RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545809.1

CCDC189-210, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,055 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-210ENST00000545809 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.85■■■■■ 6.53
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CCDC189-210ENST00000545809 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.71■■■■■ 5.07
CCDC189-210ENST00000545809 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.69■■■■■ 5.06
CCDC189-210ENST00000545809 NACADO15069 1562 aa46.66■■■■■ 5.06
CCDC189-210ENST00000545809 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.53■■■■■ 5.04
CCDC189-210ENST00000545809 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.39■■■■■ 5.02
CCDC189-210ENST00000545809 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.22■■■■■ 4.99
CCDC189-210ENST00000545809 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.57■■■■■ 4.89
CCDC189-210ENST00000545809 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.36■■■■■ 4.85
CCDC189-210ENST00000545809 SCRIBQ14160 1630 aa45.3■■■■■ 4.84
CCDC189-210ENST00000545809 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.25■■■■■ 4.83
CCDC189-210ENST00000545809 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.83■■■■■ 4.77
CCDC189-210ENST00000545809 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.46■■■■■ 4.71
CCDC189-210ENST00000545809 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
CCDC189-210ENST00000545809 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.88■■■■■ 4.61
CCDC189-210ENST00000545809 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.6■■■■■ 4.57
CCDC189-210ENST00000545809 SMARCA4P51532 1647 aa43.33■■■■■ 4.53
CCDC189-210ENST00000545809 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
CCDC189-210ENST00000545809 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.07■■■■■ 4.49
CCDC189-210ENST00000545809 SMARCA2P51531 1590 aa43.05■■■■■ 4.48
CCDC189-210ENST00000545809 NCAPD3P42695 1498 aa43.05■■■■■ 4.48
CCDC189-210ENST00000545809 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.03■■■■■ 4.48
CCDC189-210ENST00000545809 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.89■■■■■ 4.46
CCDC189-210ENST00000545809 HMGXB3Q12766 1538 aa42.85■■■■■ 4.45
CCDC189-210ENST00000545809 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
CCDC189-210ENST00000545809 WIZO95785 1651 aa42.57■■■■■ 4.41
CCDC189-210ENST00000545809 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
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CCDC189-210ENST00000545809 NESP48681 1621 aa41.99■■■■■ 4.31
CCDC189-210ENST00000545809 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.91■■■■■ 4.3
CCDC189-210ENST00000545809 ERCC6Q03468 1493 aa41.85■■■■■ 4.29
CCDC189-210ENST00000545809 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.81■■■■■ 4.28
CCDC189-210ENST00000545809 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.65■■■■■ 4.26
CCDC189-210ENST00000545809 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.65■■■■■ 4.26
CCDC189-210ENST00000545809 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
CCDC189-210ENST00000545809 CFTRP13569 1480 aa41.56■■■■■ 4.24
CCDC189-210ENST00000545809 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.49■■■■■ 4.23
CCDC189-210ENST00000545809 CUX2O14529 1486 aa41.37■■■■■ 4.21
CCDC189-210ENST00000545809 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
CCDC189-210ENST00000545809 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.33■■■■■ 4.21
CCDC189-210ENST00000545809 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.28■■■■■ 4.2
CCDC189-210ENST00000545809 PRDM2Q13029 1718 aa41.22■■■■■ 4.19
CCDC189-210ENST00000545809 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.21■■■■■ 4.19
CCDC189-210ENST00000545809 WDR62O43379 1518 aa41.05■■■■■ 4.16
CCDC189-210ENST00000545809 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
CCDC189-210ENST00000545809 ABCC8Q09428 1581 aa40.69■■■■■ 4.1
CCDC189-210ENST00000545809 TOPBP1Q92547 1522 aa40.67■■■■■ 4.1
CCDC189-210ENST00000545809 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.63■■■■■ 4.09
CCDC189-210ENST00000545809 IFT140Q96RY7 1462 aa40.42■■■■■ 4.06
CCDC189-210ENST00000545809 CUX1P39880 1505 aa40.37■■■■■ 4.05
CCDC189-210ENST00000545809 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
CCDC189-210ENST00000545809 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.25■■■■■ 4.03
CCDC189-210ENST00000545809 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
CCDC189-210ENST00000545809 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
CCDC189-210ENST00000545809 SOGA1O94964 1423 aa40.18■■■■■ 4.02
CCDC189-210ENST00000545809 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.02
CCDC189-210ENST00000545809 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.15■■■■■ 4.02
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CCDC189-210ENST00000545809 TOP2BQ02880 1626 aa40.05■■■■■ 4
CCDC189-210ENST00000545809 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.04■■■■■ 4
CCDC189-210ENST00000545809 SYNJ1O43426 1573 aa40.03■■■■■ 4
CCDC189-210ENST00000545809 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.03■■■■■ 4
CCDC189-210ENST00000545809 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40■■■■□ 3.993e-6■■■■□ 22.9
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CCDC189-210ENST00000545809 WDR97A6NE52 1622 aa39.91■■■■□ 3.98
CCDC189-210ENST00000545809 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.86■■■■□ 3.97
CCDC189-210ENST00000545809 GRIN2BQ13224 1484 aa39.71■■■■□ 3.95
CCDC189-210ENST00000545809 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.71■■■■□ 3.95
CCDC189-210ENST00000545809 OSCARQ8IYS5 282 aa39.69■■■■□ 3.94
CCDC189-210ENST00000545809 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.68■■■■□ 3.94
CCDC189-210ENST00000545809 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.63■■■■□ 3.94
CCDC189-210ENST00000545809 PBRM1Q86U86 1689 aa39.6■■■■□ 3.93
CCDC189-210ENST00000545809 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
CCDC189-210ENST00000545809 FBLN2P98095 1184 aa39.55■■■■□ 3.92
CCDC189-210ENST00000545809 CHD1O14646 1710 aa39.52■■■■□ 3.92
CCDC189-210ENST00000545809 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
CCDC189-210ENST00000545809 SYNJ2O15056 1496 aa39.43■■■■□ 3.9
CCDC189-210ENST00000545809 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.39■■■■□ 3.9
CCDC189-210ENST00000545809 KIF27Q86VH2 1401 aa39.33■■■■□ 3.89
CCDC189-210ENST00000545809 ADAMTS12P58397 1594 aa39.3■■■■□ 3.88
CCDC189-210ENST00000545809 TRIM41Q8WV44 630 aa39.27■■■■□ 3.88
CCDC189-210ENST00000545809 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.26■■■■□ 3.88
CCDC189-210ENST00000545809 GRIN2AQ12879 1464 aa39.19■■■■□ 3.86
CCDC189-210ENST00000545809 IGF1RP08069 1367 aa39.14■■■■□ 3.86
CCDC189-210ENST00000545809 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.11■■■■□ 3.85
CCDC189-210ENST00000545809 CUL7Q14999 1698 aa39.04■■■■□ 3.84
CCDC189-210ENST00000545809 ARHGEF11O15085 1522 aa39.01■■■■□ 3.84
CCDC189-210ENST00000545809 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39■■■■□ 3.83
CCDC189-210ENST00000545809 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39■■■■□ 3.83
CCDC189-210ENST00000545809 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39■■■■□ 3.83
CCDC189-210ENST00000545809 NUP160Q12769 1436 aa39■■■■□ 3.83
CCDC189-210ENST00000545809 CEP170Q5SW79 1584 aa38.97■■■■□ 3.83
CCDC189-210ENST00000545809 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.94■■■■□ 3.82
CCDC189-210ENST00000545809 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.93■■■■□ 3.82
CCDC189-210ENST00000545809 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.8■■■■□ 3.8
CCDC189-210ENST00000545809 ARAP1Q96P48 1450 aa38.7■■■■□ 3.79
CCDC189-210ENST00000545809 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.7■■■■□ 3.79
CCDC189-210ENST00000545809 SHROOM2Q13796 1616 aa38.69■■■■□ 3.78
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