RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564656.5

ATXN2L-216, Transcript of ataxin 2 like, humanhuman

TSL 4

Gene ATXN2L, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2L-216ENST00000564656 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.4■■■■□ 3.42
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ATXN2L-216ENST00000564656 NACADO15069 1562 aa30.44■■■□□ 2.46
ATXN2L-216ENST00000564656 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.4■■■□□ 2.46
ATXN2L-216ENST00000564656 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
ATXN2L-216ENST00000564656 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.25■■■□□ 2.43
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ATXN2L-216ENST00000564656 SCRIBQ14160 1630 aa29.54■■■□□ 2.32
ATXN2L-216ENST00000564656 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.23■■■□□ 2.27
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ATXN2L-216ENST00000564656 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.66■■■□□ 2.18
ATXN2L-216ENST00000564656 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.46■■■□□ 2.15
ATXN2L-216ENST00000564656 SMARCA4P51532 1647 aa28.26■■■□□ 2.11
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ATXN2L-216ENST00000564656 NCAPD3P42695 1498 aa28.07■■■□□ 2.08
ATXN2L-216ENST00000564656 SMARCA2P51531 1590 aa28.07■■■□□ 2.08
ATXN2L-216ENST00000564656 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.05■■■□□ 2.08
ATXN2L-216ENST00000564656 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.98■■■□□ 2.07
ATXN2L-216ENST00000564656 HMGXB3Q12766 1538 aa27.94■■■□□ 2.06
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ATXN2L-216ENST00000564656 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.35■■□□□ 1.97
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ATXN2L-216ENST00000564656 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.15■■□□□ 1.94
ATXN2L-216ENST00000564656 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.13■■□□□ 1.93
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ATXN2L-216ENST00000564656 CFTRP13569 1480 aa27.09■■□□□ 1.93
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ATXN2L-216ENST00000564656 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
ATXN2L-216ENST00000564656 PRDM2Q13029 1718 aa26.96■■□□□ 1.91
ATXN2L-216ENST00000564656 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.94■■□□□ 1.9
ATXN2L-216ENST00000564656 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.91■■□□□ 1.9
ATXN2L-216ENST00000564656 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.87■■□□□ 1.89
ATXN2L-216ENST00000564656 WDR62O43379 1518 aa26.8■■□□□ 1.88
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ATXN2L-216ENST00000564656 ABCC8Q09428 1581 aa26.52■■□□□ 1.84
ATXN2L-216ENST00000564656 TOPBP1Q92547 1522 aa26.51■■□□□ 1.83
ATXN2L-216ENST00000564656 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.5■■□□□ 1.83
ATXN2L-216ENST00000564656 IFT140Q96RY7 1462 aa26.35■■□□□ 1.81
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ATXN2L-216ENST00000564656 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.23■■□□□ 1.79
ATXN2L-216ENST00000564656 SOGA1O94964 1423 aa26.18■■□□□ 1.78
ATXN2L-216ENST00000564656 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.18■■□□□ 1.78
ATXN2L-216ENST00000564656 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.17■■□□□ 1.78
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ATXN2L-216ENST00000564656 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.11■■□□□ 1.77
ATXN2L-216ENST00000564656 TOP2BQ02880 1626 aa26.1■■□□□ 1.77
ATXN2L-216ENST00000564656 SYNJ1O43426 1573 aa26.09■■□□□ 1.77
ATXN2L-216ENST00000564656 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.773e-10■■■■■ 57.5
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ATXN2L-216ENST00000564656 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.98■■□□□ 1.75
ATXN2L-216ENST00000564656 OSCARQ8IYS5 282 aa25.89■■□□□ 1.74
ATXN2L-216ENST00000564656 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.88■■□□□ 1.73
ATXN2L-216ENST00000564656 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.88■■□□□ 1.73
ATXN2L-216ENST00000564656 GRIN2BQ13224 1484 aa25.87■■□□□ 1.73
ATXN2L-216ENST00000564656 PBRM1Q86U86 1689 aa25.87■■□□□ 1.73
ATXN2L-216ENST00000564656 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.85■■□□□ 1.73
ATXN2L-216ENST00000564656 CHD1O14646 1710 aa25.84■■□□□ 1.73
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ATXN2L-216ENST00000564656 FBLN2P98095 1184 aa25.77■■□□□ 1.72
ATXN2L-216ENST00000564656 SYNJ2O15056 1496 aa25.71■■□□□ 1.71
ATXN2L-216ENST00000564656 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
ATXN2L-216ENST00000564656 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.67■■□□□ 1.7
ATXN2L-216ENST00000564656 ADAMTS12P58397 1594 aa25.64■■□□□ 1.69
ATXN2L-216ENST00000564656 KIF27Q86VH2 1401 aa25.6■■□□□ 1.69
ATXN2L-216ENST00000564656 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.58■■□□□ 1.69
ATXN2L-216ENST00000564656 GRIN2AQ12879 1464 aa25.54■■□□□ 1.68
ATXN2L-216ENST00000564656 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.53■■□□□ 1.68
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ATXN2L-216ENST00000564656 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.5■■□□□ 1.67
ATXN2L-216ENST00000564656 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.5■■□□□ 1.67
ATXN2L-216ENST00000564656 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.5■■□□□ 1.67
ATXN2L-216ENST00000564656 IGF1RP08069 1367 aa25.48■■□□□ 1.67
ATXN2L-216ENST00000564656 ARHGEF11O15085 1522 aa25.47■■□□□ 1.67
ATXN2L-216ENST00000564656 CUL7Q14999 1698 aa25.45■■□□□ 1.67
ATXN2L-216ENST00000564656 NUP160Q12769 1436 aa25.43■■□□□ 1.66
ATXN2L-216ENST00000564656 CEP170Q5SW79 1584 aa25.43■■□□□ 1.66
ATXN2L-216ENST00000564656 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.37■■□□□ 1.65
ATXN2L-216ENST00000564656 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.34■■□□□ 1.65
ATXN2L-216ENST00000564656 ARAP1Q96P48 1450 aa25.27■■□□□ 1.64
ATXN2L-216ENST00000564656 SHROOM2Q13796 1616 aa25.26■■□□□ 1.63
ATXN2L-216ENST00000564656 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.23■■□□□ 1.63
ATXN2L-216ENST00000564656 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.21■■□□□ 1.63
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