RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571185.1

ITGAE-204, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 3

Gene ITGAE, Length 1,004 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-204ENST00000571185 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.8■■■■□ 3.64
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ITGAE-204ENST00000571185 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.04■■■□□ 2.72
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ITGAE-204ENST00000571185 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.64■■■□□ 2.66
ITGAE-204ENST00000571185 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.61■■■□□ 2.65
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ITGAE-204ENST00000571185 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.33■■■□□ 2.61
ITGAE-204ENST00000571185 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.33■■■□□ 2.61
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ITGAE-204ENST00000571185 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.78■■■□□ 2.52
ITGAE-204ENST00000571185 SCRIBQ14160 1630 aa30.75■■■□□ 2.51
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ITGAE-204ENST00000571185 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.25■■■□□ 2.43
ITGAE-204ENST00000571185 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.08■■■□□ 2.41
ITGAE-204ENST00000571185 NCAPD3P42695 1498 aa29.43■■■□□ 2.3
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ITGAE-204ENST00000571185 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ITGAE-204ENST00000571185 SMARCA2P51531 1590 aa29.34■■■□□ 2.29
ITGAE-204ENST00000571185 HMGXB3Q12766 1538 aa29.27■■■□□ 2.28
ITGAE-204ENST00000571185 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.21■■■□□ 2.27
ITGAE-204ENST00000571185 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
ITGAE-204ENST00000571185 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.09■■■□□ 2.25
ITGAE-204ENST00000571185 ERCC6Q03468 1493 aa28.84■■■□□ 2.21
ITGAE-204ENST00000571185 NESP48681 1621 aa28.77■■■□□ 2.2
ITGAE-204ENST00000571185 WIZO95785 1651 aa28.77■■■□□ 2.2
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ITGAE-204ENST00000571185 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.75■■■□□ 2.19
ITGAE-204ENST00000571185 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
ITGAE-204ENST00000571185 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.53■■■□□ 2.16
ITGAE-204ENST00000571185 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.52■■■□□ 2.16
ITGAE-204ENST00000571185 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ITGAE-204ENST00000571185 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.49■■■□□ 2.15
ITGAE-204ENST00000571185 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
ITGAE-204ENST00000571185 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.31■■■□□ 2.12
ITGAE-204ENST00000571185 CFTRP13569 1480 aa28.28■■■□□ 2.12
ITGAE-204ENST00000571185 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.25■■■□□ 2.11
ITGAE-204ENST00000571185 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.21■■■□□ 2.11
ITGAE-204ENST00000571185 WDR62O43379 1518 aa28.2■■■□□ 2.1
ITGAE-204ENST00000571185 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
ITGAE-204ENST00000571185 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.19■■■□□ 2.1
ITGAE-204ENST00000571185 PRDM2Q13029 1718 aa28.12■■■□□ 2.09
ITGAE-204ENST00000571185 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.09■■■□□ 2.09
ITGAE-204ENST00000571185 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ITGAE-204ENST00000571185 ABCC8Q09428 1581 aa27.73■■■□□ 2.03
ITGAE-204ENST00000571185 TOPBP1Q92547 1522 aa27.7■■■□□ 2.02
ITGAE-204ENST00000571185 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.65■■■□□ 2.02
ITGAE-204ENST00000571185 IFT140Q96RY7 1462 aa27.64■■■□□ 2.02
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ITGAE-204ENST00000571185 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.29■■□□□ 1.96
ITGAE-204ENST00000571185 WDR97A6NE52 1622 aa27.29■■□□□ 1.96
ITGAE-204ENST00000571185 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
ITGAE-204ENST00000571185 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.27■■□□□ 1.96
ITGAE-204ENST00000571185 CHD1O14646 1710 aa27.17■■□□□ 1.94
ITGAE-204ENST00000571185 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
ITGAE-204ENST00000571185 TRIM41Q8WV44 630 aa27.09■■□□□ 1.93
ITGAE-204ENST00000571185 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 GRIN2BQ13224 1484 aa27.06■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.05■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.05■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.05■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.05■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.04■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.04■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 TOP2BQ02880 1626 aa27.02■■□□□ 1.92
ITGAE-204ENST00000571185 SYNJ1O43426 1573 aa27.02■■□□□ 1.92
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ITGAE-204ENST00000571185 FBLN2P98095 1184 aa26.99■■□□□ 1.91
ITGAE-204ENST00000571185 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.99■■□□□ 1.91
ITGAE-204ENST00000571185 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.98■■□□□ 1.91
ITGAE-204ENST00000571185 SYNJ2O15056 1496 aa26.93■■□□□ 1.9
ITGAE-204ENST00000571185 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ITGAE-204ENST00000571185 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.87■■□□□ 1.89
ITGAE-204ENST00000571185 ADAMTS12P58397 1594 aa26.74■■□□□ 1.87
ITGAE-204ENST00000571185 ARAP1Q96P48 1450 aa26.74■■□□□ 1.87
ITGAE-204ENST00000571185 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.73■■□□□ 1.87
ITGAE-204ENST00000571185 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.71■■□□□ 1.87
ITGAE-204ENST00000571185 GRIN2AQ12879 1464 aa26.7■■□□□ 1.87
ITGAE-204ENST00000571185 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.67■■□□□ 1.86
ITGAE-204ENST00000571185 NUP160Q12769 1436 aa26.61■■□□□ 1.85
ITGAE-204ENST00000571185 CEP170Q5SW79 1584 aa26.58■■□□□ 1.85
ITGAE-204ENST00000571185 SHROOM2Q13796 1616 aa26.5■■□□□ 1.83
ITGAE-204ENST00000571185 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.48■■□□□ 1.83
ITGAE-204ENST00000571185 KIF27Q86VH2 1401 aa26.48■■□□□ 1.83
ITGAE-204ENST00000571185 CUL7Q14999 1698 aa26.42■■□□□ 1.82
ITGAE-204ENST00000571185 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.4■■□□□ 1.82
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ITGAE-204ENST00000571185 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.36■■□□□ 1.81
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