RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561040.1

MEIS3-209, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,809 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-209ENST00000561040 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.25■■■■□ 3.39
MEIS3-209ENST00000561040 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.55■■■□□ 2.64
MEIS3-209ENST00000561040 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
MEIS3-209ENST00000561040 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.06■■■□□ 2.4
MEIS3-209ENST00000561040 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.7■■■□□ 2.34
MEIS3-209ENST00000561040 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.68■■■□□ 2.34
MEIS3-209ENST00000561040 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.59■■■□□ 2.33
MEIS3-209ENST00000561040 ABCC9O60706 1549 aa29.33■■■□□ 2.29
MEIS3-209ENST00000561040 NACADO15069 1562 aa29.27■■■□□ 2.28
MEIS3-209ENST00000561040 SCRIBQ14160 1630 aa28.94■■■□□ 2.22
MEIS3-209ENST00000561040 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.92■■■□□ 2.22
MEIS3-209ENST00000561040 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
MEIS3-209ENST00000561040 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-209ENST00000561040 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
MEIS3-209ENST00000561040 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.05■■■□□ 2.08
MEIS3-209ENST00000561040 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
MEIS3-209ENST00000561040 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.97■■■□□ 2.07
MEIS3-209ENST00000561040 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.96■■■□□ 2.07
MEIS3-209ENST00000561040 SMARCA4P51532 1647 aa27.81■■■□□ 2.04
MEIS3-209ENST00000561040 WIZO95785 1651 aa27.78■■■□□ 2.04
MEIS3-209ENST00000561040 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.76■■■□□ 2.03
MEIS3-209ENST00000561040 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
MEIS3-209ENST00000561040 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
MEIS3-209ENST00000561040 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.49■■□□□ 1.99
MEIS3-209ENST00000561040 SMARCA2P51531 1590 aa27.3■■□□□ 1.96
MEIS3-209ENST00000561040 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.22■■□□□ 1.95
MEIS3-209ENST00000561040 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.22■■□□□ 1.95
MEIS3-209ENST00000561040 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
MEIS3-209ENST00000561040 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
MEIS3-209ENST00000561040 TRIM41Q8WV44 630 aa27.09■■□□□ 1.93
MEIS3-209ENST00000561040 HMGXB3Q12766 1538 aa27■■□□□ 1.91
MEIS3-209ENST00000561040 NCAPD3P42695 1498 aa26.96■■□□□ 1.91
MEIS3-209ENST00000561040 ABCC8Q09428 1581 aa26.74■■□□□ 1.87
MEIS3-209ENST00000561040 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.63■■□□□ 1.85
MEIS3-209ENST00000561040 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.61■■□□□ 1.85
MEIS3-209ENST00000561040 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
MEIS3-209ENST00000561040 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
MEIS3-209ENST00000561040 EEA1Q15075 1411 aa26.49■■□□□ 1.83
MEIS3-209ENST00000561040 PRDM2Q13029 1718 aa26.46■■□□□ 1.83
MEIS3-209ENST00000561040 CFTRP13569 1480 aa26.45■■□□□ 1.82
MEIS3-209ENST00000561040 SYNJ1O43426 1573 aa26.44■■□□□ 1.82
MEIS3-209ENST00000561040 TOP2BQ02880 1626 aa26.37■■□□□ 1.81
MEIS3-209ENST00000561040 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.36■■□□□ 1.81
MEIS3-209ENST00000561040 SOGA1O94964 1423 aa26.3■■□□□ 1.8
MEIS3-209ENST00000561040 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.28■■□□□ 1.8
MEIS3-209ENST00000561040 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.2■■□□□ 1.78
MEIS3-209ENST00000561040 CUX1P39880 1505 aa26.14■■□□□ 1.78
MEIS3-209ENST00000561040 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.14■■□□□ 1.78
MEIS3-209ENST00000561040 KIF21BO75037 1637 aa26.1■■□□□ 1.77
MEIS3-209ENST00000561040 GOLGA3Q08378 1498 aa26.09■■□□□ 1.77
MEIS3-209ENST00000561040 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.06■■□□□ 1.76
MEIS3-209ENST00000561040 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.06■■□□□ 1.76
MEIS3-209ENST00000561040 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.04■■□□□ 1.76
MEIS3-209ENST00000561040 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.03■■□□□ 1.76
MEIS3-209ENST00000561040 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.99■■□□□ 1.75
MEIS3-209ENST00000561040 CEP162Q5TB80 1403 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-209ENST00000561040 KIF27Q86VH2 1401 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-209ENST00000561040 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-209ENST00000561040 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-209ENST00000561040 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.86■■□□□ 1.73
MEIS3-209ENST00000561040 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
MEIS3-209ENST00000561040 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.85■■□□□ 1.73
MEIS3-209ENST00000561040 NESP48681 1621 aa25.85■■□□□ 1.73
MEIS3-209ENST00000561040 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.82■■□□□ 1.72
MEIS3-209ENST00000561040 PRXQ9BXM0 1461 aa25.8■■□□□ 1.72
MEIS3-209ENST00000561040 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.79■■□□□ 1.72
MEIS3-209ENST00000561040 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.77■■□□□ 1.72
MEIS3-209ENST00000561040 TOPBP1Q92547 1522 aa25.75■■□□□ 1.71
MEIS3-209ENST00000561040 CUX2O14529 1486 aa25.71■■□□□ 1.71
MEIS3-209ENST00000561040 CLIP1P30622 1438 aa25.65■■□□□ 1.7
MEIS3-209ENST00000561040 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.64■■□□□ 1.69
MEIS3-209ENST00000561040 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
MEIS3-209ENST00000561040 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.63■■□□□ 1.69
MEIS3-209ENST00000561040 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
MEIS3-209ENST00000561040 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.6■■□□□ 1.69
MEIS3-209ENST00000561040 IGF1RP08069 1367 aa25.58■■□□□ 1.68
MEIS3-209ENST00000561040 WDR97A6NE52 1622 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-209ENST00000561040 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.5■■□□□ 1.67
MEIS3-209ENST00000561040 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-209ENST00000561040 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.48■■□□□ 1.67
MEIS3-209ENST00000561040 CUL7Q14999 1698 aa25.48■■□□□ 1.67
MEIS3-209ENST00000561040 HRCP23327 699 aa25.47■■□□□ 1.67
MEIS3-209ENST00000561040 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.42■■□□□ 1.66
MEIS3-209ENST00000561040 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-209ENST00000561040 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MEIS3-209ENST00000561040 ARAP1Q96P48 1450 aa25.32■■□□□ 1.64
MEIS3-209ENST00000561040 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
MEIS3-209ENST00000561040 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.3■■□□□ 1.64
MEIS3-209ENST00000561040 WDR62O43379 1518 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-209ENST00000561040 APLP2Q06481 763 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-209ENST00000561040 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-209ENST00000561040 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-209ENST00000561040 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-209ENST00000561040 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MEIS3-209ENST00000561040 PBRM1Q86U86 1689 aa25.19■■□□□ 1.62
MEIS3-209ENST00000561040 IFT140Q96RY7 1462 aa25.19■■□□□ 1.62
MEIS3-209ENST00000561040 ERCC6Q03468 1493 aa25.18■■□□□ 1.62
MEIS3-209ENST00000561040 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-209ENST00000561040 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
MEIS3-209ENST00000561040 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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