RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.37■□□□□ 0.37
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.49■□□□□ 0.07
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ABCC9O60706 1549 aa15.4■□□□□ 0.06
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NACADO15069 1562 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.46□□□□□ -0.09
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.37□□□□□ -0.11
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.34□□□□□ -0.11
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.34□□□□□ -0.11
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.32□□□□□ -0.12
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.26□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SCRIBQ14160 1630 aa14.16□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.06□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.9□□□□□ -0.18
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.85□□□□□ -0.19
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMARCA4P51532 1647 aa13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NCAPD3P42695 1498 aa13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.5□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMARCA2P51531 1590 aa13.45□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HMGXB3Q12766 1538 aa13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.4□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NESP48681 1621 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ERCC6Q03468 1493 aa13.27□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WIZO95785 1651 aa13.24□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CUX2O14529 1486 aa13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CFTRP13569 1480 aa12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.98□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WDR62O43379 1518 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRDM2Q13029 1718 aa12.82□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TOPBP1Q92547 1522 aa12.74□□□□□ -0.37
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ABCC8Q09428 1581 aa12.7□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.69□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IFT140Q96RY7 1462 aa12.69□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 OSCARQ8IYS5 282 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CUX1P39880 1505 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SOGA1O94964 1423 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRIM41Q8WV44 630 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FBLN2P98095 1184 aa12.49□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHD1O14646 1710 aa12.46□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WDR97A6NE52 1622 aa12.46□□□□□ -0.41
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.46□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GRIN2BQ13224 1484 aa12.43□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.43□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.43□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.43□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.42□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.42□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARHGEF11O15085 1522 aa12.42□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TOP2BQ02880 1626 aa12.4□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SYNJ1O43426 1573 aa12.4□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.4□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.38□□□□□ -0.43
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PBRM1Q86U86 1689 aa12.38□□□□□ -0.43
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SYNJ2O15056 1496 aa12.37□□□□□ -0.43
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.34□□□□□ -0.43
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.33□□□□□ -0.44
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARAP1Q96P48 1450 aa12.31□□□□□ -0.44
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GRIN2AQ12879 1464 aa12.28□□□□□ -0.44
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ADAMTS12P58397 1594 aa12.28□□□□□ -0.44
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.28□□□□□ -0.44
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.27□□□□□ -0.45
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.26□□□□□ -0.45
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NUP160Q12769 1436 aa12.23□□□□□ -0.45
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CEP170Q5SW79 1584 aa12.22□□□□□ -0.45
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KIF27Q86VH2 1401 aa12.18□□□□□ -0.46
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.18□□□□□ -0.46
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGF1RP08069 1367 aa12.17□□□□□ -0.46
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SHROOM2Q13796 1616 aa12.14□□□□□ -0.47
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 JPH4Q96JJ6 628 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms