RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550071.1

COQ10A-206, Transcript of coenzyme Q10A, humanhuman

TSL 2

Gene COQ10A, Length 665 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ10A-206ENST00000550071 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.47■■■□□ 2.31
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COQ10A-206ENST00000550071 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.92■■□□□ 1.74
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COQ10A-206ENST00000550071 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.35■■□□□ 1.65
COQ10A-206ENST00000550071 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.32■■□□□ 1.64
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COQ10A-206ENST00000550071 HMGXB3Q12766 1538 aa23.31■■□□□ 1.32
COQ10A-206ENST00000550071 SMARCA2P51531 1590 aa23.29■■□□□ 1.32
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COQ10A-206ENST00000550071 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.18■■□□□ 1.3
COQ10A-206ENST00000550071 SMARCA4P51532 1647 aa23.17■■□□□ 1.3
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COQ10A-206ENST00000550071 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.89■■□□□ 1.26
COQ10A-206ENST00000550071 WDR62O43379 1518 aa22.88■■□□□ 1.25
COQ10A-206ENST00000550071 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.81■■□□□ 1.24
COQ10A-206ENST00000550071 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.76■■□□□ 1.23
COQ10A-206ENST00000550071 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.7■■□□□ 1.22
COQ10A-206ENST00000550071 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.7■■□□□ 1.22
COQ10A-206ENST00000550071 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.7■■□□□ 1.22
COQ10A-206ENST00000550071 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.68■■□□□ 1.22
COQ10A-206ENST00000550071 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.58■■□□□ 1.2
COQ10A-206ENST00000550071 ARHGEF11O15085 1522 aa22.53■■□□□ 1.2
COQ10A-206ENST00000550071 WIZO95785 1651 aa22.52■■□□□ 1.2
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COQ10A-206ENST00000550071 CFTRP13569 1480 aa22.36■■□□□ 1.17
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COQ10A-206ENST00000550071 PRDM2Q13029 1718 aa22.14■■□□□ 1.13
COQ10A-206ENST00000550071 FBLN2P98095 1184 aa22.09■■□□□ 1.13
COQ10A-206ENST00000550071 TOPBP1Q92547 1522 aa22.06■■□□□ 1.12
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COQ10A-206ENST00000550071 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.75■■□□□ 1.07
COQ10A-206ENST00000550071 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
COQ10A-206ENST00000550071 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.72■■□□□ 1.07
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COQ10A-206ENST00000550071 WDR97A6NE52 1622 aa21.61■■□□□ 1.05
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COQ10A-206ENST00000550071 GRIN2BQ13224 1484 aa21.57■■□□□ 1.04
COQ10A-206ENST00000550071 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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COQ10A-206ENST00000550071 CUX1P39880 1505 aa21.38■■□□□ 1.01
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COQ10A-206ENST00000550071 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.26■□□□□ 0.99
COQ10A-206ENST00000550071 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.26■□□□□ 0.99
COQ10A-206ENST00000550071 SHROOM2Q13796 1616 aa21.24■□□□□ 0.99
COQ10A-206ENST00000550071 NUP160Q12769 1436 aa21.22■□□□□ 0.99
COQ10A-206ENST00000550071 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.21■□□□□ 0.99
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COQ10A-206ENST00000550071 DIP2BQ9P265 1576 aa21.14■□□□□ 0.97
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