RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543442.1

GGTA2P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 2, pseudogene, humanhuman

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Gene GGTA2P, Length 1,125 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA2P-201ENST00000543442 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.57■■■□□ 2
GGTA2P-201ENST00000543442 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.84■■□□□ 1.57
GGTA2P-201ENST00000543442 ABCC9O60706 1549 aa24.6■■□□□ 1.53
GGTA2P-201ENST00000543442 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.56■■□□□ 1.36
GGTA2P-201ENST00000543442 NACADO15069 1562 aa23.39■■□□□ 1.33
GGTA2P-201ENST00000543442 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.19■■□□□ 1.3
GGTA2P-201ENST00000543442 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.07■■□□□ 1.28
GGTA2P-201ENST00000543442 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.05■■□□□ 1.28
GGTA2P-201ENST00000543442 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GGTA2P-201ENST00000543442 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
GGTA2P-201ENST00000543442 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.81■■□□□ 1.24
GGTA2P-201ENST00000543442 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.81■■□□□ 1.24
GGTA2P-201ENST00000543442 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.76■■□□□ 1.23
GGTA2P-201ENST00000543442 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.59■■□□□ 1.21
GGTA2P-201ENST00000543442 SCRIBQ14160 1630 aa22.57■■□□□ 1.2
GGTA2P-201ENST00000543442 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.28■■□□□ 1.16
GGTA2P-201ENST00000543442 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GGTA2P-201ENST00000543442 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.17■■□□□ 1.14
GGTA2P-201ENST00000543442 SMARCA4P51532 1647 aa21.54■■□□□ 1.04
GGTA2P-201ENST00000543442 SMARCA2P51531 1590 aa21.51■■□□□ 1.03
GGTA2P-201ENST00000543442 NCAPD3P42695 1498 aa21.51■■□□□ 1.03
GGTA2P-201ENST00000543442 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.45■■□□□ 1.03
GGTA2P-201ENST00000543442 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GGTA2P-201ENST00000543442 HMGXB3Q12766 1538 aa21.45■■□□□ 1.02
GGTA2P-201ENST00000543442 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
GGTA2P-201ENST00000543442 ERCC6Q03468 1493 aa21.32■■□□□ 1
GGTA2P-201ENST00000543442 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.31■■□□□ 1
GGTA2P-201ENST00000543442 CUX2O14529 1486 aa21.23■□□□□ 0.99
GGTA2P-201ENST00000543442 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.21■□□□□ 0.99
GGTA2P-201ENST00000543442 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
GGTA2P-201ENST00000543442 NESP48681 1621 aa21.13■□□□□ 0.97
GGTA2P-201ENST00000543442 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.11■□□□□ 0.97
GGTA2P-201ENST00000543442 WIZO95785 1651 aa21.02■□□□□ 0.96
GGTA2P-201ENST00000543442 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.99■□□□□ 0.95
GGTA2P-201ENST00000543442 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
GGTA2P-201ENST00000543442 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.97■□□□□ 0.95
GGTA2P-201ENST00000543442 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.95■□□□□ 0.94
GGTA2P-201ENST00000543442 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.85■□□□□ 0.93
GGTA2P-201ENST00000543442 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.82■□□□□ 0.92
GGTA2P-201ENST00000543442 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
GGTA2P-201ENST00000543442 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
GGTA2P-201ENST00000543442 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.77■□□□□ 0.92
GGTA2P-201ENST00000543442 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.72■□□□□ 0.91
GGTA2P-201ENST00000543442 WDR62O43379 1518 aa20.71■□□□□ 0.91
GGTA2P-201ENST00000543442 PRDM2Q13029 1718 aa20.67■□□□□ 0.9
GGTA2P-201ENST00000543442 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.66■□□□□ 0.9
GGTA2P-201ENST00000543442 CFTRP13569 1480 aa20.65■□□□□ 0.9
GGTA2P-201ENST00000543442 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.46■□□□□ 0.87
GGTA2P-201ENST00000543442 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
GGTA2P-201ENST00000543442 ABCC8Q09428 1581 aa20.3■□□□□ 0.84
GGTA2P-201ENST00000543442 IFT140Q96RY7 1462 aa20.29■□□□□ 0.84
GGTA2P-201ENST00000543442 TOPBP1Q92547 1522 aa20.28■□□□□ 0.84
GGTA2P-201ENST00000543442 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.27■□□□□ 0.84
GGTA2P-201ENST00000543442 OSCARQ8IYS5 282 aa20.2■□□□□ 0.82
GGTA2P-201ENST00000543442 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GGTA2P-201ENST00000543442 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GGTA2P-201ENST00000543442 TRIM41Q8WV44 630 aa20.16■□□□□ 0.82
GGTA2P-201ENST00000543442 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GGTA2P-201ENST00000543442 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GGTA2P-201ENST00000543442 CHD1O14646 1710 aa20.05■□□□□ 0.8
GGTA2P-201ENST00000543442 WDR97A6NE52 1622 aa20.01■□□□□ 0.79
GGTA2P-201ENST00000543442 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.01■□□□□ 0.79
GGTA2P-201ENST00000543442 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.01■□□□□ 0.79
GGTA2P-201ENST00000543442 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.01■□□□□ 0.79
GGTA2P-201ENST00000543442 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
GGTA2P-201ENST00000543442 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.97■□□□□ 0.79
GGTA2P-201ENST00000543442 SOGA1O94964 1423 aa19.96■□□□□ 0.79
GGTA2P-201ENST00000543442 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.95■□□□□ 0.78
GGTA2P-201ENST00000543442 CUX1P39880 1505 aa19.94■□□□□ 0.78
GGTA2P-201ENST00000543442 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
GGTA2P-201ENST00000543442 ARHGEF11O15085 1522 aa19.92■□□□□ 0.78
GGTA2P-201ENST00000543442 FBLN2P98095 1184 aa19.88■□□□□ 0.77
GGTA2P-201ENST00000543442 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
GGTA2P-201ENST00000543442 PBRM1Q86U86 1689 aa19.86■□□□□ 0.77
GGTA2P-201ENST00000543442 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.86■□□□□ 0.77
GGTA2P-201ENST00000543442 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
GGTA2P-201ENST00000543442 GRIN2BQ13224 1484 aa19.82■□□□□ 0.76
GGTA2P-201ENST00000543442 SYNJ1O43426 1573 aa19.81■□□□□ 0.76
GGTA2P-201ENST00000543442 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
GGTA2P-201ENST00000543442 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.76■□□□□ 0.75
GGTA2P-201ENST00000543442 SYNJ2O15056 1496 aa19.75■□□□□ 0.75
GGTA2P-201ENST00000543442 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.75■□□□□ 0.75
GGTA2P-201ENST00000543442 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.75■□□□□ 0.75
GGTA2P-201ENST00000543442 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.74■□□□□ 0.75
GGTA2P-201ENST00000543442 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.73■□□□□ 0.75
GGTA2P-201ENST00000543442 TOP2BQ02880 1626 aa19.71■□□□□ 0.75
GGTA2P-201ENST00000543442 ARAP1Q96P48 1450 aa19.71■□□□□ 0.75
GGTA2P-201ENST00000543442 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.69■□□□□ 0.74
GGTA2P-201ENST00000543442 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.69■□□□□ 0.74
GGTA2P-201ENST00000543442 ADAMTS12P58397 1594 aa19.61■□□□□ 0.73
GGTA2P-201ENST00000543442 GRIN2AQ12879 1464 aa19.56■□□□□ 0.72
GGTA2P-201ENST00000543442 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.54■□□□□ 0.72
GGTA2P-201ENST00000543442 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
GGTA2P-201ENST00000543442 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.51■□□□□ 0.71
GGTA2P-201ENST00000543442 CEP170Q5SW79 1584 aa19.49■□□□□ 0.71
GGTA2P-201ENST00000543442 NUP160Q12769 1436 aa19.46■□□□□ 0.71
GGTA2P-201ENST00000543442 SHROOM2Q13796 1616 aa19.43■□□□□ 0.7
GGTA2P-201ENST00000543442 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.37■□□□□ 0.69
GGTA2P-201ENST00000543442 CUL7Q14999 1698 aa19.35■□□□□ 0.69
GGTA2P-201ENST00000543442 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.34■□□□□ 0.69
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