RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559226.5

DUOXA1-211, Transcript of dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene DUOXA1, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1-211ENST00000559226 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.27■■■■■ 5.8
DUOXA1-211ENST00000559226 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.52■■■■■ 4.88
DUOXA1-211ENST00000559226 ABCC9O60706 1549 aa44.59■■■■■ 4.73
DUOXA1-211ENST00000559226 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.89■■■■■ 4.46
DUOXA1-211ENST00000559226 NACADO15069 1562 aa42.87■■■■■ 4.45
DUOXA1-211ENST00000559226 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.82■■■■■ 4.45
DUOXA1-211ENST00000559226 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
DUOXA1-211ENST00000559226 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
DUOXA1-211ENST00000559226 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.46■■■■■ 4.39
DUOXA1-211ENST00000559226 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.79■■■■■ 4.28
DUOXA1-211ENST00000559226 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.27
DUOXA1-211ENST00000559226 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.59■■■■■ 4.25
DUOXA1-211ENST00000559226 SCRIBQ14160 1630 aa41.51■■■■■ 4.23
DUOXA1-211ENST00000559226 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.22■■■■■ 4.19
DUOXA1-211ENST00000559226 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.02■■■■■ 4.16
DUOXA1-211ENST00000559226 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
DUOXA1-211ENST00000559226 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.32■■■■■ 4.05
DUOXA1-211ENST00000559226 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.1■■■■■ 4.01
DUOXA1-211ENST00000559226 SMARCA4P51532 1647 aa39.73■■■■□ 3.95
DUOXA1-211ENST00000559226 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
DUOXA1-211ENST00000559226 NCAPD3P42695 1498 aa39.61■■■■□ 3.93
DUOXA1-211ENST00000559226 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.59■■■■□ 3.93
DUOXA1-211ENST00000559226 SMARCA2P51531 1590 aa39.51■■■■□ 3.92
DUOXA1-211ENST00000559226 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.48■■■■□ 3.91
DUOXA1-211ENST00000559226 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.41■■■■□ 3.9
DUOXA1-211ENST00000559226 HMGXB3Q12766 1538 aa39.35■■■■□ 3.89
DUOXA1-211ENST00000559226 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
DUOXA1-211ENST00000559226 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
DUOXA1-211ENST00000559226 WIZO95785 1651 aa39■■■■□ 3.83
DUOXA1-211ENST00000559226 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
DUOXA1-211ENST00000559226 NESP48681 1621 aa38.57■■■■□ 3.77
DUOXA1-211ENST00000559226 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.49■■■■□ 3.75
DUOXA1-211ENST00000559226 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.44■■■■□ 3.74
DUOXA1-211ENST00000559226 ERCC6Q03468 1493 aa38.44■■■■□ 3.74
DUOXA1-211ENST00000559226 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.29■■■■□ 3.72
DUOXA1-211ENST00000559226 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.22■■■■□ 3.71
DUOXA1-211ENST00000559226 CFTRP13569 1480 aa38.2■■■■□ 3.71
DUOXA1-211ENST00000559226 CUX2O14529 1486 aa38.09■■■■□ 3.69
DUOXA1-211ENST00000559226 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.04■■■■□ 3.68
DUOXA1-211ENST00000559226 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
DUOXA1-211ENST00000559226 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
DUOXA1-211ENST00000559226 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.96■■■■□ 3.67
DUOXA1-211ENST00000559226 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.9■■■■□ 3.66
DUOXA1-211ENST00000559226 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.86■■■■□ 3.65
DUOXA1-211ENST00000559226 PRDM2Q13029 1718 aa37.73■■■■□ 3.63
DUOXA1-211ENST00000559226 WDR62O43379 1518 aa37.73■■■■□ 3.63
DUOXA1-211ENST00000559226 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
DUOXA1-211ENST00000559226 ABCC8Q09428 1581 aa37.38■■■■□ 3.57
DUOXA1-211ENST00000559226 TOPBP1Q92547 1522 aa37.34■■■■□ 3.57
DUOXA1-211ENST00000559226 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.28■■■■□ 3.56
DUOXA1-211ENST00000559226 IFT140Q96RY7 1462 aa37.13■■■■□ 3.54
DUOXA1-211ENST00000559226 CUX1P39880 1505 aa37.04■■■■□ 3.52
DUOXA1-211ENST00000559226 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
DUOXA1-211ENST00000559226 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.99■■■■□ 3.51
DUOXA1-211ENST00000559226 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
DUOXA1-211ENST00000559226 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.92■■■■□ 3.5
DUOXA1-211ENST00000559226 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
DUOXA1-211ENST00000559226 SOGA1O94964 1423 aa36.91■■■■□ 3.5
DUOXA1-211ENST00000559226 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.86■■■■□ 3.49
DUOXA1-211ENST00000559226 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.82■■■■□ 3.48
DUOXA1-211ENST00000559226 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.75■■■■□ 3.47
DUOXA1-211ENST00000559226 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
DUOXA1-211ENST00000559226 TOP2BQ02880 1626 aa36.71■■■■□ 3.47
DUOXA1-211ENST00000559226 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
DUOXA1-211ENST00000559226 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.67■■■■□ 3.46
DUOXA1-211ENST00000559226 SYNJ1O43426 1573 aa36.67■■■■□ 3.46
DUOXA1-211ENST00000559226 WDR97A6NE52 1622 aa36.65■■■■□ 3.46
DUOXA1-211ENST00000559226 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.59■■■■□ 3.45
DUOXA1-211ENST00000559226 OSCARQ8IYS5 282 aa36.54■■■■□ 3.44
DUOXA1-211ENST00000559226 GRIN2BQ13224 1484 aa36.46■■■■□ 3.43
DUOXA1-211ENST00000559226 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.45■■■■□ 3.43
DUOXA1-211ENST00000559226 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.4■■■■□ 3.42
DUOXA1-211ENST00000559226 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.38■■■■□ 3.41
DUOXA1-211ENST00000559226 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
DUOXA1-211ENST00000559226 FBLN2P98095 1184 aa36.29■■■■□ 3.4
DUOXA1-211ENST00000559226 PBRM1Q86U86 1689 aa36.26■■■■□ 3.4
DUOXA1-211ENST00000559226 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
DUOXA1-211ENST00000559226 SYNJ2O15056 1496 aa36.23■■■■□ 3.39
DUOXA1-211ENST00000559226 CHD1O14646 1710 aa36.22■■■■□ 3.39
DUOXA1-211ENST00000559226 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.15■■■■□ 3.38
DUOXA1-211ENST00000559226 KIF27Q86VH2 1401 aa36.07■■■■□ 3.36
DUOXA1-211ENST00000559226 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.06■■■■□ 3.36
DUOXA1-211ENST00000559226 ADAMTS12P58397 1594 aa36.04■■■■□ 3.36
DUOXA1-211ENST00000559226 GRIN2AQ12879 1464 aa35.98■■■■□ 3.35
DUOXA1-211ENST00000559226 IGF1RP08069 1367 aa35.96■■■■□ 3.35
DUOXA1-211ENST00000559226 TRIM41Q8WV44 630 aa35.95■■■■□ 3.35
DUOXA1-211ENST00000559226 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.94■■■■□ 3.34
DUOXA1-211ENST00000559226 ARHGEF11O15085 1522 aa35.88■■■■□ 3.33
DUOXA1-211ENST00000559226 NUP160Q12769 1436 aa35.85■■■■□ 3.33
DUOXA1-211ENST00000559226 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.84■■■■□ 3.33
DUOXA1-211ENST00000559226 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.84■■■■□ 3.33
DUOXA1-211ENST00000559226 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.84■■■■□ 3.33
DUOXA1-211ENST00000559226 CEP170Q5SW79 1584 aa35.76■■■■□ 3.32
DUOXA1-211ENST00000559226 CUL7Q14999 1698 aa35.76■■■■□ 3.32
DUOXA1-211ENST00000559226 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.72■■■■□ 3.31
DUOXA1-211ENST00000559226 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.69■■■■□ 3.3
DUOXA1-211ENST00000559226 ARAP1Q96P48 1450 aa35.6■■■■□ 3.29
DUOXA1-211ENST00000559226 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.58■■■■□ 3.29
DUOXA1-211ENST00000559226 SHROOM2Q13796 1616 aa35.53■■■■□ 3.28
DUOXA1-211ENST00000559226 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.51■■■■□ 3.28
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