RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.2■■■■■ 4.83
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USP3-AS1-209ENST00000561191 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
USP3-AS1-209ENST00000561191 NACADO15069 1562 aa37.69■■■■□ 3.62
USP3-AS1-209ENST00000561191 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.52■■■■□ 3.6
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.51■■■■□ 3.59
USP3-AS1-209ENST00000561191 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.41■■■■□ 3.58
USP3-AS1-209ENST00000561191 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.02■■■■□ 3.52
USP3-AS1-209ENST00000561191 SCRIBQ14160 1630 aa36.68■■■■□ 3.46
USP3-AS1-209ENST00000561191 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.65■■■■□ 3.46
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USP3-AS1-209ENST00000561191 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.19■■■■□ 3.38
USP3-AS1-209ENST00000561191 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.77■■■■□ 3.32
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USP3-AS1-209ENST00000561191 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.46■■■■□ 3.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.21■■■■□ 3.23
USP3-AS1-209ENST00000561191 SMARCA4P51532 1647 aa35.1■■■■□ 3.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.86■■■■□ 3.17
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.81■■■■□ 3.16
USP3-AS1-209ENST00000561191 SMARCA2P51531 1590 aa34.79■■■■□ 3.16
USP3-AS1-209ENST00000561191 NCAPD3P42695 1498 aa34.75■■■■□ 3.15
USP3-AS1-209ENST00000561191 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.74■■■■□ 3.15
USP3-AS1-209ENST00000561191 HMGXB3Q12766 1538 aa34.66■■■■□ 3.14
USP3-AS1-209ENST00000561191 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
USP3-AS1-209ENST00000561191 WIZO95785 1651 aa34.52■■■■□ 3.12
USP3-AS1-209ENST00000561191 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
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USP3-AS1-209ENST00000561191 NESP48681 1621 aa33.94■■■■□ 3.02
USP3-AS1-209ENST00000561191 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.85■■■■□ 3.01
USP3-AS1-209ENST00000561191 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.71■■■□□ 2.99
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.69■■■□□ 2.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 ERCC6Q03468 1493 aa33.69■■■□□ 2.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.62■■■□□ 2.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 CFTRP13569 1480 aa33.59■■■□□ 2.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
USP3-AS1-209ENST00000561191 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.53■■■□□ 2.96
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRDM2Q13029 1718 aa33.5■■■□□ 2.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.37■■■□□ 2.93
USP3-AS1-209ENST00000561191 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.33■■■□□ 2.93
USP3-AS1-209ENST00000561191 CUX2O14529 1486 aa33.31■■■□□ 2.92
USP3-AS1-209ENST00000561191 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.26■■■□□ 2.92
USP3-AS1-209ENST00000561191 WDR62O43379 1518 aa33.2■■■□□ 2.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 TOPBP1Q92547 1522 aa32.88■■■□□ 2.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.87■■■□□ 2.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 ABCC8Q09428 1581 aa32.8■■■□□ 2.84
USP3-AS1-209ENST00000561191 CUX1P39880 1505 aa32.71■■■□□ 2.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
USP3-AS1-209ENST00000561191 IFT140Q96RY7 1462 aa32.6■■■□□ 2.81
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USP3-AS1-209ENST00000561191 SYNJ1O43426 1573 aa32.48■■■□□ 2.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.46■■■□□ 2.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 TOP2BQ02880 1626 aa32.45■■■□□ 2.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.45■■■□□ 2.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 WDR97A6NE52 1622 aa32.4■■■□□ 2.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 SOGA1O94964 1423 aa32.39■■■□□ 2.78
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USP3-AS1-209ENST00000561191 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.23■■■□□ 2.75
USP3-AS1-209ENST00000561191 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
USP3-AS1-209ENST00000561191 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.17■■■□□ 2.74
USP3-AS1-209ENST00000561191 PBRM1Q86U86 1689 aa32.12■■■□□ 2.73
USP3-AS1-209ENST00000561191 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.07■■■□□ 2.72
USP3-AS1-209ENST00000561191 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.06■■■□□ 2.72
USP3-AS1-209ENST00000561191 GRIN2BQ13224 1484 aa32.04■■■□□ 2.72
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHD1O14646 1710 aa32.03■■■□□ 2.72
USP3-AS1-209ENST00000561191 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.03■■■□□ 2.72
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USP3-AS1-209ENST00000561191 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.85■■■□□ 2.69
USP3-AS1-209ENST00000561191 SYNJ2O15056 1496 aa31.84■■■□□ 2.69
USP3-AS1-209ENST00000561191 OSCARQ8IYS5 282 aa31.83■■■□□ 2.69
USP3-AS1-209ENST00000561191 FBLN2P98095 1184 aa31.76■■■□□ 2.67
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIF27Q86VH2 1401 aa31.75■■■□□ 2.67
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
USP3-AS1-209ENST00000561191 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.68■■■□□ 2.66
USP3-AS1-209ENST00000561191 GRIN2AQ12879 1464 aa31.66■■■□□ 2.66
USP3-AS1-209ENST00000561191 TRIM41Q8WV44 630 aa31.66■■■□□ 2.66
USP3-AS1-209ENST00000561191 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.64■■■□□ 2.66
USP3-AS1-209ENST00000561191 CUL7Q14999 1698 aa31.62■■■□□ 2.65
USP3-AS1-209ENST00000561191 IGF1RP08069 1367 aa31.59■■■□□ 2.65
USP3-AS1-209ENST00000561191 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.57■■■□□ 2.64
USP3-AS1-209ENST00000561191 CEP170Q5SW79 1584 aa31.56■■■□□ 2.64
USP3-AS1-209ENST00000561191 NUP160Q12769 1436 aa31.52■■■□□ 2.64
USP3-AS1-209ENST00000561191 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.5■■■□□ 2.63
USP3-AS1-209ENST00000561191 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.5■■■□□ 2.63
USP3-AS1-209ENST00000561191 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.5■■■□□ 2.63
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARHGEF11O15085 1522 aa31.48■■■□□ 2.63
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.4■■■□□ 2.62
USP3-AS1-209ENST00000561191 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.4■■■□□ 2.62
USP3-AS1-209ENST00000561191 SHROOM2Q13796 1616 aa31.34■■■□□ 2.61
USP3-AS1-209ENST00000561191 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.27■■■□□ 2.6
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARAP1Q96P48 1450 aa31.25■■■□□ 2.59
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