RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596259.3

PCBP1-AS1-248, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.97■■■□□ 2.55
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.75■■■□□ 2.03
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ABCC9O60706 1549 aa27.34■■□□□ 1.97
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.2■■□□□ 1.79
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 NACADO15069 1562 aa26.07■■□□□ 1.76
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.87■■□□□ 1.73
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.8■■□□□ 1.72
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.71■■□□□ 1.71
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.61■■□□□ 1.69
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.43■■□□□ 1.66
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SCRIBQ14160 1630 aa25.3■■□□□ 1.64
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.24■■□□□ 1.63
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.12■■□□□ 1.61
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.75■■□□□ 1.55
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.58■■□□□ 1.53
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SMARCA4P51532 1647 aa24.15■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.14■■□□□ 1.45
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 NCAPD3P42695 1498 aa24.01■■□□□ 1.43
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.01■■□□□ 1.43
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SMARCA2P51531 1590 aa24■■□□□ 1.43
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 HMGXB3Q12766 1538 aa23.95■■□□□ 1.43
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.89■■□□□ 1.41
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.88■■□□□ 1.41
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 WIZO95785 1651 aa23.66■■□□□ 1.38
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 NESP48681 1621 aa23.59■■□□□ 1.37
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ERCC6Q03468 1493 aa23.59■■□□□ 1.37
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.5■■□□□ 1.35
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CUX2O14529 1486 aa23.43■■□□□ 1.34
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.39■■□□□ 1.34
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.28■■□□□ 1.32
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.27■■□□□ 1.32
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CFTRP13569 1480 aa23.12■■□□□ 1.29
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.11■■□□□ 1.29
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.1■■□□□ 1.29
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 PRDM2Q13029 1718 aa23.09■■□□□ 1.29
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 WDR62O43379 1518 aa23.08■■□□□ 1.29
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.08■■□□□ 1.29
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.03■■□□□ 1.28
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.92■■□□□ 1.26
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 TOPBP1Q92547 1522 aa22.69■■□□□ 1.22
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.67■■□□□ 1.22
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ABCC8Q09428 1581 aa22.62■■□□□ 1.21
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 IFT140Q96RY7 1462 aa22.6■■□□□ 1.21
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CUX1P39880 1505 aa22.43■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.4■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.36■■□□□ 1.17
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 WDR97A6NE52 1622 aa22.32■■□□□ 1.16
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SOGA1O94964 1423 aa22.31■■□□□ 1.16
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CHD1O14646 1710 aa22.31■■□□□ 1.16
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 OSCARQ8IYS5 282 aa22.29■■□□□ 1.16
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.21■■□□□ 1.15
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 PBRM1Q86U86 1689 aa22.2■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SYNJ1O43426 1573 aa22.18■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.18■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 TOP2BQ02880 1626 aa22.17■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.16■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.15■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.15■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.15■■□□□ 1.14
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.14■■□□□ 1.13
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 GRIN2BQ13224 1484 aa22.13■■□□□ 1.13
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 TRIM41Q8WV44 630 aa22.1■■□□□ 1.13
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.09■■□□□ 1.13
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ARHGEF11O15085 1522 aa22.08■■□□□ 1.13
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 FBLN2P98095 1184 aa22.07■■□□□ 1.12
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SYNJ2O15056 1496 aa22.03■■□□□ 1.12
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.01■■□□□ 1.11
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ADAMTS12P58397 1594 aa21.97■■□□□ 1.11
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ARAP1Q96P48 1450 aa21.89■■□□□ 1.09
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.88■■□□□ 1.09
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 GRIN2AQ12879 1464 aa21.87■■□□□ 1.09
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CEP170Q5SW79 1584 aa21.82■■□□□ 1.08
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.81■■□□□ 1.08
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 NUP160Q12769 1436 aa21.77■■□□□ 1.08
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.76■■□□□ 1.07
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 SHROOM2Q13796 1616 aa21.7■■□□□ 1.06
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 CUL7Q14999 1698 aa21.69■■□□□ 1.06
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 KIF27Q86VH2 1401 aa21.68■■□□□ 1.06
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.68■■□□□ 1.06
PCBP1-AS1-248ENST00000596259 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms