RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529091.5

TOR1AIP1-209, Transcript of torsin 1A interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene TOR1AIP1, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AIP1-209ENST00000529091 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.83■■■■■ 6.69
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ABCC9O60706 1549 aa51.53■■■■■ 5.84
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.04■■■■■ 5.76
TOR1AIP1-209ENST00000529091 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.82■■■■■ 5.41
TOR1AIP1-209ENST00000529091 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.62■■■■■ 5.37
TOR1AIP1-209ENST00000529091 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.43■■■■■ 5.34
TOR1AIP1-209ENST00000529091 NACADO15069 1562 aa48.39■■■■■ 5.34
TOR1AIP1-209ENST00000529091 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.01■■■■■ 5.28
TOR1AIP1-209ENST00000529091 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.67■■■■■ 5.22
TOR1AIP1-209ENST00000529091 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.54■■■■■ 5.2
TOR1AIP1-209ENST00000529091 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.36■■■■■ 5.17
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
TOR1AIP1-209ENST00000529091 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.84■■■■■ 5.09
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.63■■■■■ 5.05
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SCRIBQ14160 1630 aa46.62■■■■■ 5.05
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.46■■■■■ 5.03
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.42■■■■■ 5.02
TOR1AIP1-209ENST00000529091 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
TOR1AIP1-209ENST00000529091 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.87■■■■■ 4.77
TOR1AIP1-209ENST00000529091 NCAPD3P42695 1498 aa44.69■■■■■ 4.74
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ERCC6Q03468 1493 aa44.53■■■■■ 4.72
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.53■■■■■ 4.72
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CUX2O14529 1486 aa44.44■■■■■ 4.7
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SMARCA2P51531 1590 aa44.38■■■■■ 4.69
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SMARCA4P51532 1647 aa44.38■■■■■ 4.69
TOR1AIP1-209ENST00000529091 HMGXB3Q12766 1538 aa44.28■■■■■ 4.68
TOR1AIP1-209ENST00000529091 NESP48681 1621 aa44.15■■■■■ 4.66
TOR1AIP1-209ENST00000529091 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
TOR1AIP1-209ENST00000529091 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
TOR1AIP1-209ENST00000529091 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.88■■■■■ 4.62
TOR1AIP1-209ENST00000529091 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.8■■■■■ 4.6
TOR1AIP1-209ENST00000529091 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.72■■■■■ 4.59
TOR1AIP1-209ENST00000529091 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
TOR1AIP1-209ENST00000529091 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.56■■■■■ 4.56
TOR1AIP1-209ENST00000529091 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.52■■■■■ 4.56
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.38■■■■■ 4.53
TOR1AIP1-209ENST00000529091 WIZO95785 1651 aa43.28■■■■■ 4.52
TOR1AIP1-209ENST00000529091 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.16■■■■■ 4.5
TOR1AIP1-209ENST00000529091 WDR62O43379 1518 aa43.01■■■■■ 4.48
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.94■■■■■ 4.47
TOR1AIP1-209ENST00000529091 TRIM41Q8WV44 630 aa42.91■■■■■ 4.46
TOR1AIP1-209ENST00000529091 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.88■■■■■ 4.46
TOR1AIP1-209ENST00000529091 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CFTRP13569 1480 aa42.76■■■■■ 4.44
TOR1AIP1-209ENST00000529091 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
TOR1AIP1-209ENST00000529091 OSCARQ8IYS5 282 aa42.53■■■■■ 4.4
TOR1AIP1-209ENST00000529091 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.25■■■■■ 4.35
TOR1AIP1-209ENST00000529091 PRDM2Q13029 1718 aa42.24■■■■■ 4.35
TOR1AIP1-209ENST00000529091 IFT140Q96RY7 1462 aa42.09■■■■■ 4.33
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
TOR1AIP1-209ENST00000529091 TOPBP1Q92547 1522 aa42.01■■■■■ 4.32
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ABCC8Q09428 1581 aa41.91■■■■■ 4.3
TOR1AIP1-209ENST00000529091 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.87■■■■■ 4.29
TOR1AIP1-209ENST00000529091 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.87■■■■■ 4.29
TOR1AIP1-209ENST00000529091 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.87■■■■■ 4.29
TOR1AIP1-209ENST00000529091 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
TOR1AIP1-209ENST00000529091 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ARHGEF11O15085 1522 aa41.71■■■■■ 4.27
TOR1AIP1-209ENST00000529091 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.272e-9■■■■■ 44.8
TOR1AIP1-209ENST00000529091 FBLN2P98095 1184 aa41.64■■■■■ 4.26
TOR1AIP1-209ENST00000529091 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.6■■■■■ 4.25
TOR1AIP1-209ENST00000529091 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CHD1O14646 1710 aa41.53■■■■■ 4.24
TOR1AIP1-209ENST00000529091 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.47■■■■■ 4.23
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SOGA1O94964 1423 aa41.44■■■■■ 4.23
TOR1AIP1-209ENST00000529091 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
TOR1AIP1-209ENST00000529091 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
TOR1AIP1-209ENST00000529091 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.28■■■■■ 4.2
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ARAP1Q96P48 1450 aa41.27■■■■■ 4.2
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.21■■■■■ 4.19
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CUX1P39880 1505 aa41.16■■■■■ 4.18
TOR1AIP1-209ENST00000529091 WDR97A6NE52 1622 aa41.12■■■■■ 4.17
TOR1AIP1-209ENST00000529091 GRIN2BQ13224 1484 aa41.06■■■■■ 4.16
TOR1AIP1-209ENST00000529091 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SYNJ1O43426 1573 aa41.02■■■■■ 4.16
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CLASP1Q7Z460 1538 aa41■■■■■ 4.15
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SYNJ2O15056 1496 aa40.96■■■■■ 4.15
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
TOR1AIP1-209ENST00000529091 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.9■■■■■ 4.14
TOR1AIP1-209ENST00000529091 PBRM1Q86U86 1689 aa40.84■■■■■ 4.13
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.75■■■■■ 4.11
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.67■■■■■ 4.1
TOR1AIP1-209ENST00000529091 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.6■■■■■ 4.09
TOR1AIP1-209ENST00000529091 GRIN2AQ12879 1464 aa40.51■■■■■ 4.08
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.41■■■■■ 4.06
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ADAMTS12P58397 1594 aa40.4■■■■■ 4.06
TOR1AIP1-209ENST00000529091 TOP2BQ02880 1626 aa40.4■■■■■ 4.06
TOR1AIP1-209ENST00000529091 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.38■■■■■ 4.06
TOR1AIP1-209ENST00000529091 CEP170Q5SW79 1584 aa40.37■■■■■ 4.05
TOR1AIP1-209ENST00000529091 NUP160Q12769 1436 aa40.36■■■■■ 4.05
TOR1AIP1-209ENST00000529091 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.35■■■■■ 4.05
TOR1AIP1-209ENST00000529091 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
TOR1AIP1-209ENST00000529091 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.23■■■■■ 4.03
TOR1AIP1-209ENST00000529091 SHROOM2Q13796 1616 aa40.17■■■■■ 4.02
TOR1AIP1-209ENST00000529091 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
TOR1AIP1-209ENST00000529091 JPH4Q96JJ6 628 aa40.1■■■■■ 4.01
TOR1AIP1-209ENST00000529091 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.88■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms