RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582246.1

SKAP1-AS1-201, SKAP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SKAP1-AS1, Length 687 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.85■■■□□ 2.37
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.62■■□□□ 1.85
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ABCC9O60706 1549 aa26.11■■□□□ 1.77
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.79■■□□□ 1.72
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.07■■□□□ 1.6
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NACADO15069 1562 aa25.01■■□□□ 1.59
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.92■■□□□ 1.58
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.8■■□□□ 1.56
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.67■■□□□ 1.54
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.58■■□□□ 1.53
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.33■■□□□ 1.48
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SCRIBQ14160 1630 aa24.31■■□□□ 1.48
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.03■■□□□ 1.44
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.98■■□□□ 1.43
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.63■■□□□ 1.37
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.45■■□□□ 1.34
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SMARCA4P51532 1647 aa23.22■■□□□ 1.31
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.07■■□□□ 1.28
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SMARCA2P51531 1590 aa23.05■■□□□ 1.28
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NCAPD3P42695 1498 aa23.04■■□□□ 1.28
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.01■■□□□ 1.27
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 HMGXB3Q12766 1538 aa22.98■■□□□ 1.27
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.97■■□□□ 1.27
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 WIZO95785 1651 aa22.8■■□□□ 1.24
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NESP48681 1621 aa22.57■■□□□ 1.2
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ERCC6Q03468 1493 aa22.51■■□□□ 1.19
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.49■■□□□ 1.19
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.36■■□□□ 1.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.36■■□□□ 1.17
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.3■■□□□ 1.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CUX2O14529 1486 aa22.28■■□□□ 1.16
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.23■■□□□ 1.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CFTRP13569 1480 aa22.23■■□□□ 1.15
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PRDM2Q13029 1718 aa22.17■■□□□ 1.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.15■■□□□ 1.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.15■■□□□ 1.14
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.12■■□□□ 1.13
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 WDR62O43379 1518 aa22.07■■□□□ 1.12
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TOPBP1Q92547 1522 aa21.8■■□□□ 1.08
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.78■■□□□ 1.08
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ABCC8Q09428 1581 aa21.74■■□□□ 1.07
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 IFT140Q96RY7 1462 aa21.65■■□□□ 1.06
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.63■■□□□ 1.05
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CUX1P39880 1505 aa21.61■■□□□ 1.05
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.54■■□□□ 1.04
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.51■■□□□ 1.03
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SOGA1O94964 1423 aa21.46■■□□□ 1.03
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 WDR97A6NE52 1622 aa21.43■■□□□ 1.02
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.42■■□□□ 1.02
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SYNJ1O43426 1573 aa21.41■■□□□ 1.02
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TOP2BQ02880 1626 aa21.4■■□□□ 1.02
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.31■■□□□ 1
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CHD1O14646 1710 aa21.31■■□□□ 1
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PBRM1Q86U86 1689 aa21.29■■□□□ 1
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.29■■□□□ 1
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.27■■□□□ 1
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 OSCARQ8IYS5 282 aa21.27■■□□□ 1
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 GRIN2BQ13224 1484 aa21.25■□□□□ 0.99
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.25■□□□□ 0.99
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 FBLN2P98095 1184 aa21.17■□□□□ 0.98
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.17■□□□□ 0.98
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 SYNJ2O15056 1496 aa21.13■□□□□ 0.97
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ADAMTS12P58397 1594 aa21.1■□□□□ 0.97
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.06■□□□□ 0.96
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.06■□□□□ 0.96
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.06■□□□□ 0.96
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.06■□□□□ 0.96
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ARHGEF11O15085 1522 aa21.03■□□□□ 0.96
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.03■□□□□ 0.96
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 GRIN2AQ12879 1464 aa21■□□□□ 0.95
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.98■□□□□ 0.95
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 KIF27Q86VH2 1401 aa20.95■□□□□ 0.95
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 TRIM41Q8WV44 630 aa20.94■□□□□ 0.94
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CEP170Q5SW79 1584 aa20.93■□□□□ 0.94
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 NUP160Q12769 1436 aa20.89■□□□□ 0.94
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 CUL7Q14999 1698 aa20.89■□□□□ 0.93
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 ARAP1Q96P48 1450 aa20.85■□□□□ 0.93
SKAP1-AS1-201ENST00000582246 IGF1RP08069 1367 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms