RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597076.5

FCHO1-219, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 501 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-219ENST00000597076 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.91■■■□□ 2.54
FCHO1-219ENST00000597076 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.32■■□□□ 1.96
FCHO1-219ENST00000597076 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
FCHO1-219ENST00000597076 ABCC9O60706 1549 aa25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-219ENST00000597076 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.72■■□□□ 1.71
FCHO1-219ENST00000597076 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-219ENST00000597076 NACADO15069 1562 aa25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-219ENST00000597076 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.29■■□□□ 1.64
FCHO1-219ENST00000597076 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.19■■□□□ 1.62
FCHO1-219ENST00000597076 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.81■■□□□ 1.56
FCHO1-219ENST00000597076 SCRIBQ14160 1630 aa24.8■■□□□ 1.56
FCHO1-219ENST00000597076 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.55■■□□□ 1.52
FCHO1-219ENST00000597076 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.54■■□□□ 1.52
FCHO1-219ENST00000597076 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
FCHO1-219ENST00000597076 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.93■■□□□ 1.42
FCHO1-219ENST00000597076 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
FCHO1-219ENST00000597076 SMARCA4P51532 1647 aa23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-219ENST00000597076 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-219ENST00000597076 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-219ENST00000597076 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-219ENST00000597076 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-219ENST00000597076 WIZO95785 1651 aa23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-219ENST00000597076 SMARCA2P51531 1590 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-219ENST00000597076 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-219ENST00000597076 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.51■■□□□ 1.35
FCHO1-219ENST00000597076 HMGXB3Q12766 1538 aa23.44■■□□□ 1.34
FCHO1-219ENST00000597076 NCAPD3P42695 1498 aa23.44■■□□□ 1.34
FCHO1-219ENST00000597076 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
FCHO1-219ENST00000597076 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
FCHO1-219ENST00000597076 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
FCHO1-219ENST00000597076 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-219ENST00000597076 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-219ENST00000597076 PRDM2Q13029 1718 aa22.82■■□□□ 1.24
FCHO1-219ENST00000597076 CFTRP13569 1480 aa22.79■■□□□ 1.24
FCHO1-219ENST00000597076 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.75■■□□□ 1.23
FCHO1-219ENST00000597076 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-219ENST00000597076 NESP48681 1621 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-219ENST00000597076 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-219ENST00000597076 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-219ENST00000597076 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-219ENST00000597076 ABCC8Q09428 1581 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-219ENST00000597076 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-219ENST00000597076 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-219ENST00000597076 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-219ENST00000597076 TOP2BQ02880 1626 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-219ENST00000597076 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-219ENST00000597076 SYNJ1O43426 1573 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-219ENST00000597076 CUX1P39880 1505 aa22.3■■□□□ 1.16
FCHO1-219ENST00000597076 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-219ENST00000597076 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
FCHO1-219ENST00000597076 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-219ENST00000597076 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-219ENST00000597076 ERCC6Q03468 1493 aa22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-219ENST00000597076 TOPBP1Q92547 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
FCHO1-219ENST00000597076 WDR62O43379 1518 aa22.21■■□□□ 1.15
FCHO1-219ENST00000597076 TRIM41Q8WV44 630 aa22.13■■□□□ 1.13
FCHO1-219ENST00000597076 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-219ENST00000597076 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-219ENST00000597076 WDR97A6NE52 1622 aa22.03■■□□□ 1.12
FCHO1-219ENST00000597076 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FCHO1-219ENST00000597076 CUX2O14529 1486 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-219ENST00000597076 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-219ENST00000597076 SOGA1O94964 1423 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-219ENST00000597076 IFT140Q96RY7 1462 aa21.91■■□□□ 1.1
FCHO1-219ENST00000597076 EEA1Q15075 1411 aa21.91■■□□□ 1.1
FCHO1-219ENST00000597076 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.89■■□□□ 1.09
FCHO1-219ENST00000597076 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-219ENST00000597076 KIF27Q86VH2 1401 aa21.83■■□□□ 1.09
FCHO1-219ENST00000597076 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.8■■□□□ 1.08
FCHO1-219ENST00000597076 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-219ENST00000597076 PBRM1Q86U86 1689 aa21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-219ENST00000597076 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.73■■□□□ 1.07
FCHO1-219ENST00000597076 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.71■■□□□ 1.07
FCHO1-219ENST00000597076 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
FCHO1-219ENST00000597076 CUL7Q14999 1698 aa21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-219ENST00000597076 KIF21BO75037 1637 aa21.68■■□□□ 1.06
FCHO1-219ENST00000597076 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
FCHO1-219ENST00000597076 GRIN2BQ13224 1484 aa21.64■■□□□ 1.06
FCHO1-219ENST00000597076 IGF1RP08069 1367 aa21.64■■□□□ 1.06
FCHO1-219ENST00000597076 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.64■■□□□ 1.05
FCHO1-219ENST00000597076 PRXQ9BXM0 1461 aa21.64■■□□□ 1.05
FCHO1-219ENST00000597076 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.053e-6■■■□□ 17
FCHO1-219ENST00000597076 ADAMTS12P58397 1594 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-219ENST00000597076 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-219ENST00000597076 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-219ENST00000597076 GOLGA3Q08378 1498 aa21.52■■□□□ 1.03
FCHO1-219ENST00000597076 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-219ENST00000597076 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-219ENST00000597076 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-219ENST00000597076 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-219ENST00000597076 SYNJ2O15056 1496 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-219ENST00000597076 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-219ENST00000597076 GRIN2AQ12879 1464 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-219ENST00000597076 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-219ENST00000597076 CHD1O14646 1710 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-219ENST00000597076 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-219ENST00000597076 NUP160Q12769 1436 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-219ENST00000597076 CEP170Q5SW79 1584 aa21.27■□□□□ 0.99
FCHO1-219ENST00000597076 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-219ENST00000597076 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
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