA3-210ENST00000602800 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.11■■■■□ 3.53
PPFIA3-210ENST00000602800 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
PPFIA3-210ENST00000602800 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37■■■■□ 3.51
PPFIA3-210ENST00000602800 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.84■■■■□ 3.49
PPFIA3-210ENST00000602800 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.81■■■■□ 3.48
PPFIA3-210ENST00000602800 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.64■■■■□ 3.46
PPFIA3-210ENST00000602800 WIZO95785 1651 aa36.64■■■■□ 3.46
PPFIA3-210ENST00000602800 WDR62O43379 1518 aa36.51■■■■□ 3.44
PPFIA3-210ENST00000602800 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.45■■■■□ 3.43
PPFIA3-210ENST00000602800 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.39■■■■□ 3.42
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PPFIA3-210ENST00000602800 CFTRP13569 1480 aa36.33■■■■□ 3.41
PPFIA3-210ENST00000602800 TRIM41Q8WV44 630 aa36.33■■■■□ 3.41
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PPFIA3-210ENST00000602800 IFT140Q96RY7 1462 aa35.75■■■■□ 3.31
PPFIA3-210ENST00000602800 PRDM2Q13029 1718 aa35.74■■■■□ 3.31
PPFIA3-210ENST00000602800 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
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PPFIA3-210ENST00000602800 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.16■■■■□ 3.22
PPFIA3-210ENST00000602800 CHD1O14646 1710 aa35.13■■■■□ 3.21
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PPFIA3-210ENST00000602800 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.97■■■■□ 3.19
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PPFIA3-210ENST00000602800 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
PPFIA3-210ENST00000602800 WDR97A6NE52 1622 aa34.94■■■■□ 3.18
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PPFIA3-210ENST00000602800 SYNJ2O15056 1496 aa34.78■■■■□ 3.16
PPFIA3-210ENST00000602800 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.71■■■■□ 3.15
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PPFIA3-210ENST00000602800 SHROOM2Q13796 1616 aa34.08■■■■□ 3.05
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PPFIA3-210ENST00000602800 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.82■■■■□ 3
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