RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592470.1

SYT5-209, Transcript of synaptotagmin 5, humanhuman

TSL 3

Gene SYT5, Length 640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5-209ENST00000592470 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.64■■■■■ 6.82
SYT5-209ENST00000592470 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.26■■■■■ 5.8
SYT5-209ENST00000592470 ABCC9O60706 1549 aa49.9■■■■■ 5.58
SYT5-209ENST00000592470 NACADO15069 1562 aa48.1■■■■■ 5.29
SYT5-209ENST00000592470 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.1■■■■■ 5.29
SYT5-209ENST00000592470 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
SYT5-209ENST00000592470 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.91■■■■■ 5.26
SYT5-209ENST00000592470 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.83■■■■■ 5.25
SYT5-209ENST00000592470 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.75■■■■■ 5.23
SYT5-209ENST00000592470 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.15■■■■■ 5.14
SYT5-209ENST00000592470 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.73■■■■■ 5.07
SYT5-209ENST00000592470 SCRIBQ14160 1630 aa46.7■■■■■ 5.07
SYT5-209ENST00000592470 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.58■■■■■ 5.05
SYT5-209ENST00000592470 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.22■■■■■ 4.99
SYT5-209ENST00000592470 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.69■■■■■ 4.9
SYT5-209ENST00000592470 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
SYT5-209ENST00000592470 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.21■■■■■ 4.83
SYT5-209ENST00000592470 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.87■■■■■ 4.77
SYT5-209ENST00000592470 SMARCA4P51532 1647 aa44.72■■■■■ 4.75
SYT5-209ENST00000592470 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
SYT5-209ENST00000592470 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.42■■■■■ 4.7
SYT5-209ENST00000592470 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.41■■■■■ 4.7
SYT5-209ENST00000592470 NCAPD3P42695 1498 aa44.37■■■■■ 4.69
SYT5-209ENST00000592470 SMARCA2P51531 1590 aa44.36■■■■■ 4.69
SYT5-209ENST00000592470 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.33■■■■■ 4.69
SYT5-209ENST00000592470 HMGXB3Q12766 1538 aa44.21■■■■■ 4.67
SYT5-209ENST00000592470 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
SYT5-209ENST00000592470 WIZO95785 1651 aa43.97■■■■■ 4.63
SYT5-209ENST00000592470 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
SYT5-209ENST00000592470 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
SYT5-209ENST00000592470 NESP48681 1621 aa43.26■■■■■ 4.52
SYT5-209ENST00000592470 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.2■■■■■ 4.51
SYT5-209ENST00000592470 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.03■■■■■ 4.48
SYT5-209ENST00000592470 ERCC6Q03468 1493 aa42.96■■■■■ 4.47
SYT5-209ENST00000592470 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.95■■■■■ 4.47
SYT5-209ENST00000592470 CFTRP13569 1480 aa42.86■■■■■ 4.45
SYT5-209ENST00000592470 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.82■■■■■ 4.45
SYT5-209ENST00000592470 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.81■■■■■ 4.44
SYT5-209ENST00000592470 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
SYT5-209ENST00000592470 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
SYT5-209ENST00000592470 PRDM2Q13029 1718 aa42.66■■■■■ 4.42
SYT5-209ENST00000592470 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.56■■■■■ 4.4
SYT5-209ENST00000592470 CUX2O14529 1486 aa42.55■■■■■ 4.4
SYT5-209ENST00000592470 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.49■■■■■ 4.39
SYT5-209ENST00000592470 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.43■■■■■ 4.38
SYT5-209ENST00000592470 WDR62O43379 1518 aa42.34■■■■■ 4.37
SYT5-209ENST00000592470 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
SYT5-209ENST00000592470 TOPBP1Q92547 1522 aa41.93■■■■■ 4.3
SYT5-209ENST00000592470 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.9■■■■■ 4.3
SYT5-209ENST00000592470 ABCC8Q09428 1581 aa41.88■■■■■ 4.29
SYT5-209ENST00000592470 CUX1P39880 1505 aa41.68■■■■■ 4.26
SYT5-209ENST00000592470 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.62■■■■■ 4.25
SYT5-209ENST00000592470 IFT140Q96RY7 1462 aa41.6■■■■■ 4.25
SYT5-209ENST00000592470 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
SYT5-209ENST00000592470 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
SYT5-209ENST00000592470 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.48■■■■■ 4.23
SYT5-209ENST00000592470 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
SYT5-209ENST00000592470 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.39■■■■■ 4.22
SYT5-209ENST00000592470 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.22
SYT5-209ENST00000592470 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.36■■■■■ 4.21
SYT5-209ENST00000592470 SYNJ1O43426 1573 aa41.36■■■■■ 4.21
SYT5-209ENST00000592470 TOP2BQ02880 1626 aa41.36■■■■■ 4.21
SYT5-209ENST00000592470 SOGA1O94964 1423 aa41.33■■■■■ 4.21
SYT5-209ENST00000592470 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
SYT5-209ENST00000592470 WDR97A6NE52 1622 aa41.26■■■■■ 4.2
SYT5-209ENST00000592470 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.18
SYT5-209ENST00000592470 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.11■■■■■ 4.17
SYT5-209ENST00000592470 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
SYT5-209ENST00000592470 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.99■■■■■ 4.15
SYT5-209ENST00000592470 PBRM1Q86U86 1689 aa40.9■■■■■ 4.14
SYT5-209ENST00000592470 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.89■■■■■ 4.14
SYT5-209ENST00000592470 GRIN2BQ13224 1484 aa40.88■■■■■ 4.13
SYT5-209ENST00000592470 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.82■■■■■ 4.12
SYT5-209ENST00000592470 CHD1O14646 1710 aa40.79■■■■■ 4.12
SYT5-209ENST00000592470 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
SYT5-209ENST00000592470 OSCARQ8IYS5 282 aa40.67■■■■■ 4.1
SYT5-209ENST00000592470 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.62■■■■■ 4.09
SYT5-209ENST00000592470 SYNJ2O15056 1496 aa40.61■■■■■ 4.09
SYT5-209ENST00000592470 ADAMTS12P58397 1594 aa40.57■■■■■ 4.08
SYT5-209ENST00000592470 FBLN2P98095 1184 aa40.49■■■■■ 4.07
SYT5-209ENST00000592470 KIF27Q86VH2 1401 aa40.49■■■■■ 4.07
SYT5-209ENST00000592470 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
SYT5-209ENST00000592470 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.42■■■■■ 4.06
SYT5-209ENST00000592470 GRIN2AQ12879 1464 aa40.38■■■■■ 4.05
SYT5-209ENST00000592470 TRIM41Q8WV44 630 aa40.36■■■■■ 4.05
SYT5-209ENST00000592470 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.35■■■■■ 4.05
SYT5-209ENST00000592470 IGF1RP08069 1367 aa40.33■■■■■ 4.05
SYT5-209ENST00000592470 CUL7Q14999 1698 aa40.29■■■■■ 4.04
SYT5-209ENST00000592470 NUP160Q12769 1436 aa40.22■■■■■ 4.03
SYT5-209ENST00000592470 CEP170Q5SW79 1584 aa40.21■■■■■ 4.03
SYT5-209ENST00000592470 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.21■■■■■ 4.03
SYT5-209ENST00000592470 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
SYT5-209ENST00000592470 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
SYT5-209ENST00000592470 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
SYT5-209ENST00000592470 ARHGEF11O15085 1522 aa40.16■■■■■ 4.02
SYT5-209ENST00000592470 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.07■■■■■ 4
SYT5-209ENST00000592470 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.03■■■■■ 4
SYT5-209ENST00000592470 SHROOM2Q13796 1616 aa39.95■■■■□ 3.99
SYT5-209ENST00000592470 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.87■■■■□ 3.97
SYT5-209ENST00000592470 ARAP1Q96P48 1450 aa39.86■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms