RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545344.5

TM7SF3-218, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-218ENST00000545344 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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TM7SF3-218ENST00000545344 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3-218ENST00000545344 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
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TM7SF3-218ENST00000545344 ABCC9O60706 1549 aa18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3-218ENST00000545344 FOXD1Q16676 465 aa17.94■□□□□ 0.46
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TM7SF3-218ENST00000545344 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.24■□□□□ 0.35
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TM7SF3-218ENST00000545344 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.01■□□□□ 0.31
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TM7SF3-218ENST00000545344 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.45■□□□□ 0.22
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TM7SF3-218ENST00000545344 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.27■□□□□ 0.19
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TM7SF3-218ENST00000545344 ADRA2BP18089 450 aa16.15■□□□□ 0.18
TM7SF3-218ENST00000545344 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.15■□□□□ 0.18
TM7SF3-218ENST00000545344 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.15■□□□□ 0.18
TM7SF3-218ENST00000545344 SMARCA4P51532 1647 aa15.95■□□□□ 0.14
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TM7SF3-218ENST00000545344 SMARCA2P51531 1590 aa15.83■□□□□ 0.13
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TM7SF3-218ENST00000545344 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.45■□□□□ 0.06
TM7SF3-218ENST00000545344 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.43■□□□□ 0.06
TM7SF3-218ENST00000545344 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.35■□□□□ 0.05
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TM7SF3-218ENST00000545344 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.24■□□□□ 0.03
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TM7SF3-218ENST00000545344 TOPBP1Q92547 1522 aa14.97□□□□□ -0.01
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TM7SF3-218ENST00000545344 ABCC8Q09428 1581 aa14.93□□□□□ -0.02
TM7SF3-218ENST00000545344 IFT140Q96RY7 1462 aa14.88□□□□□ -0.03
TM7SF3-218ENST00000545344 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TM7SF3-218ENST00000545344 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TM7SF3-218ENST00000545344 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
TM7SF3-218ENST00000545344 CUX1P39880 1505 aa14.83□□□□□ -0.04
TM7SF3-218ENST00000545344 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TM7SF3-218ENST00000545344 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.82□□□□□ -0.04
TM7SF3-218ENST00000545344 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TM7SF3-218ENST00000545344 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.8□□□□□ -0.04
TM7SF3-218ENST00000545344 SOGA1O94964 1423 aa14.77□□□□□ -0.04
TM7SF3-218ENST00000545344 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
TM7SF3-218ENST00000545344 WDR97A6NE52 1622 aa14.72□□□□□ -0.05
TM7SF3-218ENST00000545344 CHD1O14646 1710 aa14.72□□□□□ -0.05
TM7SF3-218ENST00000545344 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TM7SF3-218ENST00000545344 SYNJ1O43426 1573 aa14.71□□□□□ -0.05
TM7SF3-218ENST00000545344 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.7□□□□□ -0.06
TM7SF3-218ENST00000545344 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
TM7SF3-218ENST00000545344 TOP2BQ02880 1626 aa14.69□□□□□ -0.06
TM7SF3-218ENST00000545344 PBRM1Q86U86 1689 aa14.68□□□□□ -0.06
TM7SF3-218ENST00000545344 FBLN2P98095 1184 aa14.68□□□□□ -0.06
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TM7SF3-218ENST00000545344 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.63□□□□□ -0.07
TM7SF3-218ENST00000545344 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.61□□□□□ -0.07
TM7SF3-218ENST00000545344 GRIN2BQ13224 1484 aa14.61□□□□□ -0.07
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TM7SF3-218ENST00000545344 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.6□□□□□ -0.07
TM7SF3-218ENST00000545344 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.6□□□□□ -0.07
TM7SF3-218ENST00000545344 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TM7SF3-218ENST00000545344 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TM7SF3-218ENST00000545344 TRIM41Q8WV44 630 aa14.55□□□□□ -0.08
TM7SF3-218ENST00000545344 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.52□□□□□ -0.08
TM7SF3-218ENST00000545344 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.52□□□□□ -0.08
TM7SF3-218ENST00000545344 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.52□□□□□ -0.08
TM7SF3-218ENST00000545344 SYNJ2O15056 1496 aa14.52□□□□□ -0.08
TM7SF3-218ENST00000545344 RNF39Q9H2S5 420 aa14.5□□□□□ -0.09
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