RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558649.5

RABGGTA-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 768 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-206ENST00000558649 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.38■■■■□ 3.73
RABGGTA-206ENST00000558649 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.14■■■■□ 3.06
RABGGTA-206ENST00000558649 ABCC9O60706 1549 aa33.38■■■□□ 2.93
RABGGTA-206ENST00000558649 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.12■■■□□ 2.73
RABGGTA-206ENST00000558649 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.1■■■□□ 2.73
RABGGTA-206ENST00000558649 NACADO15069 1562 aa32.03■■■□□ 2.72
RABGGTA-206ENST00000558649 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
RABGGTA-206ENST00000558649 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.78■■■□□ 2.68
RABGGTA-206ENST00000558649 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.7■■■□□ 2.66
RABGGTA-206ENST00000558649 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.46■■■□□ 2.63
RABGGTA-206ENST00000558649 SCRIBQ14160 1630 aa31.24■■■□□ 2.59
RABGGTA-206ENST00000558649 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.17■■■□□ 2.589e-10■■□□□ 11.4
RABGGTA-206ENST00000558649 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.12■■■□□ 2.57
RABGGTA-206ENST00000558649 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.71■■■□□ 2.51
RABGGTA-206ENST00000558649 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.49■■■□□ 2.47
RABGGTA-206ENST00000558649 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
RABGGTA-206ENST00000558649 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.19■■■□□ 2.42
RABGGTA-206ENST00000558649 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.94■■■□□ 2.38
RABGGTA-206ENST00000558649 SMARCA4P51532 1647 aa29.82■■■□□ 2.36
RABGGTA-206ENST00000558649 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
RABGGTA-206ENST00000558649 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.61■■■□□ 2.33
RABGGTA-206ENST00000558649 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.58■■■□□ 2.33
RABGGTA-206ENST00000558649 SMARCA2P51531 1590 aa29.57■■■□□ 2.32
RABGGTA-206ENST00000558649 NCAPD3P42695 1498 aa29.51■■■□□ 2.31
RABGGTA-206ENST00000558649 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.45■■■□□ 2.31
RABGGTA-206ENST00000558649 HMGXB3Q12766 1538 aa29.43■■■□□ 2.3
RABGGTA-206ENST00000558649 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
RABGGTA-206ENST00000558649 WIZO95785 1651 aa29.35■■■□□ 2.29
RABGGTA-206ENST00000558649 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
RABGGTA-206ENST00000558649 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
RABGGTA-206ENST00000558649 NESP48681 1621 aa28.9■■■□□ 2.22
RABGGTA-206ENST00000558649 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.79■■■□□ 2.2
RABGGTA-206ENST00000558649 ERCC6Q03468 1493 aa28.78■■■□□ 2.2
RABGGTA-206ENST00000558649 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.67■■■□□ 2.18
RABGGTA-206ENST00000558649 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
RABGGTA-206ENST00000558649 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.63■■■□□ 2.17
RABGGTA-206ENST00000558649 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.62■■■□□ 2.17
RABGGTA-206ENST00000558649 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.56■■■□□ 2.16
RABGGTA-206ENST00000558649 CFTRP13569 1480 aa28.53■■■□□ 2.16
RABGGTA-206ENST00000558649 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
RABGGTA-206ENST00000558649 PRDM2Q13029 1718 aa28.45■■■□□ 2.14
RABGGTA-206ENST00000558649 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.4■■■□□ 2.14
RABGGTA-206ENST00000558649 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.38■■■□□ 2.13
RABGGTA-206ENST00000558649 CUX2O14529 1486 aa28.37■■■□□ 2.13
RABGGTA-206ENST00000558649 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.31■■■□□ 2.12
RABGGTA-206ENST00000558649 WDR62O43379 1518 aa28.21■■■□□ 2.11
RABGGTA-206ENST00000558649 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
RABGGTA-206ENST00000558649 TOPBP1Q92547 1522 aa27.96■■■□□ 2.07
RABGGTA-206ENST00000558649 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.94■■■□□ 2.06
RABGGTA-206ENST00000558649 ABCC8Q09428 1581 aa27.9■■■□□ 2.06
RABGGTA-206ENST00000558649 CUX1P39880 1505 aa27.78■■■□□ 2.04
RABGGTA-206ENST00000558649 IFT140Q96RY7 1462 aa27.74■■■□□ 2.03
RABGGTA-206ENST00000558649 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
RABGGTA-206ENST00000558649 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.69■■■□□ 2.02
RABGGTA-206ENST00000558649 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
RABGGTA-206ENST00000558649 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
RABGGTA-206ENST00000558649 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.63■■■□□ 2.01
RABGGTA-206ENST00000558649 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
RABGGTA-206ENST00000558649 SYNJ1O43426 1573 aa27.6■■■□□ 2.01
RABGGTA-206ENST00000558649 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
RABGGTA-206ENST00000558649 SOGA1O94964 1423 aa27.58■■■□□ 2.01
RABGGTA-206ENST00000558649 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.58■■■□□ 2.01
RABGGTA-206ENST00000558649 TOP2BQ02880 1626 aa27.56■■■□□ 2
RABGGTA-206ENST00000558649 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
RABGGTA-206ENST00000558649 WDR97A6NE52 1622 aa27.49■■□□□ 1.99
RABGGTA-206ENST00000558649 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
RABGGTA-206ENST00000558649 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.37■■□□□ 1.97
RABGGTA-206ENST00000558649 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.37■■□□□ 1.97
RABGGTA-206ENST00000558649 PBRM1Q86U86 1689 aa27.33■■□□□ 1.97
RABGGTA-206ENST00000558649 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.31■■□□□ 1.96
RABGGTA-206ENST00000558649 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.29■■□□□ 1.96
RABGGTA-206ENST00000558649 CHD1O14646 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
RABGGTA-206ENST00000558649 GRIN2BQ13224 1484 aa27.26■■□□□ 1.95
RABGGTA-206ENST00000558649 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.26■■□□□ 1.95
RABGGTA-206ENST00000558649 FBLN2P98095 1184 aa27.2■■□□□ 1.94
RABGGTA-206ENST00000558649 OSCARQ8IYS5 282 aa27.18■■□□□ 1.94
RABGGTA-206ENST00000558649 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
RABGGTA-206ENST00000558649 SYNJ2O15056 1496 aa27.08■■□□□ 1.93
RABGGTA-206ENST00000558649 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
RABGGTA-206ENST00000558649 ADAMTS12P58397 1594 aa27.06■■□□□ 1.92
RABGGTA-206ENST00000558649 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.06■■□□□ 1.92
RABGGTA-206ENST00000558649 KIF27Q86VH2 1401 aa27.01■■□□□ 1.91
RABGGTA-206ENST00000558649 TRIM41Q8WV44 630 aa27■■□□□ 1.91
RABGGTA-206ENST00000558649 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.95■■□□□ 1.9
RABGGTA-206ENST00000558649 GRIN2AQ12879 1464 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-206ENST00000558649 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-206ENST00000558649 CUL7Q14999 1698 aa26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-206ENST00000558649 IGF1RP08069 1367 aa26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-206ENST00000558649 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-206ENST00000558649 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-206ENST00000558649 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-206ENST00000558649 CEP170Q5SW79 1584 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-206ENST00000558649 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-206ENST00000558649 ARHGEF11O15085 1522 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-206ENST00000558649 NUP160Q12769 1436 aa26.77■■□□□ 1.88
RABGGTA-206ENST00000558649 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.72■■□□□ 1.87
RABGGTA-206ENST00000558649 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.69■■□□□ 1.86
RABGGTA-206ENST00000558649 SHROOM2Q13796 1616 aa26.61■■□□□ 1.85
RABGGTA-206ENST00000558649 ARAP1Q96P48 1450 aa26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-206ENST00000558649 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.6■■□□□ 1.85
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