RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526458.1

C9orf135-AS1-203, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.91■■■□□ 2.22
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C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.17■■□□□ 1.46
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C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.59■■□□□ 1.37
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.23■■□□□ 1.31
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C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SMARCA2P51531 1590 aa22.48■■□□□ 1.19
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C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.36■■□□□ 1.17
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C9orf135-AS1-203ENST00000526458 WIZO95785 1651 aa22.07■■□□□ 1.12
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C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PRDM2Q13029 1718 aa21.66■■□□□ 1.06
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 WDR62O43379 1518 aa21.64■■□□□ 1.05
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CFTRP13569 1480 aa21.63■■□□□ 1.05
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.63■■□□□ 1.05
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.59■■□□□ 1.05
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C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TOP2BQ02880 1626 aa20.7■□□□□ 0.9
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.7■□□□□ 0.9
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.69■□□□□ 0.9
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FBLN2P98095 1184 aa20.67■□□□□ 0.9
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.66■□□□□ 0.9
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C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SYNJ2O15056 1496 aa20.63■□□□□ 0.89
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.62■□□□□ 0.89
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ARAP1Q96P48 1450 aa20.53■□□□□ 0.88
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ADAMTS12P58397 1594 aa20.52■□□□□ 0.88
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.47■□□□□ 0.87
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C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.4■□□□□ 0.86
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CEP170Q5SW79 1584 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NUP160Q12769 1436 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SHROOM2Q13796 1616 aa20.33■□□□□ 0.84
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CUL7Q14999 1698 aa20.27■□□□□ 0.84
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.26■□□□□ 0.83
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.24■□□□□ 0.83
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KIF27Q86VH2 1401 aa20.23■□□□□ 0.83
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