RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576323.1

SLC13A5-212, Transcript of solute carrier family 13 member 5, humanhuman

TSL 4

Gene SLC13A5, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A5-212ENST00000576323 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.52■■■■■ 4.08
SLC13A5-212ENST00000576323 ABCC9O60706 1549 aa37.07■■■■□ 3.53
SLC13A5-212ENST00000576323 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.46■■■■□ 3.43
SLC13A5-212ENST00000576323 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.3■■■■□ 3.24
SLC13A5-212ENST00000576323 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.04■■■■□ 3.2
SLC13A5-212ENST00000576323 NACADO15069 1562 aa34.68■■■■□ 3.14
SLC13A5-212ENST00000576323 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.63■■■■□ 3.13
SLC13A5-212ENST00000576323 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.53■■■■□ 3.12
SLC13A5-212ENST00000576323 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.1■■■■□ 3.05
SLC13A5-212ENST00000576323 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.04■■■■□ 3.04
SLC13A5-212ENST00000576323 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.98■■■■□ 3.03
SLC13A5-212ENST00000576323 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.5■■■□□ 2.95
SLC13A5-212ENST00000576323 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.45■■■□□ 2.95
SLC13A5-212ENST00000576323 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
SLC13A5-212ENST00000576323 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.42■■■□□ 2.94
SLC13A5-212ENST00000576323 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.4■■■□□ 2.94
SLC13A5-212ENST00000576323 SCRIBQ14160 1630 aa33.22■■■□□ 2.91
SLC13A5-212ENST00000576323 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
SLC13A5-212ENST00000576323 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.82■■■□□ 2.84
SLC13A5-212ENST00000576323 CUX2O14529 1486 aa32.14■■■□□ 2.74
SLC13A5-212ENST00000576323 NCAPD3P42695 1498 aa32.08■■■□□ 2.73
SLC13A5-212ENST00000576323 ERCC6Q03468 1493 aa32.05■■■□□ 2.72
SLC13A5-212ENST00000576323 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.88■■■□□ 2.69
SLC13A5-212ENST00000576323 SMARCA2P51531 1590 aa31.74■■■□□ 2.67
SLC13A5-212ENST00000576323 HMGXB3Q12766 1538 aa31.7■■■□□ 2.66
SLC13A5-212ENST00000576323 NESP48681 1621 aa31.68■■■□□ 2.66
SLC13A5-212ENST00000576323 SMARCA4P51532 1647 aa31.65■■■□□ 2.66
SLC13A5-212ENST00000576323 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
SLC13A5-212ENST00000576323 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
SLC13A5-212ENST00000576323 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
SLC13A5-212ENST00000576323 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.36■■■□□ 2.61
SLC13A5-212ENST00000576323 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.34■■■□□ 2.61
SLC13A5-212ENST00000576323 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.3■■■□□ 2.6
SLC13A5-212ENST00000576323 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.2■■■□□ 2.58
SLC13A5-212ENST00000576323 TRIM41Q8WV44 630 aa31.16■■■□□ 2.58
SLC13A5-212ENST00000576323 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.16■■■□□ 2.58
SLC13A5-212ENST00000576323 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.11■■■□□ 2.57
SLC13A5-212ENST00000576323 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.98■■■□□ 2.55
SLC13A5-212ENST00000576323 WDR62O43379 1518 aa30.87■■■□□ 2.53
SLC13A5-212ENST00000576323 WIZO95785 1651 aa30.77■■■□□ 2.52
SLC13A5-212ENST00000576323 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.76■■■□□ 2.52
SLC13A5-212ENST00000576323 OSCARQ8IYS5 282 aa30.75■■■□□ 2.51
SLC13A5-212ENST00000576323 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.7■■■□□ 2.51
SLC13A5-212ENST00000576323 CFTRP13569 1480 aa30.6■■■□□ 2.49
SLC13A5-212ENST00000576323 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
SLC13A5-212ENST00000576323 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
SLC13A5-212ENST00000576323 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SLC13A5-212ENST00000576323 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.19■■■□□ 2.42
SLC13A5-212ENST00000576323 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.19■■■□□ 2.42
SLC13A5-212ENST00000576323 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.19■■■□□ 2.42
SLC13A5-212ENST00000576323 IFT140Q96RY7 1462 aa30.19■■■□□ 2.42
SLC13A5-212ENST00000576323 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SLC13A5-212ENST00000576323 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.09■■■□□ 2.41
SLC13A5-212ENST00000576323 ARHGEF11O15085 1522 aa30.08■■■□□ 2.41
SLC13A5-212ENST00000576323 PRDM2Q13029 1718 aa30.07■■■□□ 2.4
SLC13A5-212ENST00000576323 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.06■■■□□ 2.4
SLC13A5-212ENST00000576323 TOPBP1Q92547 1522 aa30.05■■■□□ 2.4
SLC13A5-212ENST00000576323 ABCC8Q09428 1581 aa30.01■■■□□ 2.39
SLC13A5-212ENST00000576323 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
SLC13A5-212ENST00000576323 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.382e-8■■■■■ 46
SLC13A5-212ENST00000576323 FBLN2P98095 1184 aa29.89■■■□□ 2.38
SLC13A5-212ENST00000576323 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
SLC13A5-212ENST00000576323 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC13A5-212ENST00000576323 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
SLC13A5-212ENST00000576323 CHD1O14646 1710 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC13A5-212ENST00000576323 ARAP1Q96P48 1450 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC13A5-212ENST00000576323 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
SLC13A5-212ENST00000576323 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
SLC13A5-212ENST00000576323 SOGA1O94964 1423 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC13A5-212ENST00000576323 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.64■■■□□ 2.34
SLC13A5-212ENST00000576323 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
SLC13A5-212ENST00000576323 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC13A5-212ENST00000576323 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.45■■■□□ 2.31
SLC13A5-212ENST00000576323 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC13A5-212ENST00000576323 WDR97A6NE52 1622 aa29.42■■■□□ 2.3
SLC13A5-212ENST00000576323 SYNJ1O43426 1573 aa29.42■■■□□ 2.3
SLC13A5-212ENST00000576323 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SLC13A5-212ENST00000576323 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SLC13A5-212ENST00000576323 GRIN2BQ13224 1484 aa29.4■■■□□ 2.3
SLC13A5-212ENST00000576323 SYNJ2O15056 1496 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC13A5-212ENST00000576323 CUX1P39880 1505 aa29.32■■■□□ 2.28
SLC13A5-212ENST00000576323 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.24■■■□□ 2.27
SLC13A5-212ENST00000576323 PBRM1Q86U86 1689 aa29.11■■■□□ 2.25
SLC13A5-212ENST00000576323 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.1■■■□□ 2.25
SLC13A5-212ENST00000576323 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.01■■■□□ 2.23
SLC13A5-212ENST00000576323 GRIN2AQ12879 1464 aa28.99■■■□□ 2.23
SLC13A5-212ENST00000576323 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.96■■■□□ 2.23
SLC13A5-212ENST00000576323 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
SLC13A5-212ENST00000576323 NUP160Q12769 1436 aa28.92■■■□□ 2.22
SLC13A5-212ENST00000576323 CEP170Q5SW79 1584 aa28.89■■■□□ 2.22
SLC13A5-212ENST00000576323 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC13A5-212ENST00000576323 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
SLC13A5-212ENST00000576323 ADAMTS12P58397 1594 aa28.83■■■□□ 2.21
SLC13A5-212ENST00000576323 SHROOM2Q13796 1616 aa28.77■■■□□ 2.2
SLC13A5-212ENST00000576323 JPH4Q96JJ6 628 aa28.77■■■□□ 2.2
SLC13A5-212ENST00000576323 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
SLC13A5-212ENST00000576323 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.71■■■□□ 2.19
SLC13A5-212ENST00000576323 TOP2BQ02880 1626 aa28.71■■■□□ 2.19
SLC13A5-212ENST00000576323 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
SLC13A5-212ENST00000576323 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.68■■■□□ 2.18
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