RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555817.1

CIDEB-205, Transcript of cell death-inducing DFFA-like effector b, humanhuman

TSL 4

Gene CIDEB, Length 552 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEB-205ENST00000555817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.02■■■■■ 6.56
CIDEB-205ENST00000555817 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.78■■■■■ 5.56
CIDEB-205ENST00000555817 ABCC9O60706 1549 aa48.65■■■■■ 5.38
CIDEB-205ENST00000555817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.85■■■■■ 5.09
CIDEB-205ENST00000555817 NACADO15069 1562 aa46.81■■■■■ 5.08
CIDEB-205ENST00000555817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.76■■■■■ 5.08
CIDEB-205ENST00000555817 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
CIDEB-205ENST00000555817 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.54■■■■■ 5.04
CIDEB-205ENST00000555817 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.36■■■■■ 5.01
CIDEB-205ENST00000555817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.77■■■■■ 4.92
CIDEB-205ENST00000555817 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.47■■■■■ 4.87
CIDEB-205ENST00000555817 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.41■■■■■ 4.86
CIDEB-205ENST00000555817 SCRIBQ14160 1630 aa45.41■■■■■ 4.86
CIDEB-205ENST00000555817 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.97■■■■■ 4.79
CIDEB-205ENST00000555817 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.62■■■■■ 4.73
CIDEB-205ENST00000555817 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
CIDEB-205ENST00000555817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.02■■■■■ 4.64
CIDEB-205ENST00000555817 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.72■■■■■ 4.59
CIDEB-205ENST00000555817 SMARCA4P51532 1647 aa43.45■■■■■ 4.55
CIDEB-205ENST00000555817 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
CIDEB-205ENST00000555817 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.21■■■■■ 4.51
CIDEB-205ENST00000555817 NCAPD3P42695 1498 aa43.19■■■■■ 4.5
CIDEB-205ENST00000555817 SMARCA2P51531 1590 aa43.16■■■■■ 4.5
CIDEB-205ENST00000555817 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.16■■■■■ 4.5
CIDEB-205ENST00000555817 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.03■■■■■ 4.48
CIDEB-205ENST00000555817 HMGXB3Q12766 1538 aa42.97■■■■■ 4.47
CIDEB-205ENST00000555817 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
CIDEB-205ENST00000555817 WIZO95785 1651 aa42.7■■■■■ 4.43
CIDEB-205ENST00000555817 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
CIDEB-205ENST00000555817 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
CIDEB-205ENST00000555817 NESP48681 1621 aa42.11■■■■■ 4.33
CIDEB-205ENST00000555817 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.04■■■■■ 4.32
CIDEB-205ENST00000555817 ERCC6Q03468 1493 aa41.94■■■■■ 4.3
CIDEB-205ENST00000555817 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.93■■■■■ 4.3
CIDEB-205ENST00000555817 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.76■■■■■ 4.28
CIDEB-205ENST00000555817 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.76■■■■■ 4.28
CIDEB-205ENST00000555817 CFTRP13569 1480 aa41.68■■■■■ 4.26
CIDEB-205ENST00000555817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.62■■■■■ 4.25
CIDEB-205ENST00000555817 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CIDEB-205ENST00000555817 CUX2O14529 1486 aa41.49■■■■■ 4.23
CIDEB-205ENST00000555817 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CIDEB-205ENST00000555817 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.45■■■■■ 4.23
CIDEB-205ENST00000555817 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.39■■■■■ 4.22
CIDEB-205ENST00000555817 PRDM2Q13029 1718 aa41.38■■■■■ 4.22
CIDEB-205ENST00000555817 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.32■■■■■ 4.2
CIDEB-205ENST00000555817 WDR62O43379 1518 aa41.18■■■■■ 4.18
CIDEB-205ENST00000555817 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
CIDEB-205ENST00000555817 ABCC8Q09428 1581 aa40.8■■■■■ 4.12
CIDEB-205ENST00000555817 TOPBP1Q92547 1522 aa40.78■■■■■ 4.12
CIDEB-205ENST00000555817 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.74■■■■■ 4.11
CIDEB-205ENST00000555817 IFT140Q96RY7 1462 aa40.52■■■■■ 4.08
CIDEB-205ENST00000555817 CUX1P39880 1505 aa40.49■■■■■ 4.07
CIDEB-205ENST00000555817 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
CIDEB-205ENST00000555817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.34■■■■■ 4.05
CIDEB-205ENST00000555817 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
CIDEB-205ENST00000555817 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
CIDEB-205ENST00000555817 SOGA1O94964 1423 aa40.28■■■■■ 4.04
CIDEB-205ENST00000555817 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.26■■■■■ 4.03
CIDEB-205ENST00000555817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.25■■■■■ 4.03
CIDEB-205ENST00000555817 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.17■■■■■ 4.02
CIDEB-205ENST00000555817 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
CIDEB-205ENST00000555817 TOP2BQ02880 1626 aa40.16■■■■■ 4.02
CIDEB-205ENST00000555817 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.16■■■■■ 4.02
CIDEB-205ENST00000555817 SYNJ1O43426 1573 aa40.14■■■■■ 4.02
CIDEB-205ENST00000555817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.11■■■■■ 4.01
CIDEB-205ENST00000555817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
CIDEB-205ENST00000555817 WDR97A6NE52 1622 aa40.04■■■■■ 4
CIDEB-205ENST00000555817 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.97■■■■□ 3.99
CIDEB-205ENST00000555817 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.81■■■■□ 3.96
CIDEB-205ENST00000555817 GRIN2BQ13224 1484 aa39.81■■■■□ 3.96
CIDEB-205ENST00000555817 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.8■■■■□ 3.96
CIDEB-205ENST00000555817 OSCARQ8IYS5 282 aa39.79■■■■□ 3.96
CIDEB-205ENST00000555817 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.74■■■■□ 3.95
CIDEB-205ENST00000555817 PBRM1Q86U86 1689 aa39.73■■■■□ 3.95
CIDEB-205ENST00000555817 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
CIDEB-205ENST00000555817 CHD1O14646 1710 aa39.65■■■■□ 3.94
CIDEB-205ENST00000555817 FBLN2P98095 1184 aa39.62■■■■□ 3.93
CIDEB-205ENST00000555817 SYNJ2O15056 1496 aa39.54■■■■□ 3.92
CIDEB-205ENST00000555817 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
CIDEB-205ENST00000555817 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.5■■■■□ 3.91
CIDEB-205ENST00000555817 ADAMTS12P58397 1594 aa39.42■■■■□ 3.9
CIDEB-205ENST00000555817 KIF27Q86VH2 1401 aa39.4■■■■□ 3.9
CIDEB-205ENST00000555817 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.36■■■■□ 3.89
CIDEB-205ENST00000555817 TRIM41Q8WV44 630 aa39.33■■■■□ 3.89
CIDEB-205ENST00000555817 GRIN2AQ12879 1464 aa39.29■■■■□ 3.88
CIDEB-205ENST00000555817 IGF1RP08069 1367 aa39.25■■■■□ 3.87
CIDEB-205ENST00000555817 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.24■■■■□ 3.87
CIDEB-205ENST00000555817 CUL7Q14999 1698 aa39.15■■■■□ 3.86
CIDEB-205ENST00000555817 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.13■■■■□ 3.85
CIDEB-205ENST00000555817 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.13■■■■□ 3.85
CIDEB-205ENST00000555817 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.13■■■■□ 3.85
CIDEB-205ENST00000555817 ARHGEF11O15085 1522 aa39.13■■■■□ 3.85
CIDEB-205ENST00000555817 NUP160Q12769 1436 aa39.12■■■■□ 3.85
CIDEB-205ENST00000555817 CEP170Q5SW79 1584 aa39.09■■■■□ 3.85
CIDEB-205ENST00000555817 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.04■■■■□ 3.84
CIDEB-205ENST00000555817 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.01■■■■□ 3.84
CIDEB-205ENST00000555817 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.88■■■■□ 3.81
CIDEB-205ENST00000555817 ARAP1Q96P48 1450 aa38.82■■■■□ 3.81
CIDEB-205ENST00000555817 SHROOM2Q13796 1616 aa38.81■■■■□ 3.8
CIDEB-205ENST00000555817 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.79■■■■□ 3.8
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