RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-202ENST00000570641 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.15■■■■■ 4.34
SPNS2-202ENST00000570641 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.14■■■■□ 3.54
SPNS2-202ENST00000570641 ABCC9O60706 1549 aa35.39■■■■□ 3.26
SPNS2-202ENST00000570641 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
SPNS2-202ENST00000570641 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.94■■■■□ 3.18
SPNS2-202ENST00000570641 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.84■■■■□ 3.17
SPNS2-202ENST00000570641 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.73■■■■□ 3.15
SPNS2-202ENST00000570641 NACADO15069 1562 aa34.66■■■■□ 3.14
SPNS2-202ENST00000570641 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.49■■■■□ 3.11
SPNS2-202ENST00000570641 SCRIBQ14160 1630 aa33.93■■■■□ 3.02
SPNS2-202ENST00000570641 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.86■■■■□ 3.01
SPNS2-202ENST00000570641 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.76■■■■□ 3
SPNS2-202ENST00000570641 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.38■■■□□ 2.93
SPNS2-202ENST00000570641 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.19■■■□□ 2.9
SPNS2-202ENST00000570641 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.17■■■□□ 2.9
SPNS2-202ENST00000570641 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.71■■■□□ 2.83
SPNS2-202ENST00000570641 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
SPNS2-202ENST00000570641 SMARCA4P51532 1647 aa32.54■■■□□ 2.8
SPNS2-202ENST00000570641 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.49■■■□□ 2.79
SPNS2-202ENST00000570641 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
SPNS2-202ENST00000570641 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
SPNS2-202ENST00000570641 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
SPNS2-202ENST00000570641 WIZO95785 1651 aa32.24■■■□□ 2.75
SPNS2-202ENST00000570641 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.19■■■□□ 2.74
SPNS2-202ENST00000570641 SMARCA2P51531 1590 aa32.14■■■□□ 2.74
SPNS2-202ENST00000570641 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.1■■■□□ 2.73
SPNS2-202ENST00000570641 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.08■■■□□ 2.73
SPNS2-202ENST00000570641 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
SPNS2-202ENST00000570641 NCAPD3P42695 1498 aa31.93■■■□□ 2.7
SPNS2-202ENST00000570641 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
SPNS2-202ENST00000570641 HMGXB3Q12766 1538 aa31.9■■■□□ 2.7
SPNS2-202ENST00000570641 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS2-202ENST00000570641 CFTRP13569 1480 aa31.07■■■□□ 2.56
SPNS2-202ENST00000570641 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.05■■■□□ 2.56
SPNS2-202ENST00000570641 PRDM2Q13029 1718 aa31.03■■■□□ 2.56
SPNS2-202ENST00000570641 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31■■■□□ 2.55
SPNS2-202ENST00000570641 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.89■■■□□ 2.54
SPNS2-202ENST00000570641 NESP48681 1621 aa30.88■■■□□ 2.53
SPNS2-202ENST00000570641 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.73■■■□□ 2.51
SPNS2-202ENST00000570641 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.71■■■□□ 2.51
SPNS2-202ENST00000570641 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.71■■■□□ 2.51
SPNS2-202ENST00000570641 ABCC8Q09428 1581 aa30.67■■■□□ 2.5
SPNS2-202ENST00000570641 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.62■■■□□ 2.49
SPNS2-202ENST00000570641 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.61■■■□□ 2.49
SPNS2-202ENST00000570641 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.49
SPNS2-202ENST00000570641 TRIM41Q8WV44 630 aa30.5■■■□□ 2.47
SPNS2-202ENST00000570641 SYNJ1O43426 1573 aa30.47■■■□□ 2.47
SPNS2-202ENST00000570641 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.46■■■□□ 2.47
SPNS2-202ENST00000570641 ERCC6Q03468 1493 aa30.45■■■□□ 2.47
SPNS2-202ENST00000570641 TOP2BQ02880 1626 aa30.45■■■□□ 2.47
SPNS2-202ENST00000570641 CUX1P39880 1505 aa30.44■■■□□ 2.46
SPNS2-202ENST00000570641 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.4■■■□□ 2.46
SPNS2-202ENST00000570641 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.37■■■□□ 2.45
SPNS2-202ENST00000570641 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
SPNS2-202ENST00000570641 TOPBP1Q92547 1522 aa30.33■■■□□ 2.45
SPNS2-202ENST00000570641 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
SPNS2-202ENST00000570641 WDR62O43379 1518 aa30.22■■■□□ 2.43
SPNS2-202ENST00000570641 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.19■■■□□ 2.42
SPNS2-202ENST00000570641 CUX2O14529 1486 aa30.16■■■□□ 2.42
SPNS2-202ENST00000570641 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SPNS2-202ENST00000570641 SOGA1O94964 1423 aa30.02■■■□□ 2.4
SPNS2-202ENST00000570641 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.97■■■□□ 2.39
SPNS2-202ENST00000570641 EEA1Q15075 1411 aa29.96■■■□□ 2.39
SPNS2-202ENST00000570641 WDR97A6NE52 1622 aa29.95■■■□□ 2.38
SPNS2-202ENST00000570641 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.95■■■□□ 2.38
SPNS2-202ENST00000570641 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SPNS2-202ENST00000570641 IFT140Q96RY7 1462 aa29.92■■■□□ 2.38
SPNS2-202ENST00000570641 KIF27Q86VH2 1401 aa29.88■■■□□ 2.37
SPNS2-202ENST00000570641 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.86■■■□□ 2.37
SPNS2-202ENST00000570641 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
SPNS2-202ENST00000570641 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.77■■■□□ 2.36
SPNS2-202ENST00000570641 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.74■■■□□ 2.35
SPNS2-202ENST00000570641 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SPNS2-202ENST00000570641 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.7■■■□□ 2.35
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SPNS2-202ENST00000570641 PBRM1Q86U86 1689 aa29.65■■■□□ 2.34
SPNS2-202ENST00000570641 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
SPNS2-202ENST00000570641 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
SPNS2-202ENST00000570641 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.62■■■□□ 2.33
SPNS2-202ENST00000570641 IGF1RP08069 1367 aa29.61■■■□□ 2.33
SPNS2-202ENST00000570641 KIF21BO75037 1637 aa29.59■■■□□ 2.33
SPNS2-202ENST00000570641 CUL7Q14999 1698 aa29.57■■■□□ 2.32
SPNS2-202ENST00000570641 GRIN2BQ13224 1484 aa29.57■■■□□ 2.32
SPNS2-202ENST00000570641 PRXQ9BXM0 1461 aa29.52■■■□□ 2.32
SPNS2-202ENST00000570641 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.49■■■□□ 2.31
SPNS2-202ENST00000570641 GOLGA3Q08378 1498 aa29.48■■■□□ 2.31
SPNS2-202ENST00000570641 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.43■■■□□ 2.3
SPNS2-202ENST00000570641 ADAMTS12P58397 1594 aa29.43■■■□□ 2.3
SPNS2-202ENST00000570641 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS2-202ENST00000570641 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.4■■■□□ 2.3
SPNS2-202ENST00000570641 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
SPNS2-202ENST00000570641 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.39■■■□□ 2.3
SPNS2-202ENST00000570641 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.38■■■□□ 2.29
SPNS2-202ENST00000570641 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
SPNS2-202ENST00000570641 SYNJ2O15056 1496 aa29.27■■■□□ 2.28
SPNS2-202ENST00000570641 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.26■■■□□ 2.27
SPNS2-202ENST00000570641 GRIN2AQ12879 1464 aa29.19■■■□□ 2.26
SPNS2-202ENST00000570641 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.18■■■□□ 2.26
SPNS2-202ENST00000570641 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
SPNS2-202ENST00000570641 CHD1O14646 1710 aa29.14■■■□□ 2.25
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