RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589985.5

GPI-212, Transcript of glucose-6-phosphate isomerase, human

TSL 3

Gene GPI, Length 1,516 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPI-212	ENST00000589985	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.76	■■■■■ 4.76
GPI-212	ENST00000589985	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.96	■■■■□ 3.99
GPI-212	ENST00000589985	ABCC9	O60706	1549 aa		39.66	■■■■□ 3.94
GPI-212	ENST00000589985	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.89	■■■■□ 3.66
GPI-212	ENST00000589985	NACAD	O15069	1562 aa		37.74	■■■■□ 3.63
GPI-212	ENST00000589985	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.66	■■■■□ 3.62
GPI-212	ENST00000589985	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.35	■■■■□ 3.57
GPI-212	ENST00000589985	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.18	■■■■□ 3.54
GPI-212	ENST00000589985	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.02	■■■■□ 3.52	1e-9	■□□□□ 9.6
GPI-212	ENST00000589985	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.01	■■■■□ 3.51
GPI-212	ENST00000589985	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.94	■■■■□ 3.5
GPI-212	ENST00000589985	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.91	■■■■□ 3.5
GPI-212	ENST00000589985	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.77	■■■■□ 3.48
GPI-212	ENST00000589985	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.45	■■■■□ 3.43
GPI-212	ENST00000589985	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.35	■■■■□ 3.41
GPI-212	ENST00000589985	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.84	■■■■□ 3.33
GPI-212	ENST00000589985	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.82	■■■■□ 3.32
GPI-212	ENST00000589985	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.7	■■■■□ 3.31
GPI-212	ENST00000589985	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.86	■■■■□ 3.17
GPI-212	ENST00000589985	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.81	■■■■□ 3.16
GPI-212	ENST00000589985	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.8	■■■■□ 3.16
GPI-212	ENST00000589985	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.71	■■■■□ 3.15
GPI-212	ENST00000589985	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.71	■■■■□ 3.15
GPI-212	ENST00000589985	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.6	■■■■□ 3.13
GPI-212	ENST00000589985	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.5	■■■■□ 3.11
GPI-212	ENST00000589985	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.48	■■■■□ 3.11
GPI-212	ENST00000589985	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.47	■■■■□ 3.11
GPI-212	ENST00000589985	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.23	■■■■□ 3.07
GPI-212	ENST00000589985	NES	P48681	1621 aa		34.17	■■■■□ 3.06
GPI-212	ENST00000589985	WIZ	O95785	1651 aa		34.06	■■■■□ 3.04
GPI-212	ENST00000589985	CUX2	O14529	1486 aa		34.05	■■■■□ 3.04
GPI-212	ENST00000589985	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.98	■■■■□ 3.03
GPI-212	ENST00000589985	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.94	■■■■□ 3.02
GPI-212	ENST00000589985	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GPI-212	ENST00000589985	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.82	■■■■□ 3
GPI-212	ENST00000589985	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
GPI-212	ENST00000589985	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
GPI-212	ENST00000589985	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GPI-212	ENST00000589985	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.64	■■■□□ 2.98
GPI-212	ENST00000589985	CFTR	P13569	1480 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GPI-212	ENST00000589985	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
GPI-212	ENST00000589985	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GPI-212	ENST00000589985	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GPI-212	ENST00000589985	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GPI-212	ENST00000589985	WDR62	O43379	1518 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GPI-212	ENST00000589985	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPI-212	ENST00000589985	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
GPI-212	ENST00000589985	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.08	■■■□□ 2.89
GPI-212	ENST00000589985	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GPI-212	ENST00000589985	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPI-212	ENST00000589985	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.75	■■■□□ 2.83
GPI-212	ENST00000589985	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GPI-212	ENST00000589985	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
GPI-212	ENST00000589985	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPI-212	ENST00000589985	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.8
GPI-212	ENST00000589985	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
GPI-212	ENST00000589985	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPI-212	ENST00000589985	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
GPI-212	ENST00000589985	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.41	■■■□□ 2.78	7e-10	■■■■■ 40.4
GPI-212	ENST00000589985	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPI-212	ENST00000589985	SOGA1	O94964	1423 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPI-212	ENST00000589985	CUX1	P39880	1505 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPI-212	ENST00000589985	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GPI-212	ENST00000589985	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.31	■■■□□ 2.76
GPI-212	ENST00000589985	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
GPI-212	ENST00000589985	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GPI-212	ENST00000589985	FBLN2	P98095	1184 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GPI-212	ENST00000589985	CHD1	O14646	1710 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GPI-212	ENST00000589985	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPI-212	ENST00000589985	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPI-212	ENST00000589985	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPI-212	ENST00000589985	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPI-212	ENST00000589985	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPI-212	ENST00000589985	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPI-212	ENST00000589985	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
GPI-212	ENST00000589985	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.01	■■■□□ 2.71
GPI-212	ENST00000589985	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPI-212	ENST00000589985	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPI-212	ENST00000589985	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
GPI-212	ENST00000589985	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPI-212	ENST00000589985	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPI-212	ENST00000589985	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GPI-212	ENST00000589985	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GPI-212	ENST00000589985	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GPI-212	ENST00000589985	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.88	■■■□□ 2.69
GPI-212	ENST00000589985	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPI-212	ENST00000589985	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPI-212	ENST00000589985	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPI-212	ENST00000589985	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GPI-212	ENST00000589985	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.64	■■■□□ 2.66
GPI-212	ENST00000589985	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.62	■■■□□ 2.65
GPI-212	ENST00000589985	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.62	■■■□□ 2.65
GPI-212	ENST00000589985	NUP160	Q12769	1436 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GPI-212	ENST00000589985	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.49	■■■□□ 2.63
GPI-212	ENST00000589985	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.38	■■■□□ 2.61
GPI-212	ENST00000589985	IGF1R	P08069	1367 aa		31.35	■■■□□ 2.61
GPI-212	ENST00000589985	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GPI-212	ENST00000589985	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
GPI-212	ENST00000589985	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.3	■■■□□ 2.6
GPI-212	ENST00000589985	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.24	■■■□□ 2.59

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