RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524243.5

MTSS1-217, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene MTSS1, Length 355 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-217ENST00000524243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.81■■■□□ 2.68
MTSS1-217ENST00000524243 ABCC9O60706 1549 aa29.51■■■□□ 2.32
MTSS1-217ENST00000524243 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.06■■■□□ 2.24
MTSS1-217ENST00000524243 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.25■■■□□ 2.11
MTSS1-217ENST00000524243 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.85■■■□□ 2.05
MTSS1-217ENST00000524243 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.55■■■□□ 2
MTSS1-217ENST00000524243 NACADO15069 1562 aa27.47■■□□□ 1.99
MTSS1-217ENST00000524243 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.94
MTSS1-217ENST00000524243 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.18■■□□□ 1.94
MTSS1-217ENST00000524243 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.85■■□□□ 1.89
MTSS1-217ENST00000524243 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.79■■□□□ 1.88
MTSS1-217ENST00000524243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.75■■□□□ 1.87
MTSS1-217ENST00000524243 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.64■■□□□ 1.86
MTSS1-217ENST00000524243 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.62■■□□□ 1.85
MTSS1-217ENST00000524243 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
MTSS1-217ENST00000524243 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.38■■□□□ 1.81
MTSS1-217ENST00000524243 SCRIBQ14160 1630 aa26.33■■□□□ 1.81
MTSS1-217ENST00000524243 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
MTSS1-217ENST00000524243 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.26■■□□□ 1.79
MTSS1-217ENST00000524243 CUX2O14529 1486 aa25.74■■□□□ 1.71
MTSS1-217ENST00000524243 ERCC6Q03468 1493 aa25.47■■□□□ 1.67
MTSS1-217ENST00000524243 NCAPD3P42695 1498 aa25.29■■□□□ 1.64
MTSS1-217ENST00000524243 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MTSS1-217ENST00000524243 NESP48681 1621 aa25.2■■□□□ 1.62
MTSS1-217ENST00000524243 HMGXB3Q12766 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
MTSS1-217ENST00000524243 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.14■■□□□ 1.61
MTSS1-217ENST00000524243 SMARCA4P51532 1647 aa25.08■■□□□ 1.6
MTSS1-217ENST00000524243 SMARCA2P51531 1590 aa25.06■■□□□ 1.6
MTSS1-217ENST00000524243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.06■■□□□ 1.6
MTSS1-217ENST00000524243 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.94■■□□□ 1.58
MTSS1-217ENST00000524243 TRIM41Q8WV44 630 aa24.89■■□□□ 1.58
MTSS1-217ENST00000524243 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
MTSS1-217ENST00000524243 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.84■■□□□ 1.57
MTSS1-217ENST00000524243 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
MTSS1-217ENST00000524243 WDR62O43379 1518 aa24.65■■□□□ 1.54
MTSS1-217ENST00000524243 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.63■■□□□ 1.53
MTSS1-217ENST00000524243 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.58■■□□□ 1.53
MTSS1-217ENST00000524243 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.53■■□□□ 1.52
MTSS1-217ENST00000524243 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.42■■□□□ 1.5
MTSS1-217ENST00000524243 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
MTSS1-217ENST00000524243 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
MTSS1-217ENST00000524243 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
MTSS1-217ENST00000524243 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.33■■□□□ 1.49
MTSS1-217ENST00000524243 WIZO95785 1651 aa24.29■■□□□ 1.48
MTSS1-217ENST00000524243 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.22■■□□□ 1.47
MTSS1-217ENST00000524243 OSCARQ8IYS5 282 aa24.21■■□□□ 1.47
MTSS1-217ENST00000524243 PRDM2Q13029 1718 aa24.15■■□□□ 1.46
MTSS1-217ENST00000524243 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
MTSS1-217ENST00000524243 ARHGEF11O15085 1522 aa24.1■■□□□ 1.45
MTSS1-217ENST00000524243 CFTRP13569 1480 aa24.08■■□□□ 1.45
MTSS1-217ENST00000524243 CHD1O14646 1710 aa23.95■■□□□ 1.42
MTSS1-217ENST00000524243 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
MTSS1-217ENST00000524243 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
MTSS1-217ENST00000524243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
MTSS1-217ENST00000524243 IFT140Q96RY7 1462 aa23.84■■□□□ 1.41
MTSS1-217ENST00000524243 ARAP1Q96P48 1450 aa23.82■■□□□ 1.4
MTSS1-217ENST00000524243 TOPBP1Q92547 1522 aa23.74■■□□□ 1.39
MTSS1-217ENST00000524243 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.71■■□□□ 1.39
MTSS1-217ENST00000524243 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
MTSS1-217ENST00000524243 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
MTSS1-217ENST00000524243 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
MTSS1-217ENST00000524243 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.63■■□□□ 1.37
MTSS1-217ENST00000524243 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
MTSS1-217ENST00000524243 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.54■■□□□ 1.36
MTSS1-217ENST00000524243 ABCC8Q09428 1581 aa23.53■■□□□ 1.36
MTSS1-217ENST00000524243 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.5■■□□□ 1.35
MTSS1-217ENST00000524243 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
MTSS1-217ENST00000524243 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
MTSS1-217ENST00000524243 SYNJ1O43426 1573 aa23.38■■□□□ 1.33
MTSS1-217ENST00000524243 WDR97A6NE52 1622 aa23.37■■□□□ 1.33
MTSS1-217ENST00000524243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.36■■□□□ 1.33
MTSS1-217ENST00000524243 FBLN2P98095 1184 aa23.34■■□□□ 1.33
MTSS1-217ENST00000524243 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.33■■□□□ 1.33
MTSS1-217ENST00000524243 PBRM1Q86U86 1689 aa23.28■■□□□ 1.32
MTSS1-217ENST00000524243 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
MTSS1-217ENST00000524243 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
MTSS1-217ENST00000524243 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.19■■□□□ 1.3
MTSS1-217ENST00000524243 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.19■■□□□ 1.3
MTSS1-217ENST00000524243 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.19■■□□□ 1.3
MTSS1-217ENST00000524243 SOGA1O94964 1423 aa23.18■■□□□ 1.3
MTSS1-217ENST00000524243 SYNJ2O15056 1496 aa23.17■■□□□ 1.3
MTSS1-217ENST00000524243 GRIN2BQ13224 1484 aa23.13■■□□□ 1.29
MTSS1-217ENST00000524243 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.13■■□□□ 1.29
MTSS1-217ENST00000524243 CUX1P39880 1505 aa23.1■■□□□ 1.29
MTSS1-217ENST00000524243 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
MTSS1-217ENST00000524243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.07■■□□□ 1.28
MTSS1-217ENST00000524243 SHROOM2Q13796 1616 aa22.98■■□□□ 1.27
MTSS1-217ENST00000524243 CEP170Q5SW79 1584 aa22.97■■□□□ 1.27
MTSS1-217ENST00000524243 ADAMTS12P58397 1594 aa22.92■■□□□ 1.26
MTSS1-217ENST00000524243 GRIN2AQ12879 1464 aa22.9■■□□□ 1.26
MTSS1-217ENST00000524243 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.87■■□□□ 1.25
MTSS1-217ENST00000524243 NUP160Q12769 1436 aa22.84■■□□□ 1.25
MTSS1-217ENST00000524243 DIP2BQ9P265 1576 aa22.76■■□□□ 1.23
MTSS1-217ENST00000524243 KDM6BO15054 1643 aa22.7■■□□□ 1.22
MTSS1-217ENST00000524243 TSPOAP1O95153 1857 aa22.69■■□□□ 1.22
MTSS1-217ENST00000524243 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.68■■□□□ 1.22
MTSS1-217ENST00000524243 MAPKBP1O60336 1514 aa22.67■■□□□ 1.22
MTSS1-217ENST00000524243 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.66■■□□□ 1.22
MTSS1-217ENST00000524243 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.64■■□□□ 1.22
MTSS1-217ENST00000524243 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.64■■□□□ 1.21
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