RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598481.1

TIMM44-206, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM44, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-206ENST00000598481 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.67■■■■■ 4.26
TIMM44-206ENST00000598481 ABCC9O60706 1549 aa37.53■■■■□ 3.6
TIMM44-206ENST00000598481 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.11■■■■□ 3.53
TIMM44-206ENST00000598481 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.82■■■■□ 3.32
TIMM44-206ENST00000598481 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.5■■■■□ 3.27
TIMM44-206ENST00000598481 NACADO15069 1562 aa35.13■■■■□ 3.21
TIMM44-206ENST00000598481 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.97■■■■□ 3.19
TIMM44-206ENST00000598481 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.78■■■■□ 3.16
TIMM44-206ENST00000598481 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
TIMM44-206ENST00000598481 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.69■■■■□ 3.14
TIMM44-206ENST00000598481 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.66■■■■□ 3.14
TIMM44-206ENST00000598481 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.56■■■■□ 3.12
TIMM44-206ENST00000598481 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.5■■■■□ 3.11
TIMM44-206ENST00000598481 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.97■■■■□ 3.03
TIMM44-206ENST00000598481 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.97■■■■□ 3.03
TIMM44-206ENST00000598481 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.86■■■■□ 3.01
TIMM44-206ENST00000598481 SCRIBQ14160 1630 aa33.75■■■□□ 2.99
TIMM44-206ENST00000598481 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
TIMM44-206ENST00000598481 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.22■■■□□ 2.91
TIMM44-206ENST00000598481 CUX2O14529 1486 aa32.6■■■□□ 2.81
TIMM44-206ENST00000598481 NCAPD3P42695 1498 aa32.44■■■□□ 2.78
TIMM44-206ENST00000598481 ERCC6Q03468 1493 aa32.34■■■□□ 2.77
TIMM44-206ENST00000598481 SMARCA4P51532 1647 aa32.3■■■□□ 2.76
TIMM44-206ENST00000598481 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
TIMM44-206ENST00000598481 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.26■■■□□ 2.75
TIMM44-206ENST00000598481 HMGXB3Q12766 1538 aa32.17■■■□□ 2.74
TIMM44-206ENST00000598481 NESP48681 1621 aa32.15■■■□□ 2.74
TIMM44-206ENST00000598481 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.11■■■□□ 2.73
TIMM44-206ENST00000598481 SMARCA2P51531 1590 aa32.1■■■□□ 2.73
TIMM44-206ENST00000598481 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
TIMM44-206ENST00000598481 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.98■■■□□ 2.71
TIMM44-206ENST00000598481 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
TIMM44-206ENST00000598481 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
TIMM44-206ENST00000598481 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.81■■■□□ 2.68
TIMM44-206ENST00000598481 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.81■■■□□ 2.68
TIMM44-206ENST00000598481 WIZO95785 1651 aa31.78■■■□□ 2.68
TIMM44-206ENST00000598481 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.52■■■□□ 2.64
TIMM44-206ENST00000598481 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
TIMM44-206ENST00000598481 WDR62O43379 1518 aa31.39■■■□□ 2.61
TIMM44-206ENST00000598481 TRIM41Q8WV44 630 aa31.38■■■□□ 2.61
TIMM44-206ENST00000598481 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.36■■■□□ 2.61
TIMM44-206ENST00000598481 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.36■■■□□ 2.61
TIMM44-206ENST00000598481 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
TIMM44-206ENST00000598481 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.09■■■□□ 2.57
TIMM44-206ENST00000598481 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.08■■■□□ 2.57
TIMM44-206ENST00000598481 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.02■■■□□ 2.56
TIMM44-206ENST00000598481 CFTRP13569 1480 aa30.95■■■□□ 2.54
TIMM44-206ENST00000598481 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
TIMM44-206ENST00000598481 OSCARQ8IYS5 282 aa30.89■■■□□ 2.54
TIMM44-206ENST00000598481 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.77■■■□□ 2.52
TIMM44-206ENST00000598481 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.77■■■□□ 2.52
TIMM44-206ENST00000598481 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.77■■■□□ 2.52
TIMM44-206ENST00000598481 PRDM2Q13029 1718 aa30.76■■■□□ 2.51
TIMM44-206ENST00000598481 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
TIMM44-206ENST00000598481 ARHGEF11O15085 1522 aa30.55■■■□□ 2.48
TIMM44-206ENST00000598481 IFT140Q96RY7 1462 aa30.5■■■□□ 2.47
TIMM44-206ENST00000598481 TOPBP1Q92547 1522 aa30.42■■■□□ 2.46
TIMM44-206ENST00000598481 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
TIMM44-206ENST00000598481 CHD1O14646 1710 aa30.36■■■□□ 2.45
TIMM44-206ENST00000598481 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
TIMM44-206ENST00000598481 ABCC8Q09428 1581 aa30.28■■■□□ 2.44
TIMM44-206ENST00000598481 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.28■■■□□ 2.44
TIMM44-206ENST00000598481 ARAP1Q96P48 1450 aa30.23■■■□□ 2.43
TIMM44-206ENST00000598481 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.2■■■□□ 2.43
TIMM44-206ENST00000598481 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.426e-11■■■■■ 31.9
TIMM44-206ENST00000598481 CUX1P39880 1505 aa30.13■■■□□ 2.41
TIMM44-206ENST00000598481 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
TIMM44-206ENST00000598481 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.39
TIMM44-206ENST00000598481 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.99■■■□□ 2.39
TIMM44-206ENST00000598481 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
TIMM44-206ENST00000598481 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.96■■■□□ 2.39
TIMM44-206ENST00000598481 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.95■■■□□ 2.39
TIMM44-206ENST00000598481 SYNJ1O43426 1573 aa29.94■■■□□ 2.38
TIMM44-206ENST00000598481 TOP2BQ02880 1626 aa29.93■■■□□ 2.38
TIMM44-206ENST00000598481 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.93■■■□□ 2.38
TIMM44-206ENST00000598481 SOGA1O94964 1423 aa29.89■■■□□ 2.38
TIMM44-206ENST00000598481 FBLN2P98095 1184 aa29.89■■■□□ 2.38
TIMM44-206ENST00000598481 WDR97A6NE52 1622 aa29.87■■■□□ 2.37
TIMM44-206ENST00000598481 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.86■■■□□ 2.37
TIMM44-206ENST00000598481 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
TIMM44-206ENST00000598481 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
TIMM44-206ENST00000598481 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.71■■■□□ 2.35
TIMM44-206ENST00000598481 PBRM1Q86U86 1689 aa29.67■■■□□ 2.34
TIMM44-206ENST00000598481 GRIN2BQ13224 1484 aa29.66■■■□□ 2.34
TIMM44-206ENST00000598481 SYNJ2O15056 1496 aa29.65■■■□□ 2.34
TIMM44-206ENST00000598481 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
TIMM44-206ENST00000598481 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.59■■■□□ 2.33
TIMM44-206ENST00000598481 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.57■■■□□ 2.32
TIMM44-206ENST00000598481 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.47■■■□□ 2.31
TIMM44-206ENST00000598481 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
TIMM44-206ENST00000598481 KIF27Q86VH2 1401 aa29.37■■■□□ 2.29
TIMM44-206ENST00000598481 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.36■■■□□ 2.29
TIMM44-206ENST00000598481 CEP170Q5SW79 1584 aa29.32■■■□□ 2.28
TIMM44-206ENST00000598481 GRIN2AQ12879 1464 aa29.32■■■□□ 2.28
TIMM44-206ENST00000598481 SHROOM2Q13796 1616 aa29.31■■■□□ 2.28
TIMM44-206ENST00000598481 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.31■■■□□ 2.28
TIMM44-206ENST00000598481 ADAMTS12P58397 1594 aa29.3■■■□□ 2.28
TIMM44-206ENST00000598481 NUP160Q12769 1436 aa29.28■■■□□ 2.28
TIMM44-206ENST00000598481 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.24■■■□□ 2.27
TIMM44-206ENST00000598481 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms