RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544754.1

LMO3-231, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-231ENST00000544754 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.26■■■□□ 2.27
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LMO3-231ENST00000544754 ABCC9O60706 1549 aa24.62■■□□□ 1.53
LMO3-231ENST00000544754 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
LMO3-231ENST00000544754 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO3-231ENST00000544754 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.17■■□□□ 1.46
LMO3-231ENST00000544754 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.09■■□□□ 1.45
LMO3-231ENST00000544754 NACADO15069 1562 aa24.05■■□□□ 1.44
LMO3-231ENST00000544754 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO3-231ENST00000544754 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
LMO3-231ENST00000544754 SCRIBQ14160 1630 aa23.59■■□□□ 1.37
LMO3-231ENST00000544754 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.52■■□□□ 1.36
LMO3-231ENST00000544754 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.51■■□□□ 1.35
LMO3-231ENST00000544754 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO3-231ENST00000544754 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO3-231ENST00000544754 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
LMO3-231ENST00000544754 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.75■■□□□ 1.23
LMO3-231ENST00000544754 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
LMO3-231ENST00000544754 SMARCA4P51532 1647 aa22.61■■□□□ 1.21
LMO3-231ENST00000544754 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.59■■□□□ 1.21
LMO3-231ENST00000544754 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
LMO3-231ENST00000544754 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LMO3-231ENST00000544754 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LMO3-231ENST00000544754 WIZO95785 1651 aa22.41■■□□□ 1.18
LMO3-231ENST00000544754 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.36■■□□□ 1.17
LMO3-231ENST00000544754 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.31■■□□□ 1.16
LMO3-231ENST00000544754 SMARCA2P51531 1590 aa22.29■■□□□ 1.16
LMO3-231ENST00000544754 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.29■■□□□ 1.16
LMO3-231ENST00000544754 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LMO3-231ENST00000544754 NCAPD3P42695 1498 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO3-231ENST00000544754 HMGXB3Q12766 1538 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO3-231ENST00000544754 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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LMO3-231ENST00000544754 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.89■■□□□ 1.09
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LMO3-231ENST00000544754 PRDM2Q13029 1718 aa21.56■■□□□ 1.04
LMO3-231ENST00000544754 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.55■■□□□ 1.04
LMO3-231ENST00000544754 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.52■■□□□ 1.04
LMO3-231ENST00000544754 NESP48681 1621 aa21.51■■□□□ 1.03
LMO3-231ENST00000544754 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.32■■□□□ 1
LMO3-231ENST00000544754 ABCC8Q09428 1581 aa21.32■■□□□ 1
LMO3-231ENST00000544754 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.31■■□□□ 1
LMO3-231ENST00000544754 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.3■■□□□ 1
LMO3-231ENST00000544754 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.25■□□□□ 0.99
LMO3-231ENST00000544754 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
LMO3-231ENST00000544754 SYNJ1O43426 1573 aa21.18■□□□□ 0.98
LMO3-231ENST00000544754 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.15■□□□□ 0.98
LMO3-231ENST00000544754 CUX1P39880 1505 aa21.15■□□□□ 0.98
LMO3-231ENST00000544754 ERCC6Q03468 1493 aa21.14■□□□□ 0.98
LMO3-231ENST00000544754 TOP2BQ02880 1626 aa21.13■□□□□ 0.97
LMO3-231ENST00000544754 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.1■□□□□ 0.97
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LMO3-231ENST00000544754 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.08■□□□□ 0.97
LMO3-231ENST00000544754 TOPBP1Q92547 1522 aa21.08■□□□□ 0.96
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LMO3-231ENST00000544754 WDR97A6NE52 1622 aa20.83■□□□□ 0.93
LMO3-231ENST00000544754 SOGA1O94964 1423 aa20.83■□□□□ 0.93
LMO3-231ENST00000544754 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
LMO3-231ENST00000544754 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.78■□□□□ 0.92
LMO3-231ENST00000544754 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.77■□□□□ 0.92
LMO3-231ENST00000544754 IFT140Q96RY7 1462 aa20.76■□□□□ 0.91
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LMO3-231ENST00000544754 KIF27Q86VH2 1401 aa20.7■□□□□ 0.9
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LMO3-231ENST00000544754 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.69■□□□□ 0.9
LMO3-231ENST00000544754 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
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LMO3-231ENST00000544754 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.55■□□□□ 0.88
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LMO3-231ENST00000544754 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.41■□□□□ 0.86
LMO3-231ENST00000544754 GOLGA3Q08378 1498 aa20.41■□□□□ 0.86
LMO3-231ENST00000544754 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
LMO3-231ENST00000544754 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.39■□□□□ 0.85
LMO3-231ENST00000544754 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.38■□□□□ 0.85
LMO3-231ENST00000544754 SYNJ2O15056 1496 aa20.31■□□□□ 0.84
LMO3-231ENST00000544754 CHD1O14646 1710 aa20.28■□□□□ 0.84
LMO3-231ENST00000544754 GRIN2AQ12879 1464 aa20.27■□□□□ 0.84
LMO3-231ENST00000544754 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.26■□□□□ 0.83
LMO3-231ENST00000544754 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LMO3-231ENST00000544754 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.24■□□□□ 0.83
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