RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555704.5

KLHDC1-204, Transcript of kelch domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KLHDC1, Length 1,447 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC1-204ENST00000555704 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.39■■■■■ 7.42
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KLHDC1-204ENST00000555704 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.22■■■■■ 5.79
KLHDC1-204ENST00000555704 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.2■■■■■ 5.79
KLHDC1-204ENST00000555704 NACADO15069 1562 aa51.19■■■■■ 5.78
KLHDC1-204ENST00000555704 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.13■■■■■ 5.78
KLHDC1-204ENST00000555704 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.95■■■■■ 5.75
KLHDC1-204ENST00000555704 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.79■■■■■ 5.72
KLHDC1-204ENST00000555704 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.06■■■■■ 5.6
KLHDC1-204ENST00000555704 SCRIBQ14160 1630 aa49.77■■■■■ 5.56
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KLHDC1-204ENST00000555704 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.7■■■■■ 5.39
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KLHDC1-204ENST00000555704 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.12■■■■■ 5.29
KLHDC1-204ENST00000555704 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.84■■■■■ 5.25
KLHDC1-204ENST00000555704 SMARCA4P51532 1647 aa47.61■■■■■ 5.21
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KLHDC1-204ENST00000555704 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.32■■■■■ 5.17
KLHDC1-204ENST00000555704 NCAPD3P42695 1498 aa47.25■■■■■ 5.15
KLHDC1-204ENST00000555704 SMARCA2P51531 1590 aa47.23■■■■■ 5.15
KLHDC1-204ENST00000555704 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.15■■■■■ 5.14
KLHDC1-204ENST00000555704 HMGXB3Q12766 1538 aa47.05■■■■■ 5.12
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KLHDC1-204ENST00000555704 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.96■■■■■ 4.95
KLHDC1-204ENST00000555704 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.87■■■■■ 4.93
KLHDC1-204ENST00000555704 ERCC6Q03468 1493 aa45.81■■■■■ 4.92
KLHDC1-204ENST00000555704 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.79■■■■■ 4.92
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KLHDC1-204ENST00000555704 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.63■■■■■ 4.9
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KLHDC1-204ENST00000555704 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.39■■■■■ 4.86
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KLHDC1-204ENST00000555704 CUX2O14529 1486 aa45.28■■■■■ 4.84
KLHDC1-204ENST00000555704 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.28■■■■■ 4.84
KLHDC1-204ENST00000555704 PRDM2Q13029 1718 aa45.26■■■■■ 4.84
KLHDC1-204ENST00000555704 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.2■■■■■ 4.83
KLHDC1-204ENST00000555704 WDR62O43379 1518 aa45.06■■■■■ 4.8
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KLHDC1-204ENST00000555704 TOPBP1Q92547 1522 aa44.67■■■■■ 4.74
KLHDC1-204ENST00000555704 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.62■■■■■ 4.73
KLHDC1-204ENST00000555704 ABCC8Q09428 1581 aa44.6■■■■■ 4.73
KLHDC1-204ENST00000555704 CUX1P39880 1505 aa44.4■■■■■ 4.7
KLHDC1-204ENST00000555704 IFT140Q96RY7 1462 aa44.32■■■■■ 4.69
KLHDC1-204ENST00000555704 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
KLHDC1-204ENST00000555704 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.22■■■■■ 4.67
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KLHDC1-204ENST00000555704 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.03■■■■■ 4.64
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KLHDC1-204ENST00000555704 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.62■■■■■ 4.57
KLHDC1-204ENST00000555704 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.58■■■■■ 4.57
KLHDC1-204ENST00000555704 GRIN2BQ13224 1484 aa43.56■■■■■ 4.56
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KLHDC1-204ENST00000555704 PBRM1Q86U86 1689 aa43.49■■■■■ 4.55
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KLHDC1-204ENST00000555704 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.25■■■■■ 4.51
KLHDC1-204ENST00000555704 ADAMTS12P58397 1594 aa43.21■■■■■ 4.51
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KLHDC1-204ENST00000555704 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.74■■■■■ 4.43
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KLHDC1-204ENST00000555704 ARAP1Q96P48 1450 aa42.45■■■■■ 4.39
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