RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.29■■■■■ 4.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.22■■■■□ 3.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCC9O60706 1549 aa38.26■■■■□ 3.71
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.01■■■■□ 3.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.8■■■■□ 3.48
CCNDBP1-205ENST00000564630 NACADO15069 1562 aa36.79■■■■□ 3.48
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.59■■■■□ 3.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.56■■■■□ 3.44
CCNDBP1-205ENST00000564630 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.09■■■■□ 3.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCRIBQ14160 1630 aa35.95■■■■□ 3.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.76■■■■□ 3.31
CCNDBP1-205ENST00000564630 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.74■■■■□ 3.31
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.87■■■■□ 3.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
CCNDBP1-205ENST00000564630 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.58■■■■□ 3.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.55■■■■□ 3.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMARCA4P51532 1647 aa34.34■■■■□ 3.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.2■■■■□ 3.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.1■■■■□ 3.05
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.06■■■■□ 3.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMARCA2P51531 1590 aa34■■■■□ 3.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCAPD3P42695 1498 aa33.95■■■■□ 3.02
CCNDBP1-205ENST00000564630 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.92■■■■□ 3.02
CCNDBP1-205ENST00000564630 WIZO95785 1651 aa33.88■■■■□ 3.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 HMGXB3Q12766 1538 aa33.82■■■■□ 3.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
CCNDBP1-205ENST00000564630 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
CCNDBP1-205ENST00000564630 HRCP23327 699 aa33.41■■■□□ 2.94
CCNDBP1-205ENST00000564630 NESP48681 1621 aa33.2■■■□□ 2.91
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.08■■■□□ 2.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.03■■■□□ 2.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 CADPSQ9ULU8 1353 aa33■■■□□ 2.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.97■■■□□ 2.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERCC6Q03468 1493 aa32.91■■■□□ 2.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 CFTRP13569 1480 aa32.86■■■□□ 2.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.83■■■□□ 2.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.81■■■□□ 2.84
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.79■■■□□ 2.84
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM41Q8WV44 630 aa32.71■■■□□ 2.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRDM2Q13029 1718 aa32.68■■■□□ 2.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.67■■■□□ 2.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.6■■■□□ 2.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.47■■■□□ 2.79
CCNDBP1-205ENST00000564630 CUX2O14529 1486 aa32.37■■■□□ 2.77
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR62O43379 1518 aa32.36■■■□□ 2.77
CCNDBP1-205ENST00000564630 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CCNDBP1-205ENST00000564630 TOPBP1Q92547 1522 aa32.18■■■□□ 2.74
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.14■■■□□ 2.74
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCC8Q09428 1581 aa32.08■■■□□ 2.73
CCNDBP1-205ENST00000564630 CUX1P39880 1505 aa32.06■■■□□ 2.72
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
CCNDBP1-205ENST00000564630 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.93■■■□□ 2.7
CCNDBP1-205ENST00000564630 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.92■■■□□ 2.7
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.91■■■□□ 2.7
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYNJ1O43426 1573 aa31.88■■■□□ 2.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFT140Q96RY7 1462 aa31.86■■■□□ 2.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.83■■■□□ 2.69
CCNDBP1-205ENST00000564630 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.82■■■□□ 2.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 TOP2BQ02880 1626 aa31.81■■■□□ 2.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOGA1O94964 1423 aa31.78■■■□□ 2.68
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
CCNDBP1-205ENST00000564630 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.63■■■□□ 2.651e-6■■□□□ 13.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR97A6NE52 1622 aa31.63■■■□□ 2.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.55■■■□□ 2.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 EEA1Q15075 1411 aa31.52■■■□□ 2.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.44■■■□□ 2.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.42■■■□□ 2.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 PBRM1Q86U86 1689 aa31.39■■■□□ 2.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.38■■■□□ 2.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP162Q5TB80 1403 aa31.38■■■□□ 2.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.38■■■□□ 2.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRIN2BQ13224 1484 aa31.36■■■□□ 2.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.35■■■□□ 2.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.34■■■□□ 2.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHD1O14646 1710 aa31.24■■■□□ 2.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA3Q08378 1498 aa31.24■■■□□ 2.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBLN2P98095 1184 aa31.23■■■□□ 2.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF27Q86VH2 1401 aa31.2■■■□□ 2.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.17■■■□□ 2.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF21BO75037 1637 aa31.13■■■□□ 2.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADAMTS12P58397 1594 aa31.13■■■□□ 2.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYNJ2O15056 1496 aa31.12■■■□□ 2.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 OSCARQ8IYS5 282 aa31.1■■■□□ 2.57
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