RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596224.5

CPAMD8-208, Transcript of C3 and PZP like, alpha-2-macroglobulin domain containing 8, humanhuman

TSL 2

Gene CPAMD8, Length 2,117 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPAMD8-208ENST00000596224 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.11■■■■■ 5.45
CPAMD8-208ENST00000596224 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.48■■■■■ 4.39
CPAMD8-208ENST00000596224 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
CPAMD8-208ENST00000596224 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.84■■■■■ 4.13
CPAMD8-208ENST00000596224 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.82■■■■■ 4.13
CPAMD8-208ENST00000596224 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.39■■■■■ 4.06
CPAMD8-208ENST00000596224 ABCC9O60706 1549 aa40.13■■■■■ 4.01
CPAMD8-208ENST00000596224 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.67■■■■□ 3.94
CPAMD8-208ENST00000596224 NACADO15069 1562 aa39.47■■■■□ 3.91
CPAMD8-208ENST00000596224 SCRIBQ14160 1630 aa39.46■■■■□ 3.91
CPAMD8-208ENST00000596224 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
CPAMD8-208ENST00000596224 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.1■■■■□ 3.85
CPAMD8-208ENST00000596224 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.49■■■■□ 3.75
CPAMD8-208ENST00000596224 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
CPAMD8-208ENST00000596224 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.3■■■■□ 3.72
CPAMD8-208ENST00000596224 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.08■■■■□ 3.69
CPAMD8-208ENST00000596224 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.03■■■■□ 3.68
CPAMD8-208ENST00000596224 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.99■■■■□ 3.67
CPAMD8-208ENST00000596224 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
CPAMD8-208ENST00000596224 WIZO95785 1651 aa37.85■■■■□ 3.65
CPAMD8-208ENST00000596224 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.82■■■■□ 3.64
CPAMD8-208ENST00000596224 SMARCA4P51532 1647 aa37.69■■■■□ 3.62
CPAMD8-208ENST00000596224 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
CPAMD8-208ENST00000596224 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.05■■■■□ 3.52
CPAMD8-208ENST00000596224 SMARCA2P51531 1590 aa37.03■■■■□ 3.52
CPAMD8-208ENST00000596224 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.01■■■■□ 3.52
CPAMD8-208ENST00000596224 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.94■■■■□ 3.5
CPAMD8-208ENST00000596224 TRIM41Q8WV44 630 aa36.9■■■■□ 3.5
CPAMD8-208ENST00000596224 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
CPAMD8-208ENST00000596224 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
CPAMD8-208ENST00000596224 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.58■■■■□ 3.45
CPAMD8-208ENST00000596224 ABCC8Q09428 1581 aa36.54■■■■□ 3.44
CPAMD8-208ENST00000596224 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
CPAMD8-208ENST00000596224 NCAPD3P42695 1498 aa36.45■■■■□ 3.42
CPAMD8-208ENST00000596224 HMGXB3Q12766 1538 aa36.43■■■■□ 3.42
CPAMD8-208ENST00000596224 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.21■■■■□ 3.39
CPAMD8-208ENST00000596224 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.16■■■■□ 3.38
CPAMD8-208ENST00000596224 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.37
CPAMD8-208ENST00000596224 SYNJ1O43426 1573 aa35.98■■■■□ 3.35
CPAMD8-208ENST00000596224 SOGA1O94964 1423 aa35.9■■■■□ 3.34
CPAMD8-208ENST00000596224 CFTRP13569 1480 aa35.82■■■■□ 3.32
CPAMD8-208ENST00000596224 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.78■■■■□ 3.32
CPAMD8-208ENST00000596224 TOP2BQ02880 1626 aa35.67■■■■□ 3.3
CPAMD8-208ENST00000596224 PRDM2Q13029 1718 aa35.66■■■■□ 3.3
CPAMD8-208ENST00000596224 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.63■■■■□ 3.29
CPAMD8-208ENST00000596224 EEA1Q15075 1411 aa35.62■■■■□ 3.29
CPAMD8-208ENST00000596224 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.61■■■■□ 3.29
CPAMD8-208ENST00000596224 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.58■■■■□ 3.29
CPAMD8-208ENST00000596224 CUX1P39880 1505 aa35.55■■■■□ 3.28
CPAMD8-208ENST00000596224 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.41■■■■□ 3.26
CPAMD8-208ENST00000596224 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.39■■■■□ 3.26
CPAMD8-208ENST00000596224 NESP48681 1621 aa35.39■■■■□ 3.26
CPAMD8-208ENST00000596224 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
CPAMD8-208ENST00000596224 GOLGA3Q08378 1498 aa35.31■■■■□ 3.24
CPAMD8-208ENST00000596224 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.31■■■■□ 3.24
CPAMD8-208ENST00000596224 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.24■■■■□ 3.23
CPAMD8-208ENST00000596224 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.24■■■■□ 3.23
CPAMD8-208ENST00000596224 KIF21BO75037 1637 aa35.23■■■■□ 3.23
CPAMD8-208ENST00000596224 CEP162Q5TB80 1403 aa35.21■■■■□ 3.23
CPAMD8-208ENST00000596224 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.16■■■■□ 3.22
CPAMD8-208ENST00000596224 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.11■■■■□ 3.21
CPAMD8-208ENST00000596224 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.11■■■■□ 3.21
CPAMD8-208ENST00000596224 KIF27Q86VH2 1401 aa35.08■■■■□ 3.21
CPAMD8-208ENST00000596224 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
CPAMD8-208ENST00000596224 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.01■■■■□ 3.19
CPAMD8-208ENST00000596224 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CPAMD8-208ENST00000596224 CUX2O14529 1486 aa34.99■■■■□ 3.19
CPAMD8-208ENST00000596224 TOPBP1Q92547 1522 aa34.96■■■■□ 3.19
CPAMD8-208ENST00000596224 PRXQ9BXM0 1461 aa34.94■■■■□ 3.18
CPAMD8-208ENST00000596224 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.9■■■■□ 3.18
CPAMD8-208ENST00000596224 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.9■■■■□ 3.18
CPAMD8-208ENST00000596224 HRCP23327 699 aa34.9■■■■□ 3.18
CPAMD8-208ENST00000596224 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.87■■■■□ 3.17
CPAMD8-208ENST00000596224 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
CPAMD8-208ENST00000596224 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
CPAMD8-208ENST00000596224 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.85■■■■□ 3.17
CPAMD8-208ENST00000596224 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
CPAMD8-208ENST00000596224 CLIP1P30622 1438 aa34.82■■■■□ 3.16
CPAMD8-208ENST00000596224 IGF1RP08069 1367 aa34.75■■■■□ 3.15
CPAMD8-208ENST00000596224 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
CPAMD8-208ENST00000596224 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.68■■■■□ 3.14
CPAMD8-208ENST00000596224 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.6■■■■□ 3.13
CPAMD8-208ENST00000596224 WDR97A6NE52 1622 aa34.57■■■■□ 3.12
CPAMD8-208ENST00000596224 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.52■■■■□ 3.12
CPAMD8-208ENST00000596224 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
CPAMD8-208ENST00000596224 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.46■■■■□ 3.11
CPAMD8-208ENST00000596224 ARAP1Q96P48 1450 aa34.42■■■■□ 3.1
CPAMD8-208ENST00000596224 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.4■■■■□ 3.1
CPAMD8-208ENST00000596224 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
CPAMD8-208ENST00000596224 CUL7Q14999 1698 aa34.37■■■■□ 3.09
CPAMD8-208ENST00000596224 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.35■■■■□ 3.09
CPAMD8-208ENST00000596224 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.32■■■■□ 3.09
CPAMD8-208ENST00000596224 ERCC6Q03468 1493 aa34.3■■■■□ 3.08
CPAMD8-208ENST00000596224 APLP2Q06481 763 aa34.28■■■■□ 3.08
CPAMD8-208ENST00000596224 WDR62O43379 1518 aa34.24■■■■□ 3.07
CPAMD8-208ENST00000596224 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.17■■■■□ 3.06
CPAMD8-208ENST00000596224 PBRM1Q86U86 1689 aa34.15■■■■□ 3.06
CPAMD8-208ENST00000596224 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.14■■■■□ 3.06
CPAMD8-208ENST00000596224 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
CPAMD8-208ENST00000596224 P3H3Q8IVL6 736 aa34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms