RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568210.5

ULK3-215, Transcript of unc-51 like kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ULK3, Length 1,717 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3-215ENST00000568210 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.07■■■■■ 4.01
ULK3-215ENST00000568210 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.77■■■■□ 3.16
ULK3-215ENST00000568210 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
ULK3-215ENST00000568210 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.17■■■□□ 2.9
ULK3-215ENST00000568210 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.91■■■□□ 2.86
ULK3-215ENST00000568210 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.88■■■□□ 2.85
ULK3-215ENST00000568210 ABCC9O60706 1549 aa32.68■■■□□ 2.82
ULK3-215ENST00000568210 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.65■■■□□ 2.82
ULK3-215ENST00000568210 NACADO15069 1562 aa32.31■■■□□ 2.76
ULK3-215ENST00000568210 SCRIBQ14160 1630 aa32■■■□□ 2.71
ULK3-215ENST00000568210 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.94■■■□□ 2.7
ULK3-215ENST00000568210 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
ULK3-215ENST00000568210 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.28■■■□□ 2.6
ULK3-215ENST00000568210 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
ULK3-215ENST00000568210 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.11■■■□□ 2.57
ULK3-215ENST00000568210 BICRAQ9NZM4 1560 aa31■■■□□ 2.55
ULK3-215ENST00000568210 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.98■■■□□ 2.55
ULK3-215ENST00000568210 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
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ULK3-215ENST00000568210 WIZO95785 1651 aa30.72■■■□□ 2.51
ULK3-215ENST00000568210 SMARCA4P51532 1647 aa30.72■■■□□ 2.51
ULK3-215ENST00000568210 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.68■■■□□ 2.5
ULK3-215ENST00000568210 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
ULK3-215ENST00000568210 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.36■■■□□ 2.45
ULK3-215ENST00000568210 SMARCA2P51531 1590 aa30.16■■■□□ 2.42
ULK3-215ENST00000568210 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.14■■■□□ 2.42
ULK3-215ENST00000568210 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.12■■■□□ 2.41
ULK3-215ENST00000568210 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
ULK3-215ENST00000568210 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ULK3-215ENST00000568210 TRIM41Q8WV44 630 aa29.9■■■□□ 2.38
ULK3-215ENST00000568210 NCAPD3P42695 1498 aa29.84■■■□□ 2.37
ULK3-215ENST00000568210 HMGXB3Q12766 1538 aa29.82■■■□□ 2.36
ULK3-215ENST00000568210 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.59■■■□□ 2.33
ULK3-215ENST00000568210 ABCC8Q09428 1581 aa29.58■■■□□ 2.33
ULK3-215ENST00000568210 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.54■■■□□ 2.32
ULK3-215ENST00000568210 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.49■■■□□ 2.31
ULK3-215ENST00000568210 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
ULK3-215ENST00000568210 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
ULK3-215ENST00000568210 CFTRP13569 1480 aa29.27■■■□□ 2.28
ULK3-215ENST00000568210 SYNJ1O43426 1573 aa29.23■■■□□ 2.27
ULK3-215ENST00000568210 EEA1Q15075 1411 aa29.14■■■□□ 2.26
ULK3-215ENST00000568210 SOGA1O94964 1423 aa29.12■■■□□ 2.25
ULK3-215ENST00000568210 TOP2BQ02880 1626 aa29.1■■■□□ 2.25
ULK3-215ENST00000568210 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.09■■■□□ 2.25
ULK3-215ENST00000568210 PRDM2Q13029 1718 aa29.09■■■□□ 2.25
ULK3-215ENST00000568210 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.05■■■□□ 2.24
ULK3-215ENST00000568210 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.99■■■□□ 2.23
ULK3-215ENST00000568210 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.94■■■□□ 2.22
ULK3-215ENST00000568210 CUX1P39880 1505 aa28.94■■■□□ 2.22
ULK3-215ENST00000568210 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.88■■■□□ 2.21
ULK3-215ENST00000568210 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.76■■■□□ 2.19
ULK3-215ENST00000568210 GOLGA3Q08378 1498 aa28.74■■■□□ 2.19
ULK3-215ENST00000568210 KIF21BO75037 1637 aa28.74■■■□□ 2.19
ULK3-215ENST00000568210 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.74■■■□□ 2.19
ULK3-215ENST00000568210 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.74■■■□□ 2.19
ULK3-215ENST00000568210 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.71■■■□□ 2.19
ULK3-215ENST00000568210 NESP48681 1621 aa28.71■■■□□ 2.19
ULK3-215ENST00000568210 KIF27Q86VH2 1401 aa28.6■■■□□ 2.17
ULK3-215ENST00000568210 CEP162Q5TB80 1403 aa28.58■■■□□ 2.17
ULK3-215ENST00000568210 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.56■■■□□ 2.16
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ULK3-215ENST00000568210 PRXQ9BXM0 1461 aa28.51■■■□□ 2.16
ULK3-215ENST00000568210 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.51■■■□□ 2.15
ULK3-215ENST00000568210 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.5■■■□□ 2.15
ULK3-215ENST00000568210 TOPBP1Q92547 1522 aa28.49■■■□□ 2.15
ULK3-215ENST00000568210 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.49■■■□□ 2.15
ULK3-215ENST00000568210 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.48■■■□□ 2.15
ULK3-215ENST00000568210 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ULK3-215ENST00000568210 CUX2O14529 1486 aa28.43■■■□□ 2.14
ULK3-215ENST00000568210 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
ULK3-215ENST00000568210 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ULK3-215ENST00000568210 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.33■■■□□ 2.13
ULK3-215ENST00000568210 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.33■■■□□ 2.13
ULK3-215ENST00000568210 IGF1RP08069 1367 aa28.33■■■□□ 2.13
ULK3-215ENST00000568210 CLIP1P30622 1438 aa28.29■■■□□ 2.12
ULK3-215ENST00000568210 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.28■■■□□ 2.12
ULK3-215ENST00000568210 WDR97A6NE52 1622 aa28.19■■■□□ 2.1
ULK3-215ENST00000568210 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.18■■■□□ 2.1
ULK3-215ENST00000568210 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.13■■■□□ 2.09
ULK3-215ENST00000568210 ERCC6Q03468 1493 aa28.12■■■□□ 2.09
ULK3-215ENST00000568210 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.1■■■□□ 2.09
ULK3-215ENST00000568210 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.06■■■□□ 2.08
ULK3-215ENST00000568210 CUL7Q14999 1698 aa28.05■■■□□ 2.08
ULK3-215ENST00000568210 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
ULK3-215ENST00000568210 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
ULK3-215ENST00000568210 ARAP1Q96P48 1450 aa27.98■■■□□ 2.07
ULK3-215ENST00000568210 HRCP23327 699 aa27.98■■■□□ 2.07
ULK3-215ENST00000568210 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.98■■■□□ 2.07
ULK3-215ENST00000568210 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
ULK3-215ENST00000568210 WDR62O43379 1518 aa27.98■■■□□ 2.07
ULK3-215ENST00000568210 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
ULK3-215ENST00000568210 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ULK3-215ENST00000568210 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.91■■■□□ 2.06
ULK3-215ENST00000568210 IFT140Q96RY7 1462 aa27.85■■■□□ 2.05
ULK3-215ENST00000568210 APLP2Q06481 763 aa27.78■■■□□ 2.04
ULK3-215ENST00000568210 PBRM1Q86U86 1689 aa27.77■■■□□ 2.04
ULK3-215ENST00000568210 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.77■■■□□ 2.04
ULK3-215ENST00000568210 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.035e-7■■■■■ 30.5
ULK3-215ENST00000568210 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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