RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558352.5

MFGE8-207, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 1,031 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-207ENST00000558352 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.37■■■■■ 4.53
MFGE8-207ENST00000558352 ABCC9O60706 1549 aa39.84■■■■□ 3.97
MFGE8-207ENST00000558352 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.96■■■■□ 3.83
MFGE8-207ENST00000558352 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.04■■■■□ 3.68
MFGE8-207ENST00000558352 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.51■■■■□ 3.6
MFGE8-207ENST00000558352 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.17■■■■□ 3.54
MFGE8-207ENST00000558352 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
MFGE8-207ENST00000558352 NACADO15069 1562 aa37.12■■■■□ 3.53
MFGE8-207ENST00000558352 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.45■■■■□ 3.43
MFGE8-207ENST00000558352 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.44■■■■□ 3.42
MFGE8-207ENST00000558352 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.39■■■■□ 3.42
MFGE8-207ENST00000558352 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.93■■■■□ 3.34
MFGE8-207ENST00000558352 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.85■■■■□ 3.33
MFGE8-207ENST00000558352 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.83■■■■□ 3.33
MFGE8-207ENST00000558352 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
MFGE8-207ENST00000558352 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.72■■■■□ 3.31
MFGE8-207ENST00000558352 SCRIBQ14160 1630 aa35.61■■■■□ 3.29
MFGE8-207ENST00000558352 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
MFGE8-207ENST00000558352 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.35■■■■□ 3.25
MFGE8-207ENST00000558352 CUX2O14529 1486 aa34.5■■■■□ 3.11
MFGE8-207ENST00000558352 ERCC6Q03468 1493 aa34.43■■■■□ 3.1
MFGE8-207ENST00000558352 NCAPD3P42695 1498 aa34.38■■■■□ 3.09
MFGE8-207ENST00000558352 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.19■■■■□ 3.06
MFGE8-207ENST00000558352 NESP48681 1621 aa34.03■■■■□ 3.04
MFGE8-207ENST00000558352 SMARCA2P51531 1590 aa33.98■■■■□ 3.03
MFGE8-207ENST00000558352 HMGXB3Q12766 1538 aa33.94■■■■□ 3.02
MFGE8-207ENST00000558352 SMARCA4P51532 1647 aa33.87■■■■□ 3.01
MFGE8-207ENST00000558352 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
MFGE8-207ENST00000558352 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
MFGE8-207ENST00000558352 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
MFGE8-207ENST00000558352 TRIM41Q8WV44 630 aa33.6■■■□□ 2.97
MFGE8-207ENST00000558352 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.57■■■□□ 2.96
MFGE8-207ENST00000558352 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.54■■■□□ 2.96
MFGE8-207ENST00000558352 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.53■■■□□ 2.96
MFGE8-207ENST00000558352 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.43■■■□□ 2.94
MFGE8-207ENST00000558352 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.36■■■□□ 2.93
MFGE8-207ENST00000558352 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.35■■■□□ 2.93
MFGE8-207ENST00000558352 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.24■■■□□ 2.91
MFGE8-207ENST00000558352 WDR62O43379 1518 aa33.11■■■□□ 2.89
MFGE8-207ENST00000558352 OSCARQ8IYS5 282 aa33.02■■■□□ 2.88
MFGE8-207ENST00000558352 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.98■■■□□ 2.87
MFGE8-207ENST00000558352 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.93■■■□□ 2.86
MFGE8-207ENST00000558352 WIZO95785 1651 aa32.92■■■□□ 2.86
MFGE8-207ENST00000558352 CFTRP13569 1480 aa32.79■■■□□ 2.84
MFGE8-207ENST00000558352 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
MFGE8-207ENST00000558352 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
MFGE8-207ENST00000558352 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
MFGE8-207ENST00000558352 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.41■■■□□ 2.78
MFGE8-207ENST00000558352 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.41■■■□□ 2.78
MFGE8-207ENST00000558352 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.41■■■□□ 2.78
MFGE8-207ENST00000558352 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
MFGE8-207ENST00000558352 IFT140Q96RY7 1462 aa32.37■■■□□ 2.77
MFGE8-207ENST00000558352 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.32■■■□□ 2.76
MFGE8-207ENST00000558352 ARHGEF11O15085 1522 aa32.31■■■□□ 2.76
MFGE8-207ENST00000558352 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.23■■■□□ 2.75
MFGE8-207ENST00000558352 TOPBP1Q92547 1522 aa32.21■■■□□ 2.75
MFGE8-207ENST00000558352 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
MFGE8-207ENST00000558352 FBLN2P98095 1184 aa32.11■■■□□ 2.73
MFGE8-207ENST00000558352 ABCC8Q09428 1581 aa32.09■■■□□ 2.73
MFGE8-207ENST00000558352 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.09■■■□□ 2.733e-8■■■■□ 21.1
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MFGE8-207ENST00000558352 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
MFGE8-207ENST00000558352 ARAP1Q96P48 1450 aa31.97■■■□□ 2.71
MFGE8-207ENST00000558352 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.96■■■□□ 2.71
MFGE8-207ENST00000558352 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
MFGE8-207ENST00000558352 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
MFGE8-207ENST00000558352 CHD1O14646 1710 aa31.84■■■□□ 2.69
MFGE8-207ENST00000558352 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
MFGE8-207ENST00000558352 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.81■■■□□ 2.68
MFGE8-207ENST00000558352 SOGA1O94964 1423 aa31.78■■■□□ 2.68
MFGE8-207ENST00000558352 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
MFGE8-207ENST00000558352 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.66■■■□□ 2.66
MFGE8-207ENST00000558352 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
MFGE8-207ENST00000558352 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
MFGE8-207ENST00000558352 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.57■■■□□ 2.64
MFGE8-207ENST00000558352 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.56■■■□□ 2.64
MFGE8-207ENST00000558352 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
MFGE8-207ENST00000558352 GRIN2BQ13224 1484 aa31.51■■■□□ 2.63
MFGE8-207ENST00000558352 SYNJ1O43426 1573 aa31.51■■■□□ 2.63
MFGE8-207ENST00000558352 SYNJ2O15056 1496 aa31.46■■■□□ 2.63
MFGE8-207ENST00000558352 WDR97A6NE52 1622 aa31.45■■■□□ 2.62
MFGE8-207ENST00000558352 CUX1P39880 1505 aa31.42■■■□□ 2.62
MFGE8-207ENST00000558352 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.39■■■□□ 2.62
MFGE8-207ENST00000558352 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.16■■■□□ 2.58
MFGE8-207ENST00000558352 PBRM1Q86U86 1689 aa31.11■■■□□ 2.57
MFGE8-207ENST00000558352 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.1■■■□□ 2.57
MFGE8-207ENST00000558352 GRIN2AQ12879 1464 aa31.07■■■□□ 2.56
MFGE8-207ENST00000558352 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.06■■■□□ 2.56
MFGE8-207ENST00000558352 NUP160Q12769 1436 aa31■■■□□ 2.55
MFGE8-207ENST00000558352 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.55
MFGE8-207ENST00000558352 CEP170Q5SW79 1584 aa30.97■■■□□ 2.55
MFGE8-207ENST00000558352 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.91■■■□□ 2.54
MFGE8-207ENST00000558352 ADAMTS12P58397 1594 aa30.88■■■□□ 2.53
MFGE8-207ENST00000558352 JPH4Q96JJ6 628 aa30.85■■■□□ 2.53
MFGE8-207ENST00000558352 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
MFGE8-207ENST00000558352 SHROOM2Q13796 1616 aa30.8■■■□□ 2.52
MFGE8-207ENST00000558352 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.79■■■□□ 2.52
MFGE8-207ENST00000558352 TOP2BQ02880 1626 aa30.79■■■□□ 2.52
MFGE8-207ENST00000558352 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.75■■■□□ 2.51
MFGE8-207ENST00000558352 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.75■■■□□ 2.51
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