RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519982.1

IGLVI-38-201, Transcript of immunoglobulin lambda variable (I)-38 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGLVI-38, Length 385 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLVI-38-201ENST00000519982 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.95■■□□□ 1.26
IGLVI-38-201ENST00000519982 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.39■□□□□ 0.86
IGLVI-38-201ENST00000519982 ABCC9O60706 1549 aa20.32■□□□□ 0.84
IGLVI-38-201ENST00000519982 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.57■□□□□ 0.72
IGLVI-38-201ENST00000519982 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.39■□□□□ 0.69
IGLVI-38-201ENST00000519982 NACADO15069 1562 aa19.3■□□□□ 0.68
IGLVI-38-201ENST00000519982 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.06■□□□□ 0.64
IGLVI-38-201ENST00000519982 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.64
IGLVI-38-201ENST00000519982 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
IGLVI-38-201ENST00000519982 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.91■□□□□ 0.62
IGLVI-38-201ENST00000519982 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.83■□□□□ 0.6
IGLVI-38-201ENST00000519982 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.8■□□□□ 0.6
IGLVI-38-201ENST00000519982 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.72■□□□□ 0.59
IGLVI-38-201ENST00000519982 SCRIBQ14160 1630 aa18.7■□□□□ 0.58
IGLVI-38-201ENST00000519982 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.52■□□□□ 0.56
IGLVI-38-201ENST00000519982 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
IGLVI-38-201ENST00000519982 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.29■□□□□ 0.52
IGLVI-38-201ENST00000519982 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.27■□□□□ 0.52
IGLVI-38-201ENST00000519982 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.26■□□□□ 0.51
IGLVI-38-201ENST00000519982 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
IGLVI-38-201ENST00000519982 NCAPD3P42695 1498 aa17.83■□□□□ 0.45
IGLVI-38-201ENST00000519982 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.82■□□□□ 0.44
IGLVI-38-201ENST00000519982 SMARCA4P51532 1647 aa17.82■□□□□ 0.44
IGLVI-38-201ENST00000519982 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
IGLVI-38-201ENST00000519982 SMARCA2P51531 1590 aa17.79■□□□□ 0.44
IGLVI-38-201ENST00000519982 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
IGLVI-38-201ENST00000519982 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.69■□□□□ 0.42
IGLVI-38-201ENST00000519982 HMGXB3Q12766 1538 aa17.67■□□□□ 0.42
IGLVI-38-201ENST00000519982 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.59■□□□□ 0.41
IGLVI-38-201ENST00000519982 ERCC6Q03468 1493 aa17.57■□□□□ 0.4
IGLVI-38-201ENST00000519982 NESP48681 1621 aa17.48■□□□□ 0.39
IGLVI-38-201ENST00000519982 WIZO95785 1651 aa17.47■□□□□ 0.39
IGLVI-38-201ENST00000519982 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
IGLVI-38-201ENST00000519982 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.37■□□□□ 0.37
IGLVI-38-201ENST00000519982 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.37■□□□□ 0.37
IGLVI-38-201ENST00000519982 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.36■□□□□ 0.37
IGLVI-38-201ENST00000519982 CUX2O14529 1486 aa17.36■□□□□ 0.37
IGLVI-38-201ENST00000519982 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
IGLVI-38-201ENST00000519982 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.19■□□□□ 0.34
IGLVI-38-201ENST00000519982 CFTRP13569 1480 aa17.16■□□□□ 0.34
IGLVI-38-201ENST00000519982 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
IGLVI-38-201ENST00000519982 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.15■□□□□ 0.34
IGLVI-38-201ENST00000519982 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.14■□□□□ 0.33
IGLVI-38-201ENST00000519982 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.14■□□□□ 0.33
IGLVI-38-201ENST00000519982 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.14■□□□□ 0.33
IGLVI-38-201ENST00000519982 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.13■□□□□ 0.33
IGLVI-38-201ENST00000519982 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
IGLVI-38-201ENST00000519982 WDR62O43379 1518 aa17.02■□□□□ 0.32
IGLVI-38-201ENST00000519982 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
IGLVI-38-201ENST00000519982 PRDM2Q13029 1718 aa16.88■□□□□ 0.29
IGLVI-38-201ENST00000519982 ABCC8Q09428 1581 aa16.84■□□□□ 0.29
IGLVI-38-201ENST00000519982 TOPBP1Q92547 1522 aa16.81■□□□□ 0.28
IGLVI-38-201ENST00000519982 IFT140Q96RY7 1462 aa16.79■□□□□ 0.28
IGLVI-38-201ENST00000519982 OSCARQ8IYS5 282 aa16.77■□□□□ 0.28
IGLVI-38-201ENST00000519982 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.76■□□□□ 0.27
IGLVI-38-201ENST00000519982 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
IGLVI-38-201ENST00000519982 SOGA1O94964 1423 aa16.68■□□□□ 0.26
IGLVI-38-201ENST00000519982 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
IGLVI-38-201ENST00000519982 FBLN2P98095 1184 aa16.65■□□□□ 0.26
IGLVI-38-201ENST00000519982 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.65■□□□□ 0.26
IGLVI-38-201ENST00000519982 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.63■□□□□ 0.25
IGLVI-38-201ENST00000519982 TRIM41Q8WV44 630 aa16.62■□□□□ 0.25
IGLVI-38-201ENST00000519982 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
IGLVI-38-201ENST00000519982 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.61■□□□□ 0.25
IGLVI-38-201ENST00000519982 CUX1P39880 1505 aa16.6■□□□□ 0.25
IGLVI-38-201ENST00000519982 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
IGLVI-38-201ENST00000519982 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
IGLVI-38-201ENST00000519982 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
IGLVI-38-201ENST00000519982 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
IGLVI-38-201ENST00000519982 GRIN2BQ13224 1484 aa16.46■□□□□ 0.23
IGLVI-38-201ENST00000519982 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.45■□□□□ 0.22
IGLVI-38-201ENST00000519982 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.44■□□□□ 0.22
IGLVI-38-201ENST00000519982 WDR97A6NE52 1622 aa16.43■□□□□ 0.22
IGLVI-38-201ENST00000519982 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.41■□□□□ 0.22
IGLVI-38-201ENST00000519982 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
IGLVI-38-201ENST00000519982 CHD1O14646 1710 aa16.39■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 TOP2BQ02880 1626 aa16.38■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.37■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 SYNJ1O43426 1573 aa16.36■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 SYNJ2O15056 1496 aa16.35■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.34■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 ARHGEF11O15085 1522 aa16.34■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.34■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.34■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.34■□□□□ 0.21
IGLVI-38-201ENST00000519982 PBRM1Q86U86 1689 aa16.3■□□□□ 0.2
IGLVI-38-201ENST00000519982 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.3■□□□□ 0.2
IGLVI-38-201ENST00000519982 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.24■□□□□ 0.19
IGLVI-38-201ENST00000519982 GRIN2AQ12879 1464 aa16.22■□□□□ 0.19
IGLVI-38-201ENST00000519982 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.2■□□□□ 0.18
IGLVI-38-201ENST00000519982 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.2■□□□□ 0.18
IGLVI-38-201ENST00000519982 KIF27Q86VH2 1401 aa16.19■□□□□ 0.18
IGLVI-38-201ENST00000519982 ARAP1Q96P48 1450 aa16.18■□□□□ 0.18
IGLVI-38-201ENST00000519982 ADAMTS12P58397 1594 aa16.17■□□□□ 0.18
IGLVI-38-201ENST00000519982 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
IGLVI-38-201ENST00000519982 IGF1RP08069 1367 aa16.13■□□□□ 0.17
IGLVI-38-201ENST00000519982 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
IGLVI-38-201ENST00000519982 NUP160Q12769 1436 aa16.12■□□□□ 0.17
IGLVI-38-201ENST00000519982 JPH4Q96JJ6 628 aa16.11■□□□□ 0.17
IGLVI-38-201ENST00000519982 CEP170Q5SW79 1584 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms