RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588321.1

TMEM205-209, Transcript of transmembrane protein 205, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM205, Length 1,310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM205-209ENST00000588321 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.96■■■■□ 3.83
TMEM205-209ENST00000588321 ABCC9O60706 1549 aa35.39■■■■□ 3.26
TMEM205-209ENST00000588321 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.93■■■■□ 3.18
TMEM205-209ENST00000588321 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.52■■■□□ 2.96
TMEM205-209ENST00000588321 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.47■■■□□ 2.95
TMEM205-209ENST00000588321 NACADO15069 1562 aa33.19■■■□□ 2.9
TMEM205-209ENST00000588321 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.17■■■□□ 2.9
TMEM205-209ENST00000588321 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33■■■□□ 2.87
TMEM205-209ENST00000588321 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.65■■■□□ 2.82
TMEM205-209ENST00000588321 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.51■■■□□ 2.79
TMEM205-209ENST00000588321 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.51■■■□□ 2.79
TMEM205-209ENST00000588321 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
TMEM205-209ENST00000588321 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.13■■■□□ 2.73
TMEM205-209ENST00000588321 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.05■■■□□ 2.72
TMEM205-209ENST00000588321 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.91■■■□□ 2.7
TMEM205-209ENST00000588321 SCRIBQ14160 1630 aa31.91■■■□□ 2.7
TMEM205-209ENST00000588321 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.86■■■□□ 2.69
TMEM205-209ENST00000588321 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
TMEM205-209ENST00000588321 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.97■■■□□ 2.55
TMEM205-209ENST00000588321 NCAPD3P42695 1498 aa30.72■■■□□ 2.51
TMEM205-209ENST00000588321 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.58■■■□□ 2.49
TMEM205-209ENST00000588321 CUX2O14529 1486 aa30.58■■■□□ 2.49
TMEM205-209ENST00000588321 ERCC6Q03468 1493 aa30.57■■■□□ 2.48
TMEM205-209ENST00000588321 SMARCA2P51531 1590 aa30.43■■■□□ 2.46
TMEM205-209ENST00000588321 SMARCA4P51532 1647 aa30.39■■■□□ 2.46
TMEM205-209ENST00000588321 HMGXB3Q12766 1538 aa30.39■■■□□ 2.45
TMEM205-209ENST00000588321 NESP48681 1621 aa30.31■■■□□ 2.44
TMEM205-209ENST00000588321 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TMEM205-209ENST00000588321 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
TMEM205-209ENST00000588321 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.09■■■□□ 2.41
TMEM205-209ENST00000588321 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.04■■■□□ 2.4
TMEM205-209ENST00000588321 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.98■■■□□ 2.39
TMEM205-209ENST00000588321 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
TMEM205-209ENST00000588321 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.92■■■□□ 2.38
TMEM205-209ENST00000588321 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.81■■■□□ 2.36
TMEM205-209ENST00000588321 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.74■■■□□ 2.35
TMEM205-209ENST00000588321 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.64■■■□□ 2.34
TMEM205-209ENST00000588321 WIZO95785 1651 aa29.58■■■□□ 2.33
TMEM205-209ENST00000588321 WDR62O43379 1518 aa29.53■■■□□ 2.32
TMEM205-209ENST00000588321 TRIM41Q8WV44 630 aa29.52■■■□□ 2.32
TMEM205-209ENST00000588321 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.47■■■□□ 2.31
TMEM205-209ENST00000588321 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.43■■■□□ 2.3
TMEM205-209ENST00000588321 CFTRP13569 1480 aa29.37■■■□□ 2.29
TMEM205-209ENST00000588321 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
TMEM205-209ENST00000588321 OSCARQ8IYS5 282 aa29.24■■■□□ 2.27
TMEM205-209ENST00000588321 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
TMEM205-209ENST00000588321 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
TMEM205-209ENST00000588321 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.96■■■□□ 2.23
TMEM205-209ENST00000588321 IFT140Q96RY7 1462 aa28.9■■■□□ 2.22
TMEM205-209ENST00000588321 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
TMEM205-209ENST00000588321 TOPBP1Q92547 1522 aa28.82■■■□□ 2.2
TMEM205-209ENST00000588321 PRDM2Q13029 1718 aa28.76■■■□□ 2.19
TMEM205-209ENST00000588321 ABCC8Q09428 1581 aa28.73■■■□□ 2.19
TMEM205-209ENST00000588321 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM205-209ENST00000588321 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM205-209ENST00000588321 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM205-209ENST00000588321 ARHGEF11O15085 1522 aa28.66■■■□□ 2.18
TMEM205-209ENST00000588321 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.65■■■□□ 2.18
TMEM205-209ENST00000588321 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
TMEM205-209ENST00000588321 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
TMEM205-209ENST00000588321 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.59■■■□□ 2.17
TMEM205-209ENST00000588321 FBLN2P98095 1184 aa28.56■■■□□ 2.16
TMEM205-209ENST00000588321 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TMEM205-209ENST00000588321 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TMEM205-209ENST00000588321 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.46■■■□□ 2.15
TMEM205-209ENST00000588321 SOGA1O94964 1423 aa28.44■■■□□ 2.14
TMEM205-209ENST00000588321 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TMEM205-209ENST00000588321 ARAP1Q96P48 1450 aa28.39■■■□□ 2.14
TMEM205-209ENST00000588321 CHD1O14646 1710 aa28.38■■■□□ 2.13
TMEM205-209ENST00000588321 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TMEM205-209ENST00000588321 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM205-209ENST00000588321 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TMEM205-209ENST00000588321 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM205-209ENST00000588321 CUX1P39880 1505 aa28.22■■■□□ 2.11
TMEM205-209ENST00000588321 GRIN2BQ13224 1484 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM205-209ENST00000588321 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
TMEM205-209ENST00000588321 WDR97A6NE52 1622 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM205-209ENST00000588321 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM205-209ENST00000588321 SYNJ2O15056 1496 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM205-209ENST00000588321 SYNJ1O43426 1573 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM205-209ENST00000588321 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.05■■■□□ 2.08
TMEM205-209ENST00000588321 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.96■■■□□ 2.07
TMEM205-209ENST00000588321 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TMEM205-209ENST00000588321 PBRM1Q86U86 1689 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM205-209ENST00000588321 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM205-209ENST00000588321 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
TMEM205-209ENST00000588321 GRIN2AQ12879 1464 aa27.81■■■□□ 2.04
TMEM205-209ENST00000588321 NUP160Q12769 1436 aa27.74■■■□□ 2.03
TMEM205-209ENST00000588321 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.73■■■□□ 2.03
TMEM205-209ENST00000588321 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
TMEM205-209ENST00000588321 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.7■■■□□ 2.02
TMEM205-209ENST00000588321 ADAMTS12P58397 1594 aa27.69■■■□□ 2.02
TMEM205-209ENST00000588321 CEP170Q5SW79 1584 aa27.68■■■□□ 2.02
TMEM205-209ENST00000588321 TOP2BQ02880 1626 aa27.64■■■□□ 2.02
TMEM205-209ENST00000588321 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.6■■■□□ 2.01
TMEM205-209ENST00000588321 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.57■■■□□ 2
TMEM205-209ENST00000588321 SHROOM2Q13796 1616 aa27.54■■■□□ 2
TMEM205-209ENST00000588321 JPH4Q96JJ6 628 aa27.53■■■□□ 2
TMEM205-209ENST00000588321 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TMEM205-209ENST00000588321 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 314 ms