RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529530.1

TMEM218-208, Transcript of transmembrane protein 218, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM218, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM218-208ENST00000529530 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.46■■■■■ 6.79
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TMEM218-208ENST00000529530 SCRIBQ14160 1630 aa47.01■■■■■ 5.12
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TMEM218-208ENST00000529530 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.74■■■■■ 5.07
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TMEM218-208ENST00000529530 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.01■■■■■ 4.8
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TMEM218-208ENST00000529530 ERCC6Q03468 1493 aa44.85■■■■■ 4.77
TMEM218-208ENST00000529530 SMARCA2P51531 1590 aa44.82■■■■■ 4.77
TMEM218-208ENST00000529530 SMARCA4P51532 1647 aa44.79■■■■■ 4.76
TMEM218-208ENST00000529530 CUX2O14529 1486 aa44.74■■■■■ 4.75
TMEM218-208ENST00000529530 HMGXB3Q12766 1538 aa44.71■■■■■ 4.75
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TMEM218-208ENST00000529530 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.34■■■■■ 4.69
TMEM218-208ENST00000529530 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.27■■■■■ 4.68
TMEM218-208ENST00000529530 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.09■■■■■ 4.65
TMEM218-208ENST00000529530 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.98■■■■■ 4.63
TMEM218-208ENST00000529530 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
TMEM218-208ENST00000529530 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.82■■■■■ 4.61
TMEM218-208ENST00000529530 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.73■■■■■ 4.59
TMEM218-208ENST00000529530 WIZO95785 1651 aa43.67■■■■■ 4.58
TMEM218-208ENST00000529530 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.53■■■■■ 4.56
TMEM218-208ENST00000529530 WDR62O43379 1518 aa43.35■■■■■ 4.53
TMEM218-208ENST00000529530 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
TMEM218-208ENST00000529530 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.34■■■■■ 4.53
TMEM218-208ENST00000529530 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.28■■■■■ 4.52
TMEM218-208ENST00000529530 CFTRP13569 1480 aa43.23■■■■■ 4.51
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TMEM218-208ENST00000529530 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
TMEM218-208ENST00000529530 OSCARQ8IYS5 282 aa42.84■■■■■ 4.45
TMEM218-208ENST00000529530 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.73■■■■■ 4.43
TMEM218-208ENST00000529530 PRDM2Q13029 1718 aa42.51■■■■■ 4.4
TMEM218-208ENST00000529530 IFT140Q96RY7 1462 aa42.49■■■■■ 4.39
TMEM218-208ENST00000529530 TOPBP1Q92547 1522 aa42.41■■■■■ 4.38
TMEM218-208ENST00000529530 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
TMEM218-208ENST00000529530 ABCC8Q09428 1581 aa42.37■■■■■ 4.37
TMEM218-208ENST00000529530 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.2■■■■■ 4.35
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TMEM218-208ENST00000529530 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.335e-7■■■■□ 22.1
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TMEM218-208ENST00000529530 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
TMEM218-208ENST00000529530 FBLN2P98095 1184 aa41.98■■■■■ 4.31
TMEM218-208ENST00000529530 ARHGEF11O15085 1522 aa41.97■■■■■ 4.31
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TMEM218-208ENST00000529530 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.69■■■■■ 4.26
TMEM218-208ENST00000529530 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
TMEM218-208ENST00000529530 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.59■■■■■ 4.25
TMEM218-208ENST00000529530 CUX1P39880 1505 aa41.59■■■■■ 4.25
TMEM218-208ENST00000529530 WDR97A6NE52 1622 aa41.54■■■■■ 4.24
TMEM218-208ENST00000529530 ARAP1Q96P48 1450 aa41.53■■■■■ 4.24
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TMEM218-208ENST00000529530 GRIN2BQ13224 1484 aa41.48■■■■■ 4.23
TMEM218-208ENST00000529530 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
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TMEM218-208ENST00000529530 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.32■■■■■ 4.2
TMEM218-208ENST00000529530 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.32■■■■■ 4.2
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TMEM218-208ENST00000529530 PBRM1Q86U86 1689 aa41.11■■■■■ 4.17
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TMEM218-208ENST00000529530 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.05■■■■■ 4.16
TMEM218-208ENST00000529530 GRIN2AQ12879 1464 aa40.91■■■■■ 4.14
TMEM218-208ENST00000529530 TOP2BQ02880 1626 aa40.85■■■■■ 4.13
TMEM218-208ENST00000529530 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.8■■■■■ 4.12
TMEM218-208ENST00000529530 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.8■■■■■ 4.12
TMEM218-208ENST00000529530 ADAMTS12P58397 1594 aa40.78■■■■■ 4.12
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TMEM218-208ENST00000529530 CEP170Q5SW79 1584 aa40.7■■■■■ 4.11
TMEM218-208ENST00000529530 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.68■■■■■ 4.1
TMEM218-208ENST00000529530 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.67■■■■■ 4.1
TMEM218-208ENST00000529530 JPH4Q96JJ6 628 aa40.51■■■■■ 4.08
TMEM218-208ENST00000529530 SHROOM2Q13796 1616 aa40.49■■■■■ 4.07
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TMEM218-208ENST00000529530 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.25■■■■■ 4.03
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