RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556179.5

ZNF410-216, Transcript of zinc finger protein 410, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF410, Length 1,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF410-216ENST00000556179 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
ZNF410-216ENST00000556179 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.34■■□□□ 1.81
ZNF410-216ENST00000556179 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.07■■□□□ 1.6
ZNF410-216ENST00000556179 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF410-216ENST00000556179 ABCC9O60706 1549 aa23.34■■□□□ 1.33
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ZNF410-216ENST00000556179 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
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ZNF410-216ENST00000556179 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.99■■□□□ 1.11
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ZNF410-216ENST00000556179 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.78■■□□□ 1.08
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ZNF410-216ENST00000556179 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.69■■□□□ 1.06
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ZNF410-216ENST00000556179 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF410-216ENST00000556179 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.01■□□□□ 0.95
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ZNF410-216ENST00000556179 MSH5O43196 834 aa20.51■□□□□ 0.87
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ZNF410-216ENST00000556179 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF410-216ENST00000556179 SMARCA2P51531 1590 aa20.44■□□□□ 0.86
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ZNF410-216ENST00000556179 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.92■□□□□ 0.78
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ZNF410-216ENST00000556179 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.78■□□□□ 0.76
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ZNF410-216ENST00000556179 CUX1P39880 1505 aa19.06■□□□□ 0.64
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ZNF410-216ENST00000556179 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
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ZNF410-216ENST00000556179 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.86■□□□□ 0.61
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ZNF410-216ENST00000556179 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
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ZNF410-216ENST00000556179 SYNJ2O15056 1496 aa18.79■□□□□ 0.6
ZNF410-216ENST00000556179 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.79■□□□□ 0.6
ZNF410-216ENST00000556179 SYNJ1O43426 1573 aa18.78■□□□□ 0.6
ZNF410-216ENST00000556179 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.78■□□□□ 0.6
ZNF410-216ENST00000556179 PBRM1Q86U86 1689 aa18.77■□□□□ 0.6
ZNF410-216ENST00000556179 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF410-216ENST00000556179 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF410-216ENST00000556179 ARAP1Q96P48 1450 aa18.67■□□□□ 0.58
ZNF410-216ENST00000556179 ADAMTS12P58397 1594 aa18.64■□□□□ 0.57
ZNF410-216ENST00000556179 GRIN2AQ12879 1464 aa18.63■□□□□ 0.57
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