RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.02■■■□□ 2.08
LMO3-218ENST00000538020 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.72■■□□□ 1.55
LMO3-218ENST00000538020 ABCC9O60706 1549 aa23.59■■□□□ 1.37
LMO3-218ENST00000538020 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LMO3-218ENST00000538020 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO3-218ENST00000538020 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.15■■□□□ 1.3
LMO3-218ENST00000538020 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.13■■□□□ 1.29
LMO3-218ENST00000538020 NACADO15069 1562 aa23.1■■□□□ 1.29
LMO3-218ENST00000538020 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.99■■□□□ 1.27
LMO3-218ENST00000538020 SCRIBQ14160 1630 aa22.57■■□□□ 1.2
LMO3-218ENST00000538020 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.45■■□□□ 1.18
LMO3-218ENST00000538020 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.44■■□□□ 1.18
LMO3-218ENST00000538020 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO3-218ENST00000538020 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
LMO3-218ENST00000538020 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO3-218ENST00000538020 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
LMO3-218ENST00000538020 SMARCA4P51532 1647 aa21.64■■□□□ 1.05
LMO3-218ENST00000538020 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
LMO3-218ENST00000538020 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.59■■□□□ 1.05
LMO3-218ENST00000538020 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LMO3-218ENST00000538020 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.43■■□□□ 1.02
LMO3-218ENST00000538020 SMARCA2P51531 1590 aa21.41■■□□□ 1.02
LMO3-218ENST00000538020 WIZO95785 1651 aa21.4■■□□□ 1.02
LMO3-218ENST00000538020 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LMO3-218ENST00000538020 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.39■■□□□ 1.01
LMO3-218ENST00000538020 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.36■■□□□ 1.01
LMO3-218ENST00000538020 NCAPD3P42695 1498 aa21.27■■□□□ 1
LMO3-218ENST00000538020 HMGXB3Q12766 1538 aa21.26■□□□□ 0.99
LMO3-218ENST00000538020 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
LMO3-218ENST00000538020 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
LMO3-218ENST00000538020 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.07■□□□□ 0.96
LMO3-218ENST00000538020 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.94■□□□□ 0.94
LMO3-218ENST00000538020 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.68■□□□□ 0.9
LMO3-218ENST00000538020 CFTRP13569 1480 aa20.68■□□□□ 0.9
LMO3-218ENST00000538020 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.66■□□□□ 0.9
LMO3-218ENST00000538020 PRDM2Q13029 1718 aa20.63■□□□□ 0.89
LMO3-218ENST00000538020 NESP48681 1621 aa20.56■□□□□ 0.88
LMO3-218ENST00000538020 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.49■□□□□ 0.87
LMO3-218ENST00000538020 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.45■□□□□ 0.86
LMO3-218ENST00000538020 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.4■□□□□ 0.86
LMO3-218ENST00000538020 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.38■□□□□ 0.85
LMO3-218ENST00000538020 ABCC8Q09428 1581 aa20.34■□□□□ 0.85
LMO3-218ENST00000538020 ERCC6Q03468 1493 aa20.34■□□□□ 0.85
LMO3-218ENST00000538020 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
LMO3-218ENST00000538020 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.28■□□□□ 0.84
LMO3-218ENST00000538020 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.24■□□□□ 0.83
LMO3-218ENST00000538020 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.24■□□□□ 0.83
LMO3-218ENST00000538020 CUX1P39880 1505 aa20.23■□□□□ 0.83
LMO3-218ENST00000538020 SYNJ1O43426 1573 aa20.23■□□□□ 0.83
LMO3-218ENST00000538020 TOP2BQ02880 1626 aa20.23■□□□□ 0.83
LMO3-218ENST00000538020 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.23■□□□□ 0.83
LMO3-218ENST00000538020 TRIM41Q8WV44 630 aa20.2■□□□□ 0.82
LMO3-218ENST00000538020 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LMO3-218ENST00000538020 TOPBP1Q92547 1522 aa20.19■□□□□ 0.82
LMO3-218ENST00000538020 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LMO3-218ENST00000538020 WDR62O43379 1518 aa20.16■□□□□ 0.82
LMO3-218ENST00000538020 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.08■□□□□ 0.81
LMO3-218ENST00000538020 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LMO3-218ENST00000538020 SOGA1O94964 1423 aa19.97■□□□□ 0.79
LMO3-218ENST00000538020 CUX2O14529 1486 aa19.94■□□□□ 0.78
LMO3-218ENST00000538020 IFT140Q96RY7 1462 aa19.94■□□□□ 0.78
LMO3-218ENST00000538020 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.93■□□□□ 0.78
LMO3-218ENST00000538020 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.93■□□□□ 0.78
LMO3-218ENST00000538020 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
LMO3-218ENST00000538020 WDR97A6NE52 1622 aa19.91■□□□□ 0.78
LMO3-218ENST00000538020 EEA1Q15075 1411 aa19.88■□□□□ 0.77
LMO3-218ENST00000538020 KIF27Q86VH2 1401 aa19.86■□□□□ 0.77
LMO3-218ENST00000538020 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.8■□□□□ 0.76
LMO3-218ENST00000538020 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.78■□□□□ 0.76
LMO3-218ENST00000538020 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
LMO3-218ENST00000538020 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.77■□□□□ 0.76
LMO3-218ENST00000538020 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
LMO3-218ENST00000538020 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
LMO3-218ENST00000538020 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
LMO3-218ENST00000538020 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
LMO3-218ENST00000538020 PBRM1Q86U86 1689 aa19.71■□□□□ 0.75
LMO3-218ENST00000538020 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.71■□□□□ 0.75
LMO3-218ENST00000538020 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.71■□□□□ 0.75
LMO3-218ENST00000538020 GRIN2BQ13224 1484 aa19.7■□□□□ 0.74
LMO3-218ENST00000538020 IGF1RP08069 1367 aa19.67■□□□□ 0.74
LMO3-218ENST00000538020 CUL7Q14999 1698 aa19.66■□□□□ 0.74
LMO3-218ENST00000538020 KIF21BO75037 1637 aa19.62■□□□□ 0.73
LMO3-218ENST00000538020 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
LMO3-218ENST00000538020 PRXQ9BXM0 1461 aa19.6■□□□□ 0.73
LMO3-218ENST00000538020 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.59■□□□□ 0.73
LMO3-218ENST00000538020 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.58■□□□□ 0.73
LMO3-218ENST00000538020 ADAMTS12P58397 1594 aa19.58■□□□□ 0.73
LMO3-218ENST00000538020 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.56■□□□□ 0.72
LMO3-218ENST00000538020 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.55■□□□□ 0.72
LMO3-218ENST00000538020 GOLGA3Q08378 1498 aa19.54■□□□□ 0.72
LMO3-218ENST00000538020 SYNJ2O15056 1496 aa19.5■□□□□ 0.71
LMO3-218ENST00000538020 GRIN2AQ12879 1464 aa19.44■□□□□ 0.7
LMO3-218ENST00000538020 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
LMO3-218ENST00000538020 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.42■□□□□ 0.7
LMO3-218ENST00000538020 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.42■□□□□ 0.7
LMO3-218ENST00000538020 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
LMO3-218ENST00000538020 CHD1O14646 1710 aa19.39■□□□□ 0.7
LMO3-218ENST00000538020 FBLN2P98095 1184 aa19.38■□□□□ 0.69
LMO3-218ENST00000538020 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.38■□□□□ 0.69
LMO3-218ENST00000538020 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.37■□□□□ 0.69
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