RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533080.5

TSPAN18-211, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN18, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-211ENST00000533080 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.2■■■■■ 5.47
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TSPAN18-211ENST00000533080 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.59■■■■■ 4.41
TSPAN18-211ENST00000533080 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.54■■■■■ 4.4
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TSPAN18-211ENST00000533080 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.41■■■■■ 4.22
TSPAN18-211ENST00000533080 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.22■■■■■ 4.19
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TSPAN18-211ENST00000533080 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.53■■■■■ 4.08
TSPAN18-211ENST00000533080 SCRIBQ14160 1630 aa40.34■■■■■ 4.05
TSPAN18-211ENST00000533080 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
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TSPAN18-211ENST00000533080 ERCC6Q03468 1493 aa38.92■■■■□ 3.82
TSPAN18-211ENST00000533080 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.69■■■■□ 3.78
TSPAN18-211ENST00000533080 SMARCA2P51531 1590 aa38.62■■■■□ 3.77
TSPAN18-211ENST00000533080 HMGXB3Q12766 1538 aa38.58■■■■□ 3.77
TSPAN18-211ENST00000533080 SMARCA4P51532 1647 aa38.47■■■■□ 3.75
TSPAN18-211ENST00000533080 NESP48681 1621 aa38.35■■■■□ 3.73
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TSPAN18-211ENST00000533080 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.14■■■■□ 3.7
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TSPAN18-211ENST00000533080 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.84■■■■□ 3.65
TSPAN18-211ENST00000533080 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.83■■■■□ 3.65
TSPAN18-211ENST00000533080 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.73■■■■□ 3.63
TSPAN18-211ENST00000533080 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.64■■■■□ 3.62
TSPAN18-211ENST00000533080 TRIM41Q8WV44 630 aa37.62■■■■□ 3.61
TSPAN18-211ENST00000533080 WDR62O43379 1518 aa37.54■■■■□ 3.6
TSPAN18-211ENST00000533080 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.39■■■■□ 3.58
TSPAN18-211ENST00000533080 WIZO95785 1651 aa37.31■■■■□ 3.56
TSPAN18-211ENST00000533080 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.26■■■■□ 3.56
TSPAN18-211ENST00000533080 OSCARQ8IYS5 282 aa37.2■■■■□ 3.55
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TSPAN18-211ENST00000533080 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
TSPAN18-211ENST00000533080 IFT140Q96RY7 1462 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPAN18-211ENST00000533080 PRDM2Q13029 1718 aa36.66■■■■□ 3.46
TSPAN18-211ENST00000533080 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
TSPAN18-211ENST00000533080 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
TSPAN18-211ENST00000533080 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
TSPAN18-211ENST00000533080 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
TSPAN18-211ENST00000533080 ABCC8Q09428 1581 aa36.5■■■■□ 3.43
TSPAN18-211ENST00000533080 ARHGEF11O15085 1522 aa36.49■■■■□ 3.43
TSPAN18-211ENST00000533080 TOPBP1Q92547 1522 aa36.48■■■■□ 3.43
TSPAN18-211ENST00000533080 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.47■■■■□ 3.43
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TSPAN18-211ENST00000533080 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.32■■■■□ 3.4
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TSPAN18-211ENST00000533080 FBLN2P98095 1184 aa36.13■■■■□ 3.37
TSPAN18-211ENST00000533080 CHD1O14646 1710 aa36.13■■■■□ 3.37
TSPAN18-211ENST00000533080 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
TSPAN18-211ENST00000533080 ARAP1Q96P48 1450 aa36.07■■■■□ 3.37
TSPAN18-211ENST00000533080 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
TSPAN18-211ENST00000533080 SOGA1O94964 1423 aa35.94■■■■□ 3.34
TSPAN18-211ENST00000533080 WDR97A6NE52 1622 aa35.9■■■■□ 3.34
TSPAN18-211ENST00000533080 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
TSPAN18-211ENST00000533080 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.89■■■■□ 3.34
TSPAN18-211ENST00000533080 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
TSPAN18-211ENST00000533080 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.81■■■■□ 3.32
TSPAN18-211ENST00000533080 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
TSPAN18-211ENST00000533080 SYNJ1O43426 1573 aa35.78■■■■□ 3.32
TSPAN18-211ENST00000533080 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.77■■■■□ 3.32
TSPAN18-211ENST00000533080 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.75■■■■□ 3.31
TSPAN18-211ENST00000533080 GRIN2BQ13224 1484 aa35.71■■■■□ 3.31
TSPAN18-211ENST00000533080 SYNJ2O15056 1496 aa35.66■■■■□ 3.3
TSPAN18-211ENST00000533080 CUX1P39880 1505 aa35.59■■■■□ 3.29
TSPAN18-211ENST00000533080 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
TSPAN18-211ENST00000533080 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.48■■■■□ 3.27
TSPAN18-211ENST00000533080 PBRM1Q86U86 1689 aa35.4■■■■□ 3.26
TSPAN18-211ENST00000533080 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.37■■■■□ 3.25
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TSPAN18-211ENST00000533080 GRIN2AQ12879 1464 aa35.22■■■■□ 3.23
TSPAN18-211ENST00000533080 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.226e-7■■■■■ 33.4
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TSPAN18-211ENST00000533080 ADAMTS12P58397 1594 aa35.08■■■■□ 3.21
TSPAN18-211ENST00000533080 CEP170Q5SW79 1584 aa35.08■■■■□ 3.21
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TSPAN18-211ENST00000533080 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.05■■■■□ 3.2
TSPAN18-211ENST00000533080 SHROOM2Q13796 1616 aa34.98■■■■□ 3.19
TSPAN18-211ENST00000533080 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.92■■■■□ 3.18
TSPAN18-211ENST00000533080 TOP2BQ02880 1626 aa34.92■■■■□ 3.18
TSPAN18-211ENST00000533080 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.89■■■■□ 3.18
TSPAN18-211ENST00000533080 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
TSPAN18-211ENST00000533080 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
TSPAN18-211ENST00000533080 JPH4Q96JJ6 628 aa34.79■■■■□ 3.16
TSPAN18-211ENST00000533080 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.75■■■■□ 3.15
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