RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569332.5

WWOX-215, Transcript of WW domain containing oxidoreductase, humanhuman

TSL 2

Gene WWOX, Length 1,856 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWOX-215ENST00000569332 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.17■■■■■ 6.26
WWOX-215ENST00000569332 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.18■■■■■ 5.14
WWOX-215ENST00000569332 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
WWOX-215ENST00000569332 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.85■■■■■ 4.77
WWOX-215ENST00000569332 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.74■■■■■ 4.75
WWOX-215ENST00000569332 ABCC9O60706 1549 aa44.72■■■■■ 4.75
WWOX-215ENST00000569332 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.31■■■■■ 4.68
WWOX-215ENST00000569332 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.19■■■■■ 4.66
WWOX-215ENST00000569332 NACADO15069 1562 aa43.96■■■■■ 4.63
WWOX-215ENST00000569332 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.6■■■■■ 4.57
WWOX-215ENST00000569332 SCRIBQ14160 1630 aa43.48■■■■■ 4.55
WWOX-215ENST00000569332 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.75■■■■■ 4.43
WWOX-215ENST00000569332 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
WWOX-215ENST00000569332 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.31■■■■■ 4.36
WWOX-215ENST00000569332 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.21■■■■■ 4.35
WWOX-215ENST00000569332 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.15■■■■■ 4.34
WWOX-215ENST00000569332 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
WWOX-215ENST00000569332 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.89■■■■■ 4.3
WWOX-215ENST00000569332 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
WWOX-215ENST00000569332 SMARCA4P51532 1647 aa41.64■■■■■ 4.26
WWOX-215ENST00000569332 WIZO95785 1651 aa41.55■■■■■ 4.24
WWOX-215ENST00000569332 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.1■■■■■ 4.17
WWOX-215ENST00000569332 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
WWOX-215ENST00000569332 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
WWOX-215ENST00000569332 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.97■■■■■ 4.15
WWOX-215ENST00000569332 SMARCA2P51531 1590 aa40.92■■■■■ 4.14
WWOX-215ENST00000569332 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.77■■■■■ 4.12
WWOX-215ENST00000569332 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
WWOX-215ENST00000569332 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.7■■■■■ 4.11
WWOX-215ENST00000569332 NCAPD3P42695 1498 aa40.59■■■■■ 4.09
WWOX-215ENST00000569332 HMGXB3Q12766 1538 aa40.52■■■■■ 4.08
WWOX-215ENST00000569332 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.44■■■■■ 4.06
WWOX-215ENST00000569332 TRIM41Q8WV44 630 aa40.05■■■■■ 4
WWOX-215ENST00000569332 ABCC8Q09428 1581 aa39.87■■■■□ 3.97
WWOX-215ENST00000569332 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.77■■■■□ 3.96
WWOX-215ENST00000569332 CFTRP13569 1480 aa39.71■■■■□ 3.95
WWOX-215ENST00000569332 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.58■■■■□ 3.93
WWOX-215ENST00000569332 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.57■■■■□ 3.93
WWOX-215ENST00000569332 PRDM2Q13029 1718 aa39.46■■■■□ 3.91
WWOX-215ENST00000569332 SYNJ1O43426 1573 aa39.43■■■■□ 3.9
WWOX-215ENST00000569332 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
WWOX-215ENST00000569332 NESP48681 1621 aa39.27■■■■□ 3.88
WWOX-215ENST00000569332 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.26■■■■□ 3.88
WWOX-215ENST00000569332 TOP2BQ02880 1626 aa39.23■■■■□ 3.87
WWOX-215ENST00000569332 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.2■■■■□ 3.87
WWOX-215ENST00000569332 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.18■■■■□ 3.86
WWOX-215ENST00000569332 CUX1P39880 1505 aa39.16■■■■□ 3.86
WWOX-215ENST00000569332 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.15■■■■□ 3.86
WWOX-215ENST00000569332 SOGA1O94964 1423 aa39.13■■■■□ 3.85
WWOX-215ENST00000569332 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.99■■■■□ 3.83
WWOX-215ENST00000569332 EEA1Q15075 1411 aa38.97■■■■□ 3.83
WWOX-215ENST00000569332 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.91■■■■□ 3.82
WWOX-215ENST00000569332 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.89■■■■□ 3.82
WWOX-215ENST00000569332 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.86■■■■□ 3.81
WWOX-215ENST00000569332 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.82■■■■□ 3.81
WWOX-215ENST00000569332 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.77■■■■□ 3.8
WWOX-215ENST00000569332 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.76■■■■□ 3.8
WWOX-215ENST00000569332 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.73■■■■□ 3.79
WWOX-215ENST00000569332 TOPBP1Q92547 1522 aa38.73■■■■□ 3.79
WWOX-215ENST00000569332 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
WWOX-215ENST00000569332 KIF27Q86VH2 1401 aa38.57■■■■□ 3.76
WWOX-215ENST00000569332 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
WWOX-215ENST00000569332 CUX2O14529 1486 aa38.49■■■■□ 3.75
WWOX-215ENST00000569332 KIF21BO75037 1637 aa38.48■■■■□ 3.75
WWOX-215ENST00000569332 GOLGA3Q08378 1498 aa38.47■■■■□ 3.75
WWOX-215ENST00000569332 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.45■■■■□ 3.75
WWOX-215ENST00000569332 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.42■■■■□ 3.74
WWOX-215ENST00000569332 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.36■■■■□ 3.73
WWOX-215ENST00000569332 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
WWOX-215ENST00000569332 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.35■■■■□ 3.73
WWOX-215ENST00000569332 ERCC6Q03468 1493 aa38.32■■■■□ 3.72
WWOX-215ENST00000569332 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.32■■■■□ 3.72
WWOX-215ENST00000569332 PRXQ9BXM0 1461 aa38.31■■■■□ 3.72
WWOX-215ENST00000569332 IGF1RP08069 1367 aa38.25■■■■□ 3.71
WWOX-215ENST00000569332 WDR97A6NE52 1622 aa38.22■■■■□ 3.71
WWOX-215ENST00000569332 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.22■■■■□ 3.71
WWOX-215ENST00000569332 WDR62O43379 1518 aa38.21■■■■□ 3.71
WWOX-215ENST00000569332 CEP162Q5TB80 1403 aa38.17■■■■□ 3.7
WWOX-215ENST00000569332 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
WWOX-215ENST00000569332 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
WWOX-215ENST00000569332 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
WWOX-215ENST00000569332 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.05■■■■□ 3.68
WWOX-215ENST00000569332 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.05■■■■□ 3.68
WWOX-215ENST00000569332 GAPVD1Q14C86 1478 aa38■■■■□ 3.67
WWOX-215ENST00000569332 IFT140Q96RY7 1462 aa37.95■■■■□ 3.67
WWOX-215ENST00000569332 CUL7Q14999 1698 aa37.9■■■■□ 3.66
WWOX-215ENST00000569332 CLIP1P30622 1438 aa37.87■■■■□ 3.65
WWOX-215ENST00000569332 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.83■■■■□ 3.65
WWOX-215ENST00000569332 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
WWOX-215ENST00000569332 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
WWOX-215ENST00000569332 PBRM1Q86U86 1689 aa37.76■■■■□ 3.64
WWOX-215ENST00000569332 GRIN2BQ13224 1484 aa37.68■■■■□ 3.62
WWOX-215ENST00000569332 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
WWOX-215ENST00000569332 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.57■■■■□ 3.6
WWOX-215ENST00000569332 ADAMTS12P58397 1594 aa37.56■■■■□ 3.6
WWOX-215ENST00000569332 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.52■■■■□ 3.6
WWOX-215ENST00000569332 ARAP1Q96P48 1450 aa37.5■■■■□ 3.59
WWOX-215ENST00000569332 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.5■■■■□ 3.59
WWOX-215ENST00000569332 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.49■■■■□ 3.59
WWOX-215ENST00000569332 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms