RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554304.5

SLC38A6-218, Transcript of solute carrier family 38 member 6, humanhuman

TSL 3

Gene SLC38A6, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6-218ENST00000554304 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.01■■■□□ 2.55
SLC38A6-218ENST00000554304 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.66■■■□□ 2.02
SLC38A6-218ENST00000554304 ABCC9O60706 1549 aa27.2■■□□□ 1.94
SLC38A6-218ENST00000554304 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SLC38A6-218ENST00000554304 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC38A6-218ENST00000554304 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC38A6-218ENST00000554304 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.14■■□□□ 1.78
SLC38A6-218ENST00000554304 NACADO15069 1562 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC38A6-218ENST00000554304 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.82■■□□□ 1.72
SLC38A6-218ENST00000554304 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SLC38A6-218ENST00000554304 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.65■■□□□ 1.7
SLC38A6-218ENST00000554304 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.49■■□□□ 1.67
SLC38A6-218ENST00000554304 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
SLC38A6-218ENST00000554304 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC38A6-218ENST00000554304 SCRIBQ14160 1630 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC38A6-218ENST00000554304 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC38A6-218ENST00000554304 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC38A6-218ENST00000554304 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SLC38A6-218ENST00000554304 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC38A6-218ENST00000554304 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.47■■□□□ 1.51
SLC38A6-218ENST00000554304 SMARCA4P51532 1647 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC38A6-218ENST00000554304 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SLC38A6-218ENST00000554304 SMARCA2P51531 1590 aa24.02■■□□□ 1.44
SLC38A6-218ENST00000554304 NCAPD3P42695 1498 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC38A6-218ENST00000554304 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24■■□□□ 1.43
SLC38A6-218ENST00000554304 HMGXB3Q12766 1538 aa23.88■■□□□ 1.41
SLC38A6-218ENST00000554304 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.87■■□□□ 1.41
SLC38A6-218ENST00000554304 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SLC38A6-218ENST00000554304 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.83■■□□□ 1.41
SLC38A6-218ENST00000554304 WIZO95785 1651 aa23.64■■□□□ 1.37
SLC38A6-218ENST00000554304 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SLC38A6-218ENST00000554304 ERCC6Q03468 1493 aa23.54■■□□□ 1.36
SLC38A6-218ENST00000554304 NESP48681 1621 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC38A6-218ENST00000554304 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC38A6-218ENST00000554304 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SLC38A6-218ENST00000554304 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.35■■□□□ 1.33
SLC38A6-218ENST00000554304 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC38A6-218ENST00000554304 CUX2O14529 1486 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC38A6-218ENST00000554304 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC38A6-218ENST00000554304 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SLC38A6-218ENST00000554304 CFTRP13569 1480 aa23.13■■□□□ 1.29
SLC38A6-218ENST00000554304 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SLC38A6-218ENST00000554304 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.11■■□□□ 1.29
SLC38A6-218ENST00000554304 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC38A6-218ENST00000554304 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SLC38A6-218ENST00000554304 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC38A6-218ENST00000554304 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC38A6-218ENST00000554304 PRDM2Q13029 1718 aa23■■□□□ 1.27
SLC38A6-218ENST00000554304 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SLC38A6-218ENST00000554304 WDR62O43379 1518 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC38A6-218ENST00000554304 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SLC38A6-218ENST00000554304 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.75■■□□□ 1.23
SLC38A6-218ENST00000554304 ABCC8Q09428 1581 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC38A6-218ENST00000554304 TOPBP1Q92547 1522 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC38A6-218ENST00000554304 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC38A6-218ENST00000554304 IFT140Q96RY7 1462 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC38A6-218ENST00000554304 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SLC38A6-218ENST00000554304 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SLC38A6-218ENST00000554304 SOGA1O94964 1423 aa22.42■■□□□ 1.18
SLC38A6-218ENST00000554304 CUX1P39880 1505 aa22.4■■□□□ 1.18
SLC38A6-218ENST00000554304 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SLC38A6-218ENST00000554304 OSCARQ8IYS5 282 aa22.38■■□□□ 1.17
SLC38A6-218ENST00000554304 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.38■■□□□ 1.17
SLC38A6-218ENST00000554304 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC38A6-218ENST00000554304 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SLC38A6-218ENST00000554304 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
SLC38A6-218ENST00000554304 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SLC38A6-218ENST00000554304 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
SLC38A6-218ENST00000554304 WDR97A6NE52 1622 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC38A6-218ENST00000554304 FBLN2P98095 1184 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC38A6-218ENST00000554304 TOP2BQ02880 1626 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC38A6-218ENST00000554304 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.2■■□□□ 1.15
SLC38A6-218ENST00000554304 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC38A6-218ENST00000554304 GRIN2BQ13224 1484 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC38A6-218ENST00000554304 SYNJ1O43426 1573 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC38A6-218ENST00000554304 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC38A6-218ENST00000554304 CHD1O14646 1710 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC38A6-218ENST00000554304 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SLC38A6-218ENST00000554304 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6-218ENST00000554304 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6-218ENST00000554304 PBRM1Q86U86 1689 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC38A6-218ENST00000554304 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC38A6-218ENST00000554304 SYNJ2O15056 1496 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC38A6-218ENST00000554304 TRIM41Q8WV44 630 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC38A6-218ENST00000554304 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC38A6-218ENST00000554304 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC38A6-218ENST00000554304 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC38A6-218ENST00000554304 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC38A6-218ENST00000554304 ARHGEF11O15085 1522 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC38A6-218ENST00000554304 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC38A6-218ENST00000554304 ADAMTS12P58397 1594 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC38A6-218ENST00000554304 KIF27Q86VH2 1401 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC38A6-218ENST00000554304 GRIN2AQ12879 1464 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC38A6-218ENST00000554304 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC38A6-218ENST00000554304 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC38A6-218ENST00000554304 IGF1RP08069 1367 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC38A6-218ENST00000554304 NUP160Q12769 1436 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC38A6-218ENST00000554304 CUL7Q14999 1698 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC38A6-218ENST00000554304 CEP170Q5SW79 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ARAP1Q96P48 1450 aa21.69■■□□□ 1.06
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