RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546544.5

COQ10A-203, Transcript of coenzyme Q10A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COQ10A, Length 1,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ10A-203ENST00000546544 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.17■■■□□ 2.26
COQ10A-203ENST00000546544 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.02■■□□□ 1.76
COQ10A-203ENST00000546544 ABCC9O60706 1549 aa25.42■■□□□ 1.66
COQ10A-203ENST00000546544 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.48■■□□□ 1.51
COQ10A-203ENST00000546544 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.43■■□□□ 1.5
COQ10A-203ENST00000546544 NACADO15069 1562 aa24.43■■□□□ 1.5
COQ10A-203ENST00000546544 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
COQ10A-203ENST00000546544 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.27■■□□□ 1.48
COQ10A-203ENST00000546544 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.13■■□□□ 1.45
COQ10A-203ENST00000546544 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.06■■□□□ 1.44
COQ10A-203ENST00000546544 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.77■■□□□ 1.4
COQ10A-203ENST00000546544 SCRIBQ14160 1630 aa23.71■■□□□ 1.39
COQ10A-203ENST00000546544 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
COQ10A-203ENST00000546544 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.52■■□□□ 1.36
COQ10A-203ENST00000546544 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.43■■□□□ 1.34
COQ10A-203ENST00000546544 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
COQ10A-203ENST00000546544 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.07■■□□□ 1.28
COQ10A-203ENST00000546544 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.88■■□□□ 1.25
COQ10A-203ENST00000546544 SMARCA4P51532 1647 aa22.66■■□□□ 1.22
COQ10A-203ENST00000546544 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
COQ10A-203ENST00000546544 SMARCA2P51531 1590 aa22.53■■□□□ 1.2
COQ10A-203ENST00000546544 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.51■■□□□ 1.19
COQ10A-203ENST00000546544 NCAPD3P42695 1498 aa22.5■■□□□ 1.19
COQ10A-203ENST00000546544 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.47■■□□□ 1.19
COQ10A-203ENST00000546544 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.44■■□□□ 1.18
COQ10A-203ENST00000546544 HMGXB3Q12766 1538 aa22.43■■□□□ 1.18
COQ10A-203ENST00000546544 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
COQ10A-203ENST00000546544 WIZO95785 1651 aa22.25■■□□□ 1.15
COQ10A-203ENST00000546544 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COQ10A-203ENST00000546544 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
COQ10A-203ENST00000546544 NESP48681 1621 aa21.98■■□□□ 1.11
COQ10A-203ENST00000546544 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.98■■□□□ 1.11
COQ10A-203ENST00000546544 ERCC6Q03468 1493 aa21.95■■□□□ 1.1
COQ10A-203ENST00000546544 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.85■■□□□ 1.09
COQ10A-203ENST00000546544 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.83■■□□□ 1.09
COQ10A-203ENST00000546544 CUX2O14529 1486 aa21.8■■□□□ 1.08
COQ10A-203ENST00000546544 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.8■■□□□ 1.08
COQ10A-203ENST00000546544 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
COQ10A-203ENST00000546544 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.74■■□□□ 1.07
COQ10A-203ENST00000546544 CFTRP13569 1480 aa21.71■■□□□ 1.07
COQ10A-203ENST00000546544 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
COQ10A-203ENST00000546544 PRDM2Q13029 1718 aa21.69■■□□□ 1.06
COQ10A-203ENST00000546544 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.62■■□□□ 1.05
COQ10A-203ENST00000546544 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.62■■□□□ 1.05
COQ10A-203ENST00000546544 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.57■■□□□ 1.04
COQ10A-203ENST00000546544 WDR62O43379 1518 aa21.54■■□□□ 1.04
COQ10A-203ENST00000546544 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
COQ10A-203ENST00000546544 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
COQ10A-203ENST00000546544 ABCC8Q09428 1581 aa21.3■■□□□ 1
COQ10A-203ENST00000546544 TOPBP1Q92547 1522 aa21.27■□□□□ 0.99
COQ10A-203ENST00000546544 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.26■□□□□ 0.99
COQ10A-203ENST00000546544 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.22■□□□□ 0.99
COQ10A-203ENST00000546544 IFT140Q96RY7 1462 aa21.14■□□□□ 0.98
COQ10A-203ENST00000546544 CUX1P39880 1505 aa21.09■□□□□ 0.97
COQ10A-203ENST00000546544 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
COQ10A-203ENST00000546544 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
COQ10A-203ENST00000546544 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.04■□□□□ 0.96
COQ10A-203ENST00000546544 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
COQ10A-203ENST00000546544 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
COQ10A-203ENST00000546544 SOGA1O94964 1423 aa21■□□□□ 0.95
COQ10A-203ENST00000546544 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
COQ10A-203ENST00000546544 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.98■□□□□ 0.95
COQ10A-203ENST00000546544 TOP2BQ02880 1626 aa20.93■□□□□ 0.94
COQ10A-203ENST00000546544 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.93■□□□□ 0.94
COQ10A-203ENST00000546544 WDR97A6NE52 1622 aa20.92■□□□□ 0.94
COQ10A-203ENST00000546544 SYNJ1O43426 1573 aa20.91■□□□□ 0.94
COQ10A-203ENST00000546544 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 30
COQ10A-203ENST00000546544 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
COQ10A-203ENST00000546544 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.82■□□□□ 0.92
COQ10A-203ENST00000546544 CHD1O14646 1710 aa20.81■□□□□ 0.92
COQ10A-203ENST00000546544 PBRM1Q86U86 1689 aa20.77■□□□□ 0.92
COQ10A-203ENST00000546544 OSCARQ8IYS5 282 aa20.77■□□□□ 0.92
COQ10A-203ENST00000546544 GRIN2BQ13224 1484 aa20.77■□□□□ 0.92
COQ10A-203ENST00000546544 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.77■□□□□ 0.92
COQ10A-203ENST00000546544 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.75■□□□□ 0.91
COQ10A-203ENST00000546544 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.74■□□□□ 0.91
COQ10A-203ENST00000546544 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
COQ10A-203ENST00000546544 FBLN2P98095 1184 aa20.72■□□□□ 0.91
COQ10A-203ENST00000546544 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
COQ10A-203ENST00000546544 SYNJ2O15056 1496 aa20.63■□□□□ 0.89
COQ10A-203ENST00000546544 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.6■□□□□ 0.89
COQ10A-203ENST00000546544 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.59■□□□□ 0.89
COQ10A-203ENST00000546544 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.58■□□□□ 0.89
COQ10A-203ENST00000546544 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.58■□□□□ 0.89
COQ10A-203ENST00000546544 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.58■□□□□ 0.89
COQ10A-203ENST00000546544 ADAMTS12P58397 1594 aa20.57■□□□□ 0.88
COQ10A-203ENST00000546544 KIF27Q86VH2 1401 aa20.57■□□□□ 0.88
COQ10A-203ENST00000546544 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.54■□□□□ 0.88
COQ10A-203ENST00000546544 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.53■□□□□ 0.88
COQ10A-203ENST00000546544 ARHGEF11O15085 1522 aa20.53■□□□□ 0.88
COQ10A-203ENST00000546544 TRIM41Q8WV44 630 aa20.52■□□□□ 0.88
COQ10A-203ENST00000546544 GRIN2AQ12879 1464 aa20.5■□□□□ 0.87
COQ10A-203ENST00000546544 CUL7Q14999 1698 aa20.44■□□□□ 0.86
COQ10A-203ENST00000546544 IGF1RP08069 1367 aa20.41■□□□□ 0.86
COQ10A-203ENST00000546544 CEP170Q5SW79 1584 aa20.39■□□□□ 0.85
COQ10A-203ENST00000546544 NUP160Q12769 1436 aa20.38■□□□□ 0.85
COQ10A-203ENST00000546544 ARAP1Q96P48 1450 aa20.34■□□□□ 0.85
COQ10A-203ENST00000546544 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.34■□□□□ 0.85
COQ10A-203ENST00000546544 SHROOM2Q13796 1616 aa20.31■□□□□ 0.84
COQ10A-203ENST00000546544 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms