RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560851.2

TMC3-AS1-204, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TMC3-AS1, Length 1,269 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.81■■■■□ 3.16
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.05■■■□□ 2.56
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ABCC9O60706 1549 aa30.73■■■□□ 2.51
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.39■■■□□ 2.3
TMC3-AS1-204ENST00000560851 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.31■■■□□ 2.28
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NACADO15069 1562 aa29.27■■■□□ 2.28
TMC3-AS1-204ENST00000560851 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.97■■■□□ 2.23
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TMC3-AS1-204ENST00000560851 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.75■■■□□ 2.19
TMC3-AS1-204ENST00000560851 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.67■■■□□ 2.18
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.67■■■□□ 2.18
TMC3-AS1-204ENST00000560851 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.47■■■□□ 2.15
TMC3-AS1-204ENST00000560851 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.41■■■□□ 2.14
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SCRIBQ14160 1630 aa28.36■■■□□ 2.13
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.15■■■□□ 2.1
TMC3-AS1-204ENST00000560851 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.74■■■□□ 2.03
TMC3-AS1-204ENST00000560851 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.63■■■□□ 2.01
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SMARCA4P51532 1647 aa27.07■■□□□ 1.92
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NCAPD3P42695 1498 aa27.01■■□□□ 1.91
TMC3-AS1-204ENST00000560851 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27■■□□□ 1.91
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SMARCA2P51531 1590 aa26.96■■□□□ 1.91
TMC3-AS1-204ENST00000560851 HMGXB3Q12766 1538 aa26.86■■□□□ 1.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.83■■□□□ 1.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.78■■□□□ 1.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ERCC6Q03468 1493 aa26.53■■□□□ 1.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 WIZO95785 1651 aa26.53■■□□□ 1.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NESP48681 1621 aa26.48■■□□□ 1.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
TMC3-AS1-204ENST00000560851 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.35■■□□□ 1.81
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.3■■□□□ 1.8
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CUX2O14529 1486 aa26.3■■□□□ 1.8
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.23■■□□□ 1.79
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.22■■□□□ 1.79
TMC3-AS1-204ENST00000560851 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.14■■□□□ 1.78
TMC3-AS1-204ENST00000560851 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CFTRP13569 1480 aa26■■□□□ 1.75
TMC3-AS1-204ENST00000560851 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.96■■□□□ 1.75
TMC3-AS1-204ENST00000560851 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.95■■□□□ 1.74
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.95■■□□□ 1.74
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.92■■□□□ 1.74
TMC3-AS1-204ENST00000560851 WDR62O43379 1518 aa25.86■■□□□ 1.73
TMC3-AS1-204ENST00000560851 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.82■■□□□ 1.72
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PRDM2Q13029 1718 aa25.76■■□□□ 1.71
TMC3-AS1-204ENST00000560851 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TOPBP1Q92547 1522 aa25.49■■□□□ 1.67
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ABCC8Q09428 1581 aa25.46■■□□□ 1.67
TMC3-AS1-204ENST00000560851 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.43■■□□□ 1.66
TMC3-AS1-204ENST00000560851 IFT140Q96RY7 1462 aa25.4■■□□□ 1.66
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TMC3-AS1-204ENST00000560851 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TMC3-AS1-204ENST00000560851 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CUX1P39880 1505 aa25.18■■□□□ 1.62
TMC3-AS1-204ENST00000560851 OSCARQ8IYS5 282 aa25.18■■□□□ 1.62
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.17■■□□□ 1.62
TMC3-AS1-204ENST00000560851 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.16■■□□□ 1.62
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SOGA1O94964 1423 aa25.16■■□□□ 1.62
TMC3-AS1-204ENST00000560851 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TMC3-AS1-204ENST00000560851 WDR97A6NE52 1622 aa24.98■■□□□ 1.59
TMC3-AS1-204ENST00000560851 FBLN2P98095 1184 aa24.96■■□□□ 1.59
TMC3-AS1-204ENST00000560851 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.59
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TRIM41Q8WV44 630 aa24.93■■□□□ 1.58
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CHD1O14646 1710 aa24.92■■□□□ 1.58
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.91■■□□□ 1.58
TMC3-AS1-204ENST00000560851 GRIN2BQ13224 1484 aa24.89■■□□□ 1.58
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.89■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TOP2BQ02880 1626 aa24.89■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SYNJ1O43426 1573 aa24.88■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-204ENST00000560851 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.87■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-204ENST00000560851 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.86■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-204ENST00000560851 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PBRM1Q86U86 1689 aa24.81■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.8■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SYNJ2O15056 1496 aa24.77■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ARHGEF11O15085 1522 aa24.76■■□□□ 1.55
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.64■■□□□ 1.53
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ADAMTS12P58397 1594 aa24.6■■□□□ 1.53
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.58■■□□□ 1.53
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.58■■□□□ 1.53
TMC3-AS1-204ENST00000560851 GRIN2AQ12879 1464 aa24.57■■□□□ 1.52
TMC3-AS1-204ENST00000560851 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.56■■□□□ 1.52
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ARAP1Q96P48 1450 aa24.54■■□□□ 1.52
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CEP170Q5SW79 1584 aa24.46■■□□□ 1.51
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NUP160Q12769 1436 aa24.45■■□□□ 1.51
TMC3-AS1-204ENST00000560851 KIF27Q86VH2 1401 aa24.44■■□□□ 1.5
TMC3-AS1-204ENST00000560851 IGF1RP08069 1367 aa24.36■■□□□ 1.49
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CUL7Q14999 1698 aa24.3■■□□□ 1.48
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.29■■□□□ 1.48
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SHROOM2Q13796 1616 aa24.28■■□□□ 1.48
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