RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524864.1

RPS25-201, Transcript of ribosomal protein S25, humanhuman

TSL 2

Gene RPS25, Length 1,078 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25-201ENST00000524864 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.55■■■□□ 2.96
RPS25-201ENST00000524864 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.82■■■□□ 2.36
RPS25-201ENST00000524864 ABCC9O60706 1549 aa29.45■■■□□ 2.31
RPS25-201ENST00000524864 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
RPS25-201ENST00000524864 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.22■■■□□ 2.11
RPS25-201ENST00000524864 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.21■■■□□ 2.11
RPS25-201ENST00000524864 NACADO15069 1562 aa28.15■■■□□ 2.1
RPS25-201ENST00000524864 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.93■■■□□ 2.06
RPS25-201ENST00000524864 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
RPS25-201ENST00000524864 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.73■■■□□ 2.03
RPS25-201ENST00000524864 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
RPS25-201ENST00000524864 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.49■■□□□ 1.99
RPS25-201ENST00000524864 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.37■■□□□ 1.97
RPS25-201ENST00000524864 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.32■■□□□ 1.96
RPS25-201ENST00000524864 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.31■■□□□ 1.96
RPS25-201ENST00000524864 SCRIBQ14160 1630 aa27.23■■□□□ 1.95
RPS25-201ENST00000524864 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.05■■□□□ 1.92
RPS25-201ENST00000524864 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
RPS25-201ENST00000524864 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.6■■□□□ 1.85
RPS25-201ENST00000524864 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.49■■□□□ 1.83
RPS25-201ENST00000524864 NCAPD3P42695 1498 aa26.03■■□□□ 1.76
RPS25-201ENST00000524864 SMARCA4P51532 1647 aa26.03■■□□□ 1.76
RPS25-201ENST00000524864 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26■■□□□ 1.75
RPS25-201ENST00000524864 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
RPS25-201ENST00000524864 SMARCA2P51531 1590 aa25.91■■□□□ 1.74
RPS25-201ENST00000524864 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.86■■□□□ 1.73
RPS25-201ENST00000524864 HMGXB3Q12766 1538 aa25.8■■□□□ 1.72
RPS25-201ENST00000524864 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.79■■□□□ 1.72
RPS25-201ENST00000524864 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
RPS25-201ENST00000524864 WIZO95785 1651 aa25.53■■□□□ 1.68
RPS25-201ENST00000524864 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RPS25-201ENST00000524864 NESP48681 1621 aa25.43■■□□□ 1.66
RPS25-201ENST00000524864 ERCC6Q03468 1493 aa25.39■■□□□ 1.65
RPS25-201ENST00000524864 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.3■■□□□ 1.64
RPS25-201ENST00000524864 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.27■■□□□ 1.64
RPS25-201ENST00000524864 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
RPS25-201ENST00000524864 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.2■■□□□ 1.62
RPS25-201ENST00000524864 CUX2O14529 1486 aa25.18■■□□□ 1.62
RPS25-201ENST00000524864 CFTRP13569 1480 aa25.05■■□□□ 1.6
RPS25-201ENST00000524864 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.04■■□□□ 1.6
RPS25-201ENST00000524864 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.02■■□□□ 1.6
RPS25-201ENST00000524864 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RPS25-201ENST00000524864 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.94■■□□□ 1.58
RPS25-201ENST00000524864 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.91■■□□□ 1.58
RPS25-201ENST00000524864 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
RPS25-201ENST00000524864 WDR62O43379 1518 aa24.81■■□□□ 1.56
RPS25-201ENST00000524864 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
RPS25-201ENST00000524864 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.75■■□□□ 1.55
RPS25-201ENST00000524864 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
RPS25-201ENST00000524864 PRDM2Q13029 1718 aa24.69■■□□□ 1.54
RPS25-201ENST00000524864 ABCC8Q09428 1581 aa24.52■■□□□ 1.52
RPS25-201ENST00000524864 TOPBP1Q92547 1522 aa24.51■■□□□ 1.51
RPS25-201ENST00000524864 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.43■■□□□ 1.5
RPS25-201ENST00000524864 IFT140Q96RY7 1462 aa24.41■■□□□ 1.5
RPS25-201ENST00000524864 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RPS25-201ENST00000524864 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RPS25-201ENST00000524864 CUX1P39880 1505 aa24.25■■□□□ 1.47
RPS25-201ENST00000524864 SOGA1O94964 1423 aa24.25■■□□□ 1.47
RPS25-201ENST00000524864 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RPS25-201ENST00000524864 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.22■■□□□ 1.47
RPS25-201ENST00000524864 OSCARQ8IYS5 282 aa24.21■■□□□ 1.47
RPS25-201ENST00000524864 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.2■■□□□ 1.47
RPS25-201ENST00000524864 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.464e-11■■□□□ 14.4
RPS25-201ENST00000524864 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RPS25-201ENST00000524864 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
RPS25-201ENST00000524864 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RPS25-201ENST00000524864 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
RPS25-201ENST00000524864 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
RPS25-201ENST00000524864 WDR97A6NE52 1622 aa24■■□□□ 1.43
RPS25-201ENST00000524864 FBLN2P98095 1184 aa23.97■■□□□ 1.43
RPS25-201ENST00000524864 TOP2BQ02880 1626 aa23.97■■□□□ 1.43
RPS25-201ENST00000524864 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.96■■□□□ 1.43
RPS25-201ENST00000524864 SYNJ1O43426 1573 aa23.95■■□□□ 1.43
RPS25-201ENST00000524864 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.95■■□□□ 1.42
RPS25-201ENST00000524864 GRIN2BQ13224 1484 aa23.94■■□□□ 1.42
RPS25-201ENST00000524864 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.92■■□□□ 1.42
RPS25-201ENST00000524864 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.91■■□□□ 1.42
RPS25-201ENST00000524864 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RPS25-201ENST00000524864 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
RPS25-201ENST00000524864 CHD1O14646 1710 aa23.86■■□□□ 1.41
RPS25-201ENST00000524864 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.84■■□□□ 1.41
RPS25-201ENST00000524864 TRIM41Q8WV44 630 aa23.82■■□□□ 1.4
RPS25-201ENST00000524864 SYNJ2O15056 1496 aa23.8■■□□□ 1.4
RPS25-201ENST00000524864 PBRM1Q86U86 1689 aa23.78■■□□□ 1.4
RPS25-201ENST00000524864 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.71■■□□□ 1.39
RPS25-201ENST00000524864 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.71■■□□□ 1.39
RPS25-201ENST00000524864 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.71■■□□□ 1.39
RPS25-201ENST00000524864 ARHGEF11O15085 1522 aa23.71■■□□□ 1.39
RPS25-201ENST00000524864 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.66■■□□□ 1.38
RPS25-201ENST00000524864 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.65■■□□□ 1.38
RPS25-201ENST00000524864 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.64■■□□□ 1.38
RPS25-201ENST00000524864 GRIN2AQ12879 1464 aa23.62■■□□□ 1.37
RPS25-201ENST00000524864 ADAMTS12P58397 1594 aa23.61■■□□□ 1.37
RPS25-201ENST00000524864 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.61■■□□□ 1.37
RPS25-201ENST00000524864 KIF27Q86VH2 1401 aa23.58■■□□□ 1.36
RPS25-201ENST00000524864 IGF1RP08069 1367 aa23.55■■□□□ 1.36
RPS25-201ENST00000524864 NUP160Q12769 1436 aa23.53■■□□□ 1.36
RPS25-201ENST00000524864 ARAP1Q96P48 1450 aa23.5■■□□□ 1.35
RPS25-201ENST00000524864 CEP170Q5SW79 1584 aa23.48■■□□□ 1.35
RPS25-201ENST00000524864 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.39■■□□□ 1.33
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