RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575212.1

NPTX1-204, Transcript of neuronal pentraxin 1, humanhuman

TSL 4

Gene NPTX1, Length 472 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1-204ENST00000575212 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.12■■■■■ 6.57
NPTX1-204ENST00000575212 ABCC9O60706 1549 aa52.4■■■■■ 5.98
NPTX1-204ENST00000575212 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.95■■■■■ 5.75
NPTX1-204ENST00000575212 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.36■■■■■ 5.65
NPTX1-204ENST00000575212 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.2■■■■■ 5.47
NPTX1-204ENST00000575212 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.6■■■■■ 5.37
NPTX1-204ENST00000575212 NACADO15069 1562 aa48.48■■■■■ 5.35
NPTX1-204ENST00000575212 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.17■■■■■ 5.3
NPTX1-204ENST00000575212 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.16■■■■■ 5.3
NPTX1-204ENST00000575212 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.81■■■■■ 5.24
NPTX1-204ENST00000575212 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.32■■■■■ 5.17
NPTX1-204ENST00000575212 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.25■■■■■ 5.16
NPTX1-204ENST00000575212 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.24■■■■■ 5.15
NPTX1-204ENST00000575212 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.21■■■■■ 5.15
NPTX1-204ENST00000575212 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.9■■■■■ 5.1
NPTX1-204ENST00000575212 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
NPTX1-204ENST00000575212 SCRIBQ14160 1630 aa46.46■■■■■ 5.03
NPTX1-204ENST00000575212 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.19■■■■■ 4.99
NPTX1-204ENST00000575212 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.18■■■■■ 4.98
NPTX1-204ENST00000575212 CUX2O14529 1486 aa45.63■■■■■ 4.9
NPTX1-204ENST00000575212 ERCC6Q03468 1493 aa45.36■■■■■ 4.85
NPTX1-204ENST00000575212 NCAPD3P42695 1498 aa44.75■■■■■ 4.75
NPTX1-204ENST00000575212 TRIM41Q8WV44 630 aa44.73■■■■■ 4.75
NPTX1-204ENST00000575212 NESP48681 1621 aa44.62■■■■■ 4.73
NPTX1-204ENST00000575212 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.47■■■■■ 4.71
NPTX1-204ENST00000575212 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
NPTX1-204ENST00000575212 HMGXB3Q12766 1538 aa44.31■■■■■ 4.68
NPTX1-204ENST00000575212 SMARCA2P51531 1590 aa44.27■■■■■ 4.68
NPTX1-204ENST00000575212 SMARCA4P51532 1647 aa44.1■■■■■ 4.65
NPTX1-204ENST00000575212 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.02■■■■■ 4.64
NPTX1-204ENST00000575212 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
NPTX1-204ENST00000575212 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.01■■■■■ 4.64
NPTX1-204ENST00000575212 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.82■■■■■ 4.6
NPTX1-204ENST00000575212 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
NPTX1-204ENST00000575212 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.59■■■■■ 4.57
NPTX1-204ENST00000575212 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.53■■■■■ 4.56
NPTX1-204ENST00000575212 WDR62O43379 1518 aa43.45■■■■■ 4.55
NPTX1-204ENST00000575212 OSCARQ8IYS5 282 aa43.37■■■■■ 4.53
NPTX1-204ENST00000575212 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.37■■■■■ 4.53
NPTX1-204ENST00000575212 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.26■■■■■ 4.52
NPTX1-204ENST00000575212 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.1■■■■■ 4.49
NPTX1-204ENST00000575212 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43■■■■■ 4.47
NPTX1-204ENST00000575212 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43■■■■■ 4.47
NPTX1-204ENST00000575212 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43■■■■■ 4.47
NPTX1-204ENST00000575212 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.93■■■■■ 4.46
NPTX1-204ENST00000575212 WIZO95785 1651 aa42.73■■■■■ 4.43
NPTX1-204ENST00000575212 ARHGEF11O15085 1522 aa42.69■■■■■ 4.42
NPTX1-204ENST00000575212 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
NPTX1-204ENST00000575212 CFTRP13569 1480 aa42.56■■■■■ 4.4
NPTX1-204ENST00000575212 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
NPTX1-204ENST00000575212 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.53■■■■■ 4.4
NPTX1-204ENST00000575212 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
NPTX1-204ENST00000575212 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
NPTX1-204ENST00000575212 IFT140Q96RY7 1462 aa42.25■■■■■ 4.35
NPTX1-204ENST00000575212 ARAP1Q96P48 1450 aa42.17■■■■■ 4.34
NPTX1-204ENST00000575212 PRDM2Q13029 1718 aa42.11■■■■■ 4.33
NPTX1-204ENST00000575212 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
NPTX1-204ENST00000575212 CHD1O14646 1710 aa42.07■■■■■ 4.33
NPTX1-204ENST00000575212 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
NPTX1-204ENST00000575212 TOPBP1Q92547 1522 aa41.95■■■■■ 4.31
NPTX1-204ENST00000575212 FBLN2P98095 1184 aa41.93■■■■■ 4.3
NPTX1-204ENST00000575212 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
NPTX1-204ENST00000575212 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
NPTX1-204ENST00000575212 ABCC8Q09428 1581 aa41.71■■■■■ 4.27
NPTX1-204ENST00000575212 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
NPTX1-204ENST00000575212 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.67■■■■■ 4.26
NPTX1-204ENST00000575212 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.58■■■■■ 4.25
NPTX1-204ENST00000575212 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.46■■■■■ 4.23
NPTX1-204ENST00000575212 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
NPTX1-204ENST00000575212 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
NPTX1-204ENST00000575212 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.35■■■■■ 4.21
NPTX1-204ENST00000575212 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.35■■■■■ 4.21
NPTX1-204ENST00000575212 SYNJ1O43426 1573 aa41.34■■■■■ 4.21
NPTX1-204ENST00000575212 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
NPTX1-204ENST00000575212 SOGA1O94964 1423 aa41.23■■■■■ 4.19
NPTX1-204ENST00000575212 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.16■■■■■ 4.18
NPTX1-204ENST00000575212 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
NPTX1-204ENST00000575212 WDR97A6NE52 1622 aa41.07■■■■■ 4.17
NPTX1-204ENST00000575212 SYNJ2O15056 1496 aa41.02■■■■■ 4.16
NPTX1-204ENST00000575212 GRIN2BQ13224 1484 aa41.01■■■■■ 4.16
NPTX1-204ENST00000575212 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.99■■■■■ 4.15
NPTX1-204ENST00000575212 PBRM1Q86U86 1689 aa40.82■■■■■ 4.13
NPTX1-204ENST00000575212 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.78■■■■■ 4.12
NPTX1-204ENST00000575212 CUX1P39880 1505 aa40.73■■■■■ 4.11
NPTX1-204ENST00000575212 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.69■■■■■ 4.1
NPTX1-204ENST00000575212 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
NPTX1-204ENST00000575212 CEP170Q5SW79 1584 aa40.56■■■■■ 4.08
NPTX1-204ENST00000575212 GRIN2AQ12879 1464 aa40.49■■■■■ 4.07
NPTX1-204ENST00000575212 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.49■■■■■ 4.07
NPTX1-204ENST00000575212 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.39■■■■■ 4.06
NPTX1-204ENST00000575212 NUP160Q12769 1436 aa40.36■■■■■ 4.05
NPTX1-204ENST00000575212 SHROOM2Q13796 1616 aa40.36■■■■■ 4.05
NPTX1-204ENST00000575212 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.36■■■■■ 4.05
NPTX1-204ENST00000575212 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.32■■■■■ 4.05
NPTX1-204ENST00000575212 ADAMTS12P58397 1594 aa40.3■■■■■ 4.04
NPTX1-204ENST00000575212 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.21■■■■■ 4.03
NPTX1-204ENST00000575212 KDM6BO15054 1643 aa40.17■■■■■ 4.02
NPTX1-204ENST00000575212 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
NPTX1-204ENST00000575212 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.12■■■■■ 4.01
NPTX1-204ENST00000575212 DIP2BQ9P265 1576 aa40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms